Target Atlas firmy Phylo wprowadza agenty AI do priorytetyzacji celów leków

Phylo uruchomiło Target Atlas 29 września 2026 r., aplikację do priorytetyzacji celów opartą na platformie Biomni Lab firmy, z darmową wersją publiczną oraz pierwszą wersją specyficzną dla choroby Parkinsona opracowaną we współpracy z The Michael J. Fox Foundation.

Jak działa Target Atlas

Phylo twierdzi, że aplikacja może skrócić gromadzenie dowodów stojących za przeglądami celów z miesięcy pracy zespołów naukowców do kilku dni. System tworzy wspólny zapis, który łączy wyniki z ich źródłami i może być aktualizowany w miarę pojawiania się nowych badań. Agenci AI stosują spójne analizy w odniesieniu do celów, podczas gdy naukowcy decydują, które dowody są istotne i jaką wagę powinny mieć. Zespoły mogą zmieniać te wagi, aby zobaczyć, jak ich własne kryteria wpływają na ranking.

Wersja publiczna jest darmowa przy posiadaniu konta Biomni i obejmuje tysiące ocen cel‑choroba, prezentowanych poprzez profile celów powiązane ze źródłami oraz interaktywne wykresy 2×2. Według firmy, setki agentów AI kuratorują i syntetyzują podstawowe dowody. W różnych chorobach, wersjonowane umiejętności obliczeniowe przekształcają dowody z baz danych, publikacji i zestawów danych chorób w pulpity nawigacyjne oraz profile powiązane ze źródłami, które rejestrują źródło, datę, zakres i brakujące elementy każdego wpisu. Badacze mogą przeglądać dowody stojące za każdym wynikiem i korzystać z interfejsu czatu, aby badać dowody lub edytować prywatne widoki.

Cytowane dowody stojące za aplikacją

Ogłoszenie osadza produkt w opublikowanych danych o odpływie w rozwoju leków. Cytuje analizę z 2014 r. w Nature Biotechnology autorstwa Hay i współpracowników, która wykazała, że około jeden na dziesięć programów leków wchodzących w fazę kliniczną zostaje zatwierdzony, oraz badanie z 2024 r. w Nature przeprowadzone przez Minikel i współpracowników, szacujące, że mechanizmy leków poparte ludzką genetyką mają 2,6‑krotnie wyższe prawdopodobieństwo sukcesu od fazy I do zatwierdzenia. Wybór celu, jak podkreśla komunikat, jest jednym z najwcześniejszych i najmniej kosztownych momentów, w którym można zmienić program lekowy, a jednocześnie jednym z najdroższych, jeśli popełni się błąd; jednak dowody niezbędne do trafnego wyboru są rozproszone pomiędzy genetykę, ekspresję, aktywność kliniczną, bezpieczeństwo, podatność, biomarkery, konkurencję i literaturę, i zmieniają się nieustannie.

Wersja Parkinsona fundacji The Michael J. Fox Foundation

Pierwszą aplikacją specyficzną dla choroby w ramach Target Atlas jest edycja Parkinsona opracowana we współpracy z inicjatywą Targets to Therapies (T2T) fundacji, która stworzyła przejrzyste ramy priorytetyzacji celów w chorobie Parkinsona poprzez nominacje społeczności, panele ekspertów, opracowane karty wyników oraz opublikowaną metodologię. Phylo stwierdziło, że edycja umożliwia otwarte eksplorowanie tego eksperckiego ramienia i łączy je z analizami powiązanymi ze źródłami, które mogą być odświeżane w miarę pojawiania się nowych dowodów. Podstawowa metodologia została opublikowana przez Vaianę i współpracowników w npj Parkinson’s Disease w 2025 r.

Zgodnie z stroną inicjatywy fundacji, T2T wystartowało na początku 2024 r. z ankietą wśród społeczności naukowej dotyczącą tego, które cele oferują największy potencjał dla nowych terapii Parkinsona. Oceniło się ponad 290 celów, a 21 z nich nominowano na podstawie wykonalności rozwiązania wąskich gardeł w ciągu najbliższych dwóch‑trzech lat. Trzy rdzenie naukowe napędzają inicjatywę: priorytetyzacja i selekcja, walidacja oraz rozwój zestawu narzędzi, a także publiczna baza wiedzy. Fundacja finansuje zespoły badawcze, aby mechanistycznie weryfikowały wybrane cele pod kątem potencjalnego przyszłego rozwoju leków, a wszystkie wnioski i narzędzia są udostępniane bezpłatnie poprzez współdzieloną bazę wiedzy. Strona wymienia alfa‑synukleinę, GBA1 i LRRK2 jako cele, dla których terapie są już w fazie testów klinicznych w Parkinsonie, oraz zauważa, że początkowa runda wyboru skoncentrowała się na celach z potencjałem spowolnienia lub modyfikacji postępu choroby.

“Rozszerzenie liczby dobrze scharakteryzowanych, dających się leczyć celów jest kluczową częścią układanki,” powiedziała Gaia Skibinski, wiceprezes i szef ds. translacyjnych terapii w The Michael J. Fox Foundation for Parkinson’s Research, w ogłoszeniu uruchomienia. Dodała, że fundacja z niecierpliwością oczekuje na możliwość zbadania, jak nowe narzędzia AI, takie jak Target Atlas, mogą pomóc naukowcom w przesuwaniu obiecujących celów w kierunku potencjalnych nowych terapii Parkinsona.

Edycja Enterprise, plany rozwoju i dostępność

Edycja Enterprise Target Atlas jest dostępna na licencji rocznej dla zarządzanej instalacji Biomni i obsługuje ponad 20 000 celów na wybraną chorobę, integrację danych własnościowych, pulpity par celów oraz scoring oparty na AI/ML.

Phylo poinformowało, że planuje stopniowo rozszerzać wersję publiczną na wszystkie główne choroby oraz poszukuje fundacji, konsorcjów i organizacji pacjentów, które sponsorowałyby dodatkowe edycje chorobowe publikowane bezpłatnie dla ich społeczności, przy czym ramy każdej organizacji byłyby uwzględnione w scoringu. Kexin Huang, współzałożyciel i dyrektor generalny firmy, stwierdził, że współpraca z T2T pokazuje, że agenci mogą w ciągu kilku dni zebrać i ocenić dowody, które społeczność potrzebuje miesięcy, aby przetworzyć ręcznie, utrzymać je aktualne i zrobić to bez zastępowania eksperckiej oceny decydującej, które dowody są istotne. Huang powiedział, że celem firmy jest wprowadzenie modelu do każdej głównej choroby.

Phylo opisuje Biomni Lab jako pierwsze Zintegrowane Środowisko Biologiczne, jednolite miejsce pracy, w którym naukowcy współpracują z agentami AI przy badaniach literatury, projektowaniu eksperymentów, analizie danych biologicznych i podejmowaniu decyzji naukowych, i podał, że platforma jest używana przez firmy biotechnologiczne, w tym Chugai Pharmaceutical i Ono Pharmaceutical. Firma ma siedzibę w South San Francisco i pozyskała rundę seed o wartości $13,5 million współprowadzonej przez Andreessen Horowitz oraz Menlo Ventures’ Anthology Fund wraz z Anthropic.

Target Atlas, w tym edycja MJFF Parkinson’s, jest dostępny pod adresem biomni.phylo.bio. Liderzy R&D mogą poprosić o demonstrację przedsiębiorstwa, a fundacje i konsorcja mogą omówić sponsorowanie edycji choroby, poprzez contact@phylo.bio.