Інтерв’ю
Джон Білер, Ph.D., СВП з розвитку бізнесу, BPGbio – Серія інтерв’ю
Джон Білер, Ph.D., СВП з розвитку бізнесу в BPGbio, має понад два десятиліття досвіду в біотехнологіях та розвитку бізнесу, з великим досвідом у сфері нових терапевтичних засобів. До того, як приєднатися до BPGbio, він最近 служив керівником відділу пошуку та оцінки бізнес-розробки в Bristol-Myers Squibb, де він грав ключову роль у пошуку та оцінці ліцензійних можливостей та стратегічних партнерств.
BPGbio є лідером серед біологічних компаній, що використовують штучний інтелект на клінічній стадії, зосереджуючись на мітохондріальній біології та протеїновій гомеостазі. Компанія має глибокий портфель терапевтичних засобів, розроблених за допомогою штучного інтелекту, що охоплюють онкологію, рідкі захворювання та нейрологію, включаючи кілька засобів у пізніх клінічних випробуваннях. Новаторський підхід компанії ґрунтується на її власній платформі Interrogative Biology, захищеній понад 400 патентами США та міжнародними патентами; однієї з найбільших у світі клінічно анотованих біобанків з довгостроковими зразками; та ексклюзивному доступі до найпотужнішого суперкомп’ютера у світі.
Що надихнуло створення платформи NAi Interrogative Biology®, і як вона відрізняє BPGbio від інших біофармацевтичних компаній, що використовують штучний інтелект?
Від часу приєднання до BPGbio, я постійно вражаюсь глибиною інновацій та довгострокової візії, які були вкладені у створення платформи NAi Interrogative Biology®. Як людина, яка провела два десятиліття в біотехнологіях та розвитку бізнесу – оцінюючи широкий спектр платформ та компаній – я можу сказати, що NAi виділяється завдяки своїй біологічній основі та глибині даних, яку вона аналізує.
BPGbio була однією з перших, хто почав використовувати штучний інтелект для відкриття ліків. За останні 15 років команда вдосконалила NAi до платформи, що інтегрує власні мультиомічні дані та один з найбільших у світі довгострокових біобанків. На відміну від інших компаній, які покладаються на вузькі технології або публічні набори даних для програми відкриття ліків для одного захворювання, ми інтегруємо мультиомічні можливості з нашим власним біобанком, який містить сотні тисяч довгострокових клінічно анотованих зразків, та використовуємо каузальні баєсівські моделі штучного інтелекту, а не генеративні моделі, щоб відкрити біологічні інсайти, які можуть інформувати практично будь-яку стадію відкриття ліків та збільшити ймовірність успіху клінічних випробувань. Ми не просто ідентифікуємо цілі; ми використовуємо штучний інтелект для розробки наших клінічних випробувань, розуміння результатів наших клінічних випробувань та вдосконалення наших підходів до лікування.
Наші результати говорять самі за себе: у нас один з найбільш просунутих та надійних клінічних портфелів у галузі біотехнологій, що використовують штучний інтелект. Цей портфель включає два активні клінічні випробування фази 2 при агресивних пухлинах, кілька програм, готових до фази 3, та понад сто нових цілей та біомаркерів, які ми ідентифікували за допомогою наших моделей штучного інтелекту.
Можете розказати, як біологічний підхід BPGbio прискорює та знижує ризик процесу відкриття ліків?
Розробка ліків має приблизно десять відсотків успішності для схвалення FDA, що відображає суттєві ризики та виклики, пов’язані з виведенням нового ліку на ринок. Тому не важливо, як швидко та скільки цілей ви відкриєте; важливо, яка це за якість.
Хоча штучний інтелект може допомогти прискорити процес відкриття, застосування штучного інтелекту, особливо генеративного штучного інтелекту, до тих самих публічних наборів даних, які використовуються у традиційному процесі відкриття ліків, не обов’язково змінить результати клінічних випробувань, що в кінцевому підсумку є єдиним, що має значення.
Наш біологічний підхід гарантує якість, глибину, точність, повноту та кількість даних, які подаються до наших моделей штучного інтелекту. У нашому мультиомічному аналізі ми йдемо далеко за межі аналізу РНК та ДНК. Окрім геноміки та транскриптоміки, наші вчені профільовані протеоміки, ліпідоміки та метаболоміки на всіх рівнях людської біології – орган, тканина, клітина та органели – та ми подаємо величезні необмежені мультиомічні дані до наших каузальних моделей штучного інтелекту для отримання нових інсайтів.
