Нахід Курджі, співзасновник, президент і генеральний директор Cyclica – Серія інтерв’ю

Нахід Курджі є президентом і генеральним директором Cyclica, торонтської біотехнологічної компанії, яка використовує штучний інтелект і комп’ютерну біофізику для зміни процесу відкриття ліків. Cyclica надає фармацевтичній промисловості інтегровану, цілісну і повну платформу, яка покращує те, як вчені проектують, відбирають і персоналізують ліки для пацієнтів, і була недавно названа компанією Deep Knowledge Analytics одним з 20 найкращих компаній AI у фармацевтиці у світі

Cyclica використовує штучний інтелект і комп’ютерну біофізику для зміни процесу відкриття ліків. Чи можете ви обговорити, яким чином AI використовується в цьому процесі?

Технології відіграли критичну роль у відкритті ліків, починаючи з 80-х років. Однак процес відкриття і розробки ліків все ще дуже неефективний, тривалий і дорогий, коштуючи понад 2 мільярди доларів за 12 років. Погана ефективність часто призводить до високих рівнів атриції і невдачі у досягненні орієнтирів безпеки і ефективності ліків. Дослідники знають про це і активно шукають інструменти для цілісного розуміння якостей, що визначають найкращі ліки, щоб розробити безпечніші і більш ефективні ліки

Недавні досягнення в галузі хмарних обчислень, AI і біофізики створили можливість глибоко зрозуміти величезні об’єми біохімічних, біологічних, медичних і пацієнтських даних, щоб краще зрозуміти захворювання. Ці досягнення також дозволили медичним хімікам покращити проектування нових терапій і використовувати AI для отримання більш передбачуваних результатів на ранніх стадіях процесу розробки ліків. У Cyclica ми розробили власні глибинні двигуни навчання, MatchMaker і POEM, для підтримки процесу проектування ліків. MatchMaker передбачає, як хімічні сполуки і ліки взаємодіють з多ними білками, відомими як поліфармакологія. Ми виявили, що поєднання знань і структурованого підходу дало найбільшу передбачувану точність і продуктивність. POEM (Парето-оптимальне вкладене моделювання) – це параметр-free підхід до навчання з учителем для побудови моделей передбачення властивостей ліків і вирішує кілька обмежень інших підходів ML, що призводить до меншого переобучення і підвищеної інтерпретації.

У Cyclica ми використовуємо AI, щоб надати вченим потужну і перевірену платформу для прискорення прийняття рішень і генерації гіпотез, щоб підвищити загальну ефективність процесу відкриття ліків і зменшити кількість подальших невдач.

Cyclica розробила платформу Ligand Design і Ligand Express, що це саме?

Ми є першою компанією, яка підходить до комп’ютерної поліфармакології (оцінка того, що ліки взаємодіють з多ними мішенями) з інтегрованою платформою відкриття ліків, яка опитує молекулярні взаємодії у масштабі протеоми. Наша платформа складається з двох ключових складових, Ligand Express, нашої першої генерації платформи профайлінгу і деконволюції мішені, і Ligand Design, нашої наступної генерації технології проектування ліків in silico. Ligand Express і Ligand Design працюють на двох внутрішніх двигунах навчання і глибинного навчання: MatchMaker і POEM. MatchMaker – це глибинний двигун взаємодії ліків і мішені, який узагальнює дані-багаті і дані-бідні мішені. POEM – це технологія машинного навчання, реалізована для передбачення властивостей ADME, це новий параметр-free підхід до побудови моделей.

Всі ці складові разом складають потужну платформу відкриття ліків, що дозволяє проектувати передові, хімічно нові молекули, які одночасно пріоритезують сполуки на основі їх поліфармакологічного профілю, ефективно мінімізуючи нежадані ефекти. Наша відрізняюча платформа відкриває нові можливості для відкриття ліків, включаючи багатоцільове проектування ліків, оптимізацію лідів, передбачення властивостей ADME, деконволюцію мішені і перепрофіль ліків. Завдяки нашій інноваційній команді з глибоким знанням машинного навчання, комп’ютерної біофізики/хімії/біології, біохімії і медичної хімії, ми продовжимо інновувати через нашу потужну трубопровід R&D.

Як важливо децентралізувати відкриття ліків у бізнес-моделі Cyclica?

Наша візія – децентралізувати відкриття кращих ліків, поєднуючи наші глибокі корені в штучному інтелекті і біофізиці з інноваційною бізнес-моделлю. І в самому серці етики Cyclica лежить тверде бажання допомогти пацієнтам, просунувши відкриття і розробку кращих ліків, приймаючи цілісний, але персоналізований підхід.

Для цього ми вважаємо, що майбутнє відкриття ліків знаходиться в руках інноваційних дослідницьких інститутів і біотехнологічних компаній (ми написали про це в Forbes тут). Підтримуючи нашу філософію, у 2019 році IQIVIA повідомила, що біотехнологічні компанії становлять понад 70% всього R&D-пайплайну (у порівнянні з 50% у 2003 році), і що ці компанії запатентували понад 2/3 нових ліків у 2018 році (у порівнянні з 50% у 2010 році). Хоча біотехнологічні компанії будуть лідерами інновацій у відкритті ліків, великі фармацевтичні компанії продовжують інвестувати в просування пізніх клінічних випробувань і проникнення на ринок через свої канали продажів.

