Нахід Курджі, співзасновник, президент і генеральний директор Cyclica – Інтерв’ю

Нахід Курджі – президент і генеральний директор Cyclica, торонтської біотехнологічної компанії, яка використовує штучний інтелект і комп’ютерну біофізику для зміни процесу відкриття ліків. Cyclica надає фармацевтичній промисловості інтегровану, цілісну та повну платформу, яка покращує спосіб, яким вчені проектують, відбирають і персоналізують ліки для пацієнтів, і була недавно названа компанією Deep Knowledge Analytics одним з 20 найкращих компаній AI в фармацевтиці у світі

Cyclica використовує штучний інтелект і комп’ютерну біофізику для зміни процесу відкриття ліків. Чи можете ви обговорити, яким чином штучний інтелект використовується в цьому процесі?

Технології відігравали критичну роль у відкритті ліків починаючи з 80-х років. Однак процес відкриття і розробки ліків все ще дуже неефективний, тривалий і дорогий, що коштує понад 2 мільярди доларів за 12 років. Погана ефективність часто призводить до високих рівнів атриції і невдач у досягненні цілей безпеки і ефективності ліків. Дослідники знають про це і активно шукають інструменти для цілісного розуміння якостей, які визначають найкращі ліки, щоб розробити безпечніші і більш ефективні ліки

Недавні досягнення в області хмарних обчислень, штучного інтелекту і біофізики створили можливість отримати глибокі знання з великої кількості біохімічних, біологічних, медичних і пацієнтських даних, щоб краще зрозуміти захворювання. Ці досягнення також дозволили медичним хімікам покращити проектування нових терапевтичних засобів і використовувати штучний інтелект для отримання більшої передбачуваності на ранніх стадіях процесу розробки ліків. У Cyclica ми розробили власні двигуни глибокого навчання, MatchMaker і POEM, для підтримки процесу проектування ліків. MatchMaker передбачає, як хімічні сполуки і ліки взаємодіють з декількома білками, що відомо як полифармакологія. Ми виявили, що поєднання знань і структурованих підходів дало найбільшу передбачуваність і продуктивність. POEM (Парето-оптимальне вкладене моделювання) – це параметр-free підхід до моделювання властивостей ліків і вирішує декілька обмежень інших підходів машинного навчання, що призводить до меншої надмірної адаптації і підвищеної інтерпретації.

У Cyclica ми використовуємо штучний інтелект, щоб надати вченим міцну і перевірену платформу для прискорення прийняття рішень і генерації гіпотез, щоб підвищити загальну ефективність процесу відкриття ліків і зменшити кількість невдач на пізніх стадіях.

Cyclica розробила платформу Ligand Design і Ligand Express, що це саме?

Ми перша компанія, яка підходить до комп’ютерної полифармакології (оцінка того, що ліки взаємодіють з декількома мішенями) з інтегрованою платформою відкриття ліків, яка опитує молекулярні взаємодії в масштабі протеоми. Наша платформа складається з двох ключових складових, Ligand Express, нашої першої генерації платформи профайлінгу і деконволюції мішені, і Ligand Design, нашої наступної генерації технології проектування ліків в silico. Ligand Express і Ligand Design працюють на двох внутрішніх двигунах машинного навчання і глибокого навчання: MatchMaker і POEM. MatchMaker – це двигун глибокого навчання, який узагальнює взаємодію ліків і мішені для даних-багатих і даних-бідних мішеней. POEM – це технологія машинного навчання, яка реалізована для передбачення властивостей ADME, це новий параметр-free підхід до моделювання.

Усі ці складові разом дозволяють Ligand Design і Ligand Express пропонувати потужну кінцеву платформу відкриття ліків, яка проектує передові, хімічно нові молекули, які одночасно пріоритезують сполуки на основі їх поліфармакологічного профілю, ефективно мінімізуючи нежелані ефекти. Наша відрізняюча платформа відкриває нові можливості для відкриття ліків, включаючи багатомишеневе і багатокритеріальне проектування ліків, оптимізацію лідів, передбачення властивостей ADME, деконволюцію мішені і перепрофілактику ліків. Підтримувана різноманітною і висококваліфікованою командою з глибоким знанням машинного навчання, комп’ютерної біофізики/хімії/біології, біохімії і медичної хімії, ми продовжимо інновувати через нашу міцну трубопровідну систему досліджень і розробок.

Як важливо децентралізувати відкриття ліків для бізнес-моделі Cyclica?

Наша візія – децентралізувати відкриття кращих ліків, поєднуючи наші глибокі корені в штучному інтелекті і білковій біофізиці з інноваційною бізнес-моделлю. І в самому серці етосу Cyclica лежить тверде бажання допомогти пацієнтам, просунувши відкриття і розробку кращих ліків, приймаючи цілісний і персоналізований підхід.

З цієї точки зору ми вважаємо, що майбутнє відкриття ліків знаходиться в руках інноваційних дослідницьких інститутів і біотехнологічних компаній (ми написали про це в Forbes тут). Підтримуючи нашу філософію, в 2019 році IQIVIA повідомила, що біотехнологічні компанії становлять понад 70% загальної трубопровідної системи досліджень і розробок (у порівнянні з 50% у 2003 році), і що ці компанії запатентували понад 2/3 нових ліків у 2018 році (у порівнянні з 50% у 2010 році). Хоча біотехнологічні компанії будуть лідерами інновацій у відкритті ліків, велика фармацевтика продовжить інвестувати в просування пізніх клінічних досліджень і проникнення на ринок через свої канали продажів.

