Нівен Нарейн, генеральний директор і президент BERG Health – Серія інтерв’ю

Нівен Нарейн – генеральний директор і президент BERG Health, клінічної стадії, компанії біотехнологій, що використовує штучний інтелект, яка приймає сміливий підхід «Назад до біології^™» до охорони здоров’я. Використовуючи власну платформу інтелекту – Interrogative Biology^®, мета полягає в тому, щоб створити карту захворювання і революціонізувати лікування для пацієнтів усього світу.

Ви один із співзасновників BERG Health. Що спонукало вас створити стартап, який поєднує штучний інтелект з біотехнологіями?

Справді, моя надихає і бачення прийшли від розчарування методичного, передбачуваного і довгого, дорогого процесу розробки ліків, який триває 12-14 років і коштує понад 2,6 мільярда доларів, щоб просунути лікування до ринку. Крім того, Берґ хотів видалити упередженість з процесу і визначити шлях, який буде орієнтований на пацієнта. Наш підхід поєднує дані пацієнта, які були глибоко проаналізовані для повних шарів біології, з баєсовською системою штучного інтелекту, щоб направити всі дані пацієнта і, в результаті, створити гіпотези.

Які захворювання або види раку зараз націлені?

Ми зараз націлені на захворювання в галузі онкології, нейрології та рідкісних захворювань, включаючи:

• Імунологію/запальні захворювання (ЛУПУС)
• Серцево-судинні та метаболічні захворювання (цукровий діабет, НАШ/НАФЛД)
• Нейрологічні захворювання (хвороба Паркінсона, хвороба Альцгеймера та розлади спектру аутизму)
• Рідкісні захворювання (епідермоліз булозний)
• Багатьох видів раку (гліобластома, панкреатичний, рак молочної залози, рак простати та інші агресивні види раку)

BERG Health використовує свою власну платформу Interrogative Biology^®, щоб створити карту захворювань і варіантів лікування. Чи можете ви розповісти про те, що саме таке Interrogative Biology^®?

Платформа охоплює процес, у якому будується модель захворювання на основі біологічних зразків людини (що робить її актуальною для захворювань людини, а не моделей тварин). Модель захворювання піддається комплексному молекулярному аналізу (дефрагментація геноміки, транскриптоміки, протеоміки, ліпідоміки, метаболоміки) для генерації трильйонів молекулярних даних. Ці дані інтегруються з індивідуальною інформацією пацієнта (клінічною та реальною інформацією) за допомогою баєсовської системи штучного інтелекту Берґа, щоб створити молекулярні карти захворювань, які порівнюються з контрольними групами здорових людей, щоб визначити нову біологію захворювання. Вихідні дані потім піддаються суворим лабораторним методам валідации для функціональних моделей захворювання та КРІСПР.

Чи можете ви розповісти про те, як BERG Health залучає інновації?

BERG співпрацює з академічними та клінічними/медичними установами для створення біобанків високоякісних, клінічно-анотованих біологічних зразків для програм, пов’язаних із захворюваннями. Берґ створив команду внутрішніх експертів, які спеціалізуються на деяких з цих можливостей. Команда також співпрацює з групами з конкретними знаннями для додаткових профілів даних, наприклад геномних і транскриптомних профілів, які генеруються з допомогою співробітників. Ми співпрацюємо з провідними клінічними/медичними установами та державними/федеральними агентствами, включаючи Міністерство оборони США та Міністерство енергетики США, яке фінансує Національну лабораторію Ок-Рідж (ORNL), серед інших. Ми бачили на власні очі важливість співпраці та її роль у генерації високоякісних даних, підтверджених медичною історією пацієнта та реальними даними, які є важливим кроком для інтеграції до біологічних моделей. Академічні співпраці є важливими для лабораторної валідации виходних даних платформи для генерації нової наукової основи конкретних молекулярних знань, визначених платформою. Берґ також залучає висновки та відгуки від ключових осіб на початку створення моделей штучного інтелекту та використовує ці співпраці для незалежної валідации виходних даних платформи.

Чи можете ви розповісти про те, як штучний інтелект використовується для відкриття елементів, які спонукають захворювання або рак?

Баєсівський штучний інтелект Берґа використовує внутрішньо створені/кураторські дані для де-ново відкриття захворювань – специфічних спускових механізмів – визначення цілей для лікування, біомаркерів для діагностики, стадії/стратифікації, супутніх діагностик для реакції/виводу та довгострокової молекулярної карти для генерації відбитків реакції та несприятливих подій. Штучний інтелект порівнює моделі захворювання та популяції здорових людей, а «дельта» мережа витягує спускові точки захворювання.