З нашим фінансуванням серії B ми прискоримо комерційні плани просування зростаючого пайплайну преп-клінічних і клінічних активів через інноваційну децентралізовану партнерську модель. Наша мета – створити і володіти сотнями програм відкриття ліків у різних терапевтичних областях. Ці програми створюються через спін-аути і спільні підприємства (JV) з топовими дослідницькими інститутами, які здійснюються в основному через програму академічного партнерства Cyclica (“CAPP”).

Підштовхнуті швидко зростаючим портфелем понад 30 активних і просунутих програм відкриття ліків, ми продовжимо спонукувати інновації через комбінацію створення підприємств і партнерств з ранньою і біотехнологічною компанією. Недавні партнерства включають EntheogeniX Biosciences, NineteenGale Therapeutics, Rosetta Therapeutics, прискорювач ліків проти рідких захворювань і два спільні підприємства, які охоплюють понад 50 програм у різних терапевтичних областях. Виконуючи нашу децентралізовану бізнес-модель, створюючи нові компанії через спін-аути і спільні підприємства і допомагаючи їм зростати, ми фактично створюємо біотехнологічний пайплайн майбутнього.

Чому багато ваших технологій базуються на хмарі, чому це так важливо?

Доступ до хмарних технологій дозволяє нам масштабувати обчислювальні потоки, які ми проводимо, а також користуватися регулюємою безпекою інфраструктури. Також, як компанія на ранній стадії, можливість швидко розпочати роботу з хмарними технологіями без витрат на власне обладнання була критичною для фінансової життєздатності на наших перших етапах. Оглядаючи майбутнє, хоча більша частина нашої роботи R&D проводиться на хмарі, за останні пару років ми стали menos залежними від хмарних технологій, з можливістю проводити проекти на окремих машинах. Ми також плануємо підтримувати приватні хмарні інсталяції, оскільки це те, чого, на наш погляд, бажають наші партнери. Технологічні досягнення зробили можливим проводити на особистому ноутбуці те, що раніше потребувало багатьох машин на хмарі, але продовжуючи використовувати хмарні технології, ми можемо значно розширити масштаб проблем, які ми вирішуємо.

Cyclica часто займає позиції власності в компаніях, з якими вони партнерують. Чи можете ви обговорити бізнес-логіку цієї позиції?

Менші біотехнологічні компанії і академічні групи一般но ігноруються ринком у сфері партнерських можливостей. Хоча вони можуть не мати ресурсів, інфраструктури або обладнання у порівнянні з великими фармацевтичними компаніями, маленькі біотехнологічні компанії все частіше потрапляють у центр уваги завдяки комбінації глибокого знання предметної області в конкретних напрямках і переваг леккої організації, яка сприяє швидкій інновації.

Це змусило нас подумати, як ми можемо взаємодіяти з цими маленькими компаніями з авангардною стратегією. Ми партнеруємо з вченими в дослідницьких організаціях, які цікавляться створенням компанії або ранньою біотехнологічною компанією, і надаємо їм нашу платформу відкриття ліків, посилену AI, через внески in kind. В обмін на це ми займаємо позиції власності в компаніях і/або ділимося володінням створених і розроблених сполук і активів. Спонукаючи інновації через комбінацію створення підприємств і партнерств, ми можемо захопити більшу цінність і розвивати довгострокові відносини з нашими партнерами, щоб вирішити спектр незадоволених медичних потреб і покращити життя пацієнтів.

EntheogeniX Biosciences – це спільне підприємство між Cyclica і ATAI Life Science. Що саме таке EntheogeniX Biosciences?

Є унікальна можливість інновацій у сфері нейропсихіатрії, щоб краще служити пацієнтам, які страждають від складних психічних захворювань. Поточні ліки і терапії, які покладаються на однократні втручання, часто не дають результатів, вимагаючи від пацієнтів приймати кілька ліків, які можуть мати потенційні питання безпеки, а також знижувати дотримання лікування. Ми партнеруємо з ATAI Life Science, щоб використати їх глибоке знання психічного здоров’я і психоделіків, а також надати їм нашу платформу відкриття ліків, посилену AI, щоб створити не тільки нові ліки, але і правильні ліки для вирішення психічних захворювань. EntheogeniX Biosciences – одне з багатьох спільних підприємств, які ми створили, і є свідченням нашої віри в зміну парадигми, у якій ліки проти психічних захворювань лікуються, привносячи нашу платформу, орієнтовану на захворювання, потужну і науково валідовану комп’ютерну платформу в руки фахівців і світових вчених.

Чи є щось ще, що ви хотіли б поділитися про Cyclica?

Хоча ми дуже раді поділитися оголошенням про наш серійний раунд фінансування, ми також з нетерпінням чекаємо на запуск програми академічного партнерства Cyclica (CAPP) і нових партнерств у найближчі місяці.

Дякую за інтерв’ю. Я з нетерпінням чекаю на подальший прогрес Cyclica.