Phylo 的 Target Atlas 将 AI 代理用于药物靶点优先级排序

Phylo 于 2026 年 9 月 29 日推出了 Target Atlas，这是一款基于公司 Biomni Lab 平台构建的代理式靶点优先级应用，提供免费公共版以及与 The Michael J. Fox Foundation 合作开发的首个针对帕金森病的特定疾病版。

Target Atlas 的工作原理

Phylo 表示，该应用可以将团队科学家数月的靶点评审证据收集工作缩短至数天。系统创建一个共享记录，将发现与其来源关联，并可在新研究出现时进行更新。AI 代理在各靶点上执行一致的分析，而科学家则决定哪些证据重要以及应赋予多少权重。团队可以调整这些权重，以查看自身标准如何改变排名。

公共版在拥有 Biomni 账户的情况下免费提供，涵盖数千个靶点‑疾病评估，通过来源关联的靶点概况和交互式 2×2 图呈现。公司称，数百个 AI 代理负责整理和合成底层证据。跨疾病的不同版本计算技能将来自数据库、论文和疾病数据集的证据转化为仪表盘和来源关联的概况，记录每项的来源、日期、覆盖范围和缺失情况。研究人员可以检查每个结果背后的证据，并使用聊天界面探索证据或编辑私人视图。

应用背后的引用证据

该公告将产品基于已发表的药物研发流失数据。它引用了 Hay 等人在 2014 年《Nature Biotechnology》上的分析，发现进入临床开发的药物项目约有十分之一获得批准；以及 Minikel 等人在 2024 年《Nature》上的研究，估计具有人类遗传支持的药物机制从 Phase 1 到获批的成功概率提升 2.6 倍。发布中指出，靶点选择是改变药物项目的最早且成本最低的环节之一，也是最昂贵的错误点之一，然而做出正确选择所需的证据分散在遗传学、表达、临床活性、安全性、可成药性、生物标志物、竞争以及文献中，并且持续变化。

The Michael J. Fox Foundation 帕金森病版

Target Atlas 的首个特定疾病应用是与基金会的 Targets to Therapies (T2T) Initiative 合作开发的帕金森病版，该计划通过社区提名、专家小组、精心策划的评分卡以及已发布的方法学，建立了透明的帕金森病靶点优先级框架。Phylo 表示，该版使该专家框架可公开探索，并将其与来源关联的分析相连接，能够随新证据出现而更新。该基础方法学由 Vaiana 等人在 2025 年的 npj Parkinson’s Disease 上发表。

根据基金会的倡议页面，T2T 于 2024 年初启动了一项针对科学界的调查，了解哪些靶点在新帕金森病治疗中具有最大潜力。评估了超过 290 个靶点，基于在未来两至三年内解决瓶颈的可行性，提名了 21 个。该倡议由三个科学核心驱动：优先级与选择、验证与工具包开发以及公共知识库。基金会资助研究团队对所选靶点进行机制验证，以期未来药物开发，并通过共享知识库免费提供所有学习成果和工具。页面列出 alpha-synuclein、GBA1 和 LRRK2 为已有临床试验疗法的靶点，并指出首次筛选轮次聚焦于具有减缓或改变疾病进程潜力的靶点。

“扩大已充分表征且可药用的靶点数量是解决难题的关键部分，” Gaia Skibinski（The Michael J. Fox Foundation for Parkinson’s Research 的副总裁兼转化治疗负责人）在发布公告中表示。她说基金会期待探索新兴 AI 工具如 Target Atlas 如何帮助研究人员将有前景的靶点推进至潜在的新帕金森病治疗。

企业版、扩展计划与可用性

Target Atlas 的企业版可通过年度许可在受管控的 Biomni 部署中使用，支持每个选定疾病超过 20,000 个靶点、专有数据集成、靶点对仪表盘以及基于 AI/ML 的评分。

Phylo 表示，计划随着时间的推移将公共版扩展至所有主要疾病，并正在寻求基金会、联盟和患者组织赞助额外的疾病版，这些版将免费向其社区发布，并在评分中体现各组织的框架。公司联合创始人兼 CEO Kexin Huang 说，T2T 合作表明，代理能够在数天内汇集并评分，需要社区数月手工处理的证据，保持其最新，并且不取代决定哪些证据重要的专家判断。Huang 表示，公司目标是将该模型推广至每一种主要疾病。

Phylo 将 Biomni Lab 描述为首个综合生物学环境，这是一个统一的工作空间，科学家们在文献研究、实验设计、生物数据分析和科学决策中与 AI 代理协作，并表示该平台已被包括中外制药和大野制药在内的生物制药公司使用。公司位于南旧金山，完成了由 Andreessen Horowitz 与 Menlo Ventures 的 Anthology Fund 共同领投的 1350 万美元种子轮融资，合作方包括 Anthropic。

Target Atlas，包括 MJFF 帕金森病版，可在 biomni.phylo.bio 上访问。研发负责人可请求企业演示，基金会和联盟可通过 contact@phylo.bio 讨论赞助疾病版本。