Цей широкий, штучний підхід дозволяє нам дивитися за межі області захворювання, щоб знайти “кореневу причину” швидше. Після того, як штучний інтелект допомагає знайти “кореневу причину”, та до того, як ми перейдемо до клінічних випробувань, ми повертаємося до вологого лабораторію, щоб перевірити, чи інсайти штучного інтелекту точні. Зосередження на людській біології допомагає нам прискорити та знижувати ризик нашого процесу відкриття та розробки.
Цей закритий підхід зменшує невизначеність та в кінцевому підсумку знижує ризик процесу розробки. З моєї точки зору у сфері розвитку бізнесу це є ключем до будівництва довіри з потенційними партнерами – оскільки наш підхід покращує ймовірність успіху з самого початку.
Як інтеграція штучного інтелекту з найшвидшим у світі суперкомп’ютером Frontier підвищує вашу здатність аналізувати дані пацієнтів та ідентифікувати цілі для ліків?
Через партнерство з Міністерством енергетики США, ми маємо ексклюзивний доступ до суперкомп’ютера Frontier в Національній лабораторії Ок-Рідж для аналізу даних щодо розробки ліків. Цей суперкомп’ютер може виконувати 1,35 квінтильйона обчислень за секунду.
Ця обчислювальна потужність дозволяє нам використовувати наш величезний набір даних для ідентифікації закономірностей, кореляцій, каузальних зв’язків та дієвých інсайтів, які інакше залишилися б приховані в менших аналізах та зменшити час, необхідний з місяців до годин.
Наприклад, під час COVID, ми проаналізували електронні медичні записи (EMR) 280 000 пацієнтів разом з їх клінічною інформацією. Ми ідентифікували генетичні ризикові фактори для конкретних етнічних груп, проклавши шлях до персоналізованої медицини. Ми проаналізували 1,2 млрд різних матеріалів, щоб відкрити потенційні методи лікування COVID за кілька годин.
З комерційної точки зору, ця обчислювальна потужність дозволяє нам розкрити інсайти швидше та більш ефективно, ніж інші, прискорюючи час до партнерства, клінічних випробувань та, в кінцевому підсумку, користі для пацієнтів.
BPGbio має клінічні програми щодо гліобластоми та панкреатичного раку. Які унікальні інсайти платформа NAi відкрила в цих областях, і як вони сформували ваші клінічні випробування?
BPGbio активно проводить клінічне випробування фази 2b щодо гліобластоми (ГБМ) та завершила клінічне випробування фази 2a для панкреатичного раку, обидва випробування з нашим кандидатом на малий молекулярний препарат BPM31510.
Через платформу NAi, ми зрозуміли, що більшість агресивних твердих пухлин спричинені мітохондріальною дисфункцією в середовищі пухлини. BPM31510 є нанодисперсією з антираковими ефектами, опосередкованими молекулярними механізмами в мітохондріях, які сприяють процесу регульованої смерті ракових клітин. Ми провели відкрите клінічне випробування фази 1 на BPM31510, і результати клінічних випробувань підтвердили інсайти, які NAi відкрила. NAi згодом допомогла нам оптимізувати практично кожний аспект цих терапій, від оптимальної дозування та часу до відбору пацієнтів. Наше клінічне випробування щодо гліобластоми зараз набирає учасників, і ми очікуємо опублікувати результати клінічного випробування фази 2 щодо гліобластоми пізніше цього року.
Рідкі захворювання, такі як первинна дефіцитність CoQ10 та епідермоліз булозний, є ключовим напрямком для BPGbio. Які виклики та можливості ви бачите у вирішенні цих захворювань?
Рідкі захворювання в дитячому віці часто缺ують ефективні варіанти лікування через їхню складність та низьку поширеність, і діти з цими захворюваннями зазвичай мають коротку тривалість життя. Це представляє виклики для набору учасників до клінічних випробувань, навігації регуляторних вимог та розробки терапевтичних засобів.
В BPGbio, ми гордо приймаємо ці складні виклики. Наш головний препарат, BPM31510, отримав кілька позначень від FDA, включаючи позначення орфанного препарату та рідкого захворювання у дітей, для первинної дефіцитності CoQ10 та епідермолізу булозного (EB). Це важливі віхи, які відображають клінічний потенціал наших програм та відкривають двері до ваучерів пріоритетного огляду після схвалення.
Ми плануємо клінічне випробування фази 3 для первинної дефіцитності CoQ10 та активно досліджуємо партнерства для просування нашої програми щодо епідермолізу булозного. Це включає оцінку топічних формулів як варіантів лікування. Ми вважаємо, що платформа BPGbio може мати трансформаційний вплив у цій сфері.
