BioNTech和InstaDeep开发了COVID变异的早期预警检测系统

免疫治疗公司BioNTech和人工智能公司InstaDeep开发了一种新的计算方法，用于分析全球序列数据以预测SARS-CoV-2的高风险变异体。早期预警系统（EWS）使用人工智能计算的免疫逃逸和适应性指标。

检测高风险变异体

通过结合病毒刺突蛋白的结构模型和人工智能算法，该方法可以快速检测输入到SARS-CoV-2序列数据存储库中的潜在高风险变异体。它可以在一天内完成，并且公司能够通过生成和公开可用的数据来验证预测。

该系统平均在世界卫生组织（WHO）指定的变异体被上传到序列数据存储库的两个月前识别出了90%以上的变异体。对于Alpha、Beta、Gamma、Theta、Eta和Omicron变异体，EWS在同一周内检测到了它们的序列被首次上传。

新的研究表明，EWS可以在几分钟内评估新的变异体，并且可以完全扩展以适应新的变异体数据的发布。

BioNTech和InstaDeep

乌尔·萨欣（Ugur Sahin）博士是BioNTech的首席执行官和联合创始人。

“利用我们过去几个月开发的先进计算方法，我们可以分析刺突蛋白的序列信息，并根据预测的免疫逃逸和ACE2结合得分对新的变异体进行排名，”萨欣说。“早期标记潜在的高风险变异体可以成为一种有效的工具，用于提醒研究人员、疫苗开发人员、卫生当局和政策制定者，从而为应对新的变异体提供更多时间。”

卡里姆·贝吉尔（Karim Beguir）是InstaDeep的联合创始人和首席执行官。

“每周都有超过10,000个新的变异体序列被发现，人类专家根本无法处理如此规模的复杂数据。我们通过部署InstaDeep的DeepChain平台的强大人工智能能力，结合BioNTech的SARS-CoV-2专业知识和技术，解决了这一挑战。首次，有可能实时检测高风险变异体，可能节省了几个月的宝贵时间。我们很高兴能够公开我们的研究成果，并且期待其持续的现实影响，”贝吉尔说。

在11个月的时间里，EWS能够区分WHO指定的变异体和未指定的变异体。

新开发的系统是在BioNTech和InstaDeep继续合作将人工智能和免疫学结合起来的背景下出现的，这两家公司自2020年11月以来一直在合作。两家公司在英国伦敦和德国美因茨建立了一个联合的人工智能创新实验室。该实验室旨在推进新型药物发现和设计、蛋白质工程、制造和供应链优化。