З нашим фінансуванням серії B ми прискоримо комерційні плани просування зростаючої трубопровідної системи препринклінічних і клінічних активів через інноваційну децентралізовану партнерську модель. Наша мета – створити і володіти сотнями програм відкриття ліків у декількох терапевтичних областях. Ці програми створюються через спін-аути і спільні підприємства (СП) з топовими дослідницькими інститутами, які здійснюються в основному через програму академічного партнерства Cyclica (CAPP).

Підштовхнуті швидко зростаючою портфелем понад 30 активних і просунутих програм відкриття ліків, ми продовжимо спонукати інновації через поєднання створення підприємства і партнерства з ранніми біотехнологічними компаніями. Недавні партнерства включають EntheogeniX Biosciences, NineteenGale Therapeutics, Rosetta Therapeutics, прискорювач ліків проти рідкісних захворювань, і два спільні підприємства, які охоплюють понад 50 програм у декількох терапевтичних областях. Виконуючи нашу децентралізовану бізнес-модель, створюючи нові компанії через спін-аути і спільні підприємства, і допомагаючи їм зростати, ми фактично створюємо біотехнологічну трубопровідну систему майбутнього.

Чому ваші технології часто засновані на хмарі?

Доступ до хмарних обчислень дозволяє нам масштабувати обчислювальні потоки, які ми проводимо, а також користуватися регулюваною безпекою інфраструктури. Крім того, як компанія на ранній стадії, можливість швидко запустити хмарні обчислення без витрат на власне обладнання була критичною для фінансової життєздатності на наших ранніх етапах. Оглядаючи майбутнє, хоча більша частина наших досліджень і розробок проводиться на хмарі, за останні пару років ми стали менш залежними від хмарних обчислень, з можливістю запускати проекти на окремих машинах. Ми також плануємо підтримувати приватні хмарні установки, оскільки це те, чого можуть бажати наші партнери. Технологічні досягнення зробили можливим виконання на особистому ноутбуці того, що раніше потребувало багатьох машин на хмарі, але продовжуючи використовувати хмарні обчислення, ми можемо значно розширити масштаб проблем, які ми вирішуємо.

Cyclica часто займає позиції в компаніях, з якими вони партнерують. Чи можете ви обговорити бізнес-логіку цієї позиції?

Менші біотехнологічні компанії і академічні групи зазвичай залишаються поза увагою ринку щодо партнерських можливостей. Хоча вони можуть не мати ресурсів, інфраструктури чи обладнання у порівнянні з великими фармацевтичними компаніями, маленькі біотехнологічні компанії все частіше стають на передній план з поєднанням глибокого знання конкретних показань і перевагами леккої організації, яка сприяє швидкій інновації.

Це змусило нас подумати, як ми можемо взаємодіяти з цими маленькими компаніями з авангардною стратегією. Ми партнеруємо з вченими в дослідницьких організаціях, які цікавляться створенням компанії або ранньою біотехнологічною компанією, і надаємо їм нашу платформу відкриття ліків, підтримувану штучним інтелектом, через внески в натуральній формі. В обмін на це ми займаємо позиції в цих компаніях і/або ділимося володінням створених і розроблених сполук і активів. Спонукуючи інновації через поєднання створення підприємства і партнерства, ми можемо захопити більшу цінність і розвивати довгострокові відносини з нашими партнерами, щоб звернутися до спектру незадоволених медичних потреб і покращити життя пацієнтів.

Entheogenix Biosciences – це спільне підприємство між Cyclica і ATAI Life Science. Що саме таке Entheogenix Biosciences?

Є унікальна можливість інновацій у сфері лікування психічних захворювань, щоб краще служити пацієнтам, які страждають від складних психічних захворювань. Поточні ліки і терапії, які покладаються на однотargeted втручання, часто не дають бажаних результатів, що вимагає від пацієнтів приймати декілька ліків, які можуть мати потенційні ризики для безпеки, а також зменшують прийняття ліків. Ми партнеруємо з ATAI Life Science, щоб використати їхній глибокий досвід у сфері психічного здоров’я і психеделіків, а також надати їм нашу платформу відкриття ліків, підтримувану штучним інтелектом, для створення не тільки нових ліків, а й тих, які зможуть впоратися з психічними захворюваннями. Entheogenix Biosciences – одне з багатьох спільних підприємств, які ми створили, і це свідчить про нашу віру в зміну парадигми лікування психічних захворювань, вводячи нашу платформу, орієнтовану на захворювання, міцну і науково обґрунтовану, в руки фахівців і вчених світового рівня.

Чи є щось ще, що ви хотіли б поділитися про Cyclica?

Хоча ми дуже раді поділитися оголошенням про наш другий раунд фінансування, ми також з нетерпінням чекаємо запуску програми академічного партнерства Cyclica (CAPP) і нових партнерств у найближчі місяці.

Дякую за інтерв’ю. Я з нетерпінням чекаю подальшого прогресу Cyclica.