Баєсівський штучний інтелект відіграє значну роль у вашій платформі. Як він конкретно допомагає у відкритті нових цілей для ліків або біомаркерів?
Баєсівський штучний інтелект дозволяє нашій платформі рухатися за межі ідентифікації асоціацій до відкриття каузальних зв’язків, які сприяють захворювань. Він моделює невизначеність, враховує варіативність даних та генерує надзвичайно надійні прогнози, які спрямовують відкриття терапевтичних засобів та біомаркерів.
Інтегруючи довгострокові мультиомічні та клінічні дані, наші моделі можуть ідентифікувати біологічні механізми, що стоять за прогресуванням захворювання та оптимальними точками втручання. Це робить процес відкриття більш точним та подальшу розробку більш передбачуваною.
З стратегічної точки зору, це надзвичайно цінно. Верифікація того, яку ціль слід вибрати та чому вона має біологічне значення, змінює те, як ви пріоритезуєте програми, проектуєте клінічні випробування та спілкуєтеся з партнерами. Це будує довіру до науки.
Ваша робота щодо ферментів E2 для цілевої деградації білків є новаторською. Як платформа NAi подолала традиційні виклики у націленні на “нецільові” білки?
Програма BPGbio щодо цілевої деградації білків на основі ферментів E2 є однією з найбільш цікавих та інноваційних напрямків нашого портфелю. Традиційні підходи до цілевої деградації білків покладаються на лігази E3, які обмежують обсяг цілей та можуть привести до резистентності до ліків. Наш підхід використовує пост-трансляційні модифіковані комплекси ферментів E2 – відкриті платформою NAi – для розширення сфери дії білків.
Це є перший у своєму роді підхід, і ранній успіх, який ми бачимо, привернув увагу по всьому фармацевтичному та біотехнологічному секторам. Ми зараз застосовуємо цей підхід до онкології, нейрології та рідких захворювань. Це є чудовим прикладом того, як NAi не тільки підтримує відкриття – вона дозволяє нам переосмислити те, що можливе у розробці ліків.
Як BPGbio балансує інсайти, отримані за допомогою штучного інтелекту, з людським наглядом, щоб забезпечити валідність ваших відкриттів?
В BPGbio, ми бачимо штучний інтелект як потужний інструмент, але не заміну людській експертизі. Наші інсайти, отримані за допомогою штучного інтелекту, ґрунтуються на високоякісних біологічних даних та продовжуються валідуються нашими командами біологів, клініцистів та вчених-даних.
Ця співпраця гарантує, що кожен інсайт розміщується у біологічному та клінічному контексті. Це одна з причин, чому BPGbio досягла такого високого рівня успіху у клінічних випробуваннях – ми поєднуємо швидкість та масштаб штучного інтелекту з науковою суворістю та судженням, яке можуть забезпечити лише досвідчені експерти.
Який потенціал ви бачите для біомаркерів, відкритих за допомогою штучного інтелекту, для революціонізування ранньої діагностики захворювань, таких як хвороба Паркінсона?
Потенціал нашої платформи полягає в її здатності глибоко та широко аналізувати біологію, тому коли NAi відкриває ціль для терапевтичних цілей, вона часто може бути використана діагностично також.
У хворобі Паркінсона, ми побудували системи біології за допомогою зразків пацієнтів майже 400 осіб від Інституту Паркінсона, та ідентифікували N-ацетилпутресцин (NAP) як новий біомаркер у крові. Ми валідували його за допомогою сертифікованої діагностичної панелі CLIA, та наша опублікована робота показала, що коли його поєднують з клінічними ознаками, такими як втрату нюху та порушення сну REM, панель значно покращує діагностичну точність та ранню оцінку ризику. Це має потенціал для раннього втручання та покращення результатів для пацієнтів.
Яку роль ви бачите для BPGbio у формуванні майбутнього персоналізованої медицини?
Не існує універсального підходу до лікування пацієнтів. Біологічний штучний інтелект має потенціал трансформувати персоналізовану медицину шляхом відкриття нових інсайтів, які допоможуть підтипізувати пацієнтів, покращуючи проектування клінічних випробувань, стратифікацію пацієнтів та успішність терапевтичних засобів. Ці інсайти призведуть до більш ефективної розробки діагностичних засобів та лікування для ряду рідких та складних захворювань.
Відповідно до вимог завдання, переклад здійснено точно та зберіг структуру оригінального тексту.