Які способи штучний інтелект допомагає знаходити біомаркери у пацієнтів, які не реагують на певні терапії або вакцини?

Отримуючи повну розповідь про біологію пацієнта через мультиомічний аналіз та застосовуючи баєсівську каузальну інференцію з довгострокових зразків пацієнта, Берґ може ідентифікувати каузальні сигнали реакції на відомі терапії, можливості перепрофілактики та сигнатури молекулярних сутностей, які впливають на результати здоров’я. Мультиомічний аналіз далеко виходить за межі генома та дозволяє ідентифікувати циркулюючі фактори, які впливають на результати здоров’я.

Які поточні препарати зараз у вашій трубопровідній системі?

BERG має кілька програм у клінічному та доклінічному розвитку, з найбільш зрілими активами в онкології та нейрологічних захворюваннях.

• У онкології BPM 31510-IV – новий малий молекулярний препарат, який націлений на метаболізм ракових клітин, успішно завершив фазу 1 (безпека/терпимість) у твердих пухлинах та пухлинах мозку (гліобластома). BPM 31510-IV фаза 2 (ефективність, панкреатичний рак). Цей препарат зараз знаходиться у клінічному розвитку для гліобластоми (фаза 2/3) та фази 3 панкреатичного раку.
• BPM 31510-Топікальний – успішне завершення фази 1 у епідермолізі булозному (рідкісне захворювання/орфанське позначення), планування клінічного розвитку фази 2/3.
• BPM 31510-Оральний – успішне завершення фази 1 оральної у здорових добровольцях, на ранній стадії планування клінічного розвитку фази 2 для онкологічних/неонкологічних показань.
• BPM 31543 – малий молекулярний препарат для профілактики хіміотерапевтично-індукованої алопеції. Безпека та терпимість з початковим сигналом ефективності встановлені у клінічному дослідженні фази 1. Цей актив зараз знаходиться у плануванні клінічного розвитку фази 2/3.
• BPM 42522 – перший у своєму класі малий молекулярний препарат, який націлений на нову мішень платформи Берґа, ідентифіковану у шляху убіквітин-プロтеасоми. Дослідження для першого введення у людей (FIH) у онкології у першому кварталі фінансового року 2021.
• Нова мішень, ідентифікована для хвороби Паркінсона, зараз знаходиться на стадії відкриття препарату.

BERG Health недавно уклала партнерство з Національною лабораторією Ок-Рідж Міністерства енергетики США. Чи можете ви розповісти про те, що це партнерство передбачає?

Платформа Берґа має можливість генерувати список потенційних цілей для втручання у захворювання. Суперкомп’ютер Summit у Національній лабораторії Ок-Рідж має можливості для аналізу комплексних молекулярних структур цих цілей та ідентифікації малих молекул, подібних до ліків, які можуть бути використані для швидкої валідации цілей, що веде до скорочення часу валідации/відкриття ліків для нових терапевтичних засобів. Можливості обчислювальних можливостей Summit скорочують процес відкриття ліків з декількох місяців/років до декількох годин/днів для генерації початкових високоякісних «хітів» молекул, подібних до ліків. Партнерство Берґ-ORNL забезпечує основу для швидкої ідентифікації нових захворювань-специфічних цілей та асоційованого процесу відкриття ліків. Воно також дозволяє безперервну генерацію захворювання-специфічних продукційних трубопроводів, готових до клінічного розвитку. Основний вплив цього партнерства полягає у скороченні часу/вартості відкриття та розробки нових ліків.

COVID-19, очевидно, на умах усіх. Як BERG Health допомагає у цих зусиллях?

Платформа Берґа, що використовує штучний інтелект, Interrogative Biology, була використана для генерації моделі COVID-19, що призвело до ідентифікації декількох відомих та нових цілей з потенціалом впливу на перебіг інфекції та можливістю перепрофілактики затверджених ліків для мінімізації/зміни клінічних результатів. За допомогою нашого активного партнерства з ORNL ми зараз займаємося відкриттям та розробкою малих молекул проти нових цілей для потенційного лікування COVID-19.

Дякуємо за інтерв’ю. Читачам, які бажають дізнатися більше, слід відвідати BERG Health.