Riċerkaturi Jużaw Tagħlim Profond biex Jidentifikaw Mediċini Ġodda

Riċerkaturi fl-Istitut tax-Xjenza u t-Teknoloġija ta 'Gwangju fil-Korea żviluppaw mudell ġdid ta' tagħlim fil-fond li jista 'jbassar ir-rabta bejn droga u molekula fil-mira. It-tim, li kien immexxi mill-professur assoċjat Hojung Nam u l-istudent PhD Ingoo Lee, sejjaħ il-mudell il-ġdid "Highlights on Target Sequences" (HoTS). 

Ir - riċerka ġiet ippubblikata fil - Ġurnal tal-Kiminformatika. 

Il-Proċess ta' Skoperta tad-Droga

Id-drogi huma ttestjati fil-proċess ta 'skoperta tad-droga għall-kapaċità tagħhom li jorbtu jew jinteraġixxu ma' molekuli fil-mira fil-ġisem. Mudelli ta’ tagħlim profond urew utli biex jagħmlu dan il-proċess aktar effettiv, iżda t-tbassir tagħhom mhux dejjem juri interpretabilità. Huwa għalhekk li t-tim ħoloq HoTS, li jagħmel tbassir aħjar ta 'interazzjonijiet bejn id-droga u l-mira filwaqt li huwa wkoll interpretabbli. 

Huwa kruċjali li jiġi ddeterminat kemm mediċina torbot tajjeb mal-molekula fil-mira tagħha, u dan normalment jinvolvi l-allinjament ta 'struttura 3D ta' mediċina u l-proteina fil-mira tagħha f'diversi konfigurazzjonijiet. Dan il-proċess jissejjaħ "docking." Wara dan il-proċess, is-siti ta' rbit preferuti mbagħad jiġu skoperti billi jsiru simulazzjonijiet ta' docking għal darb'oħra b'diversi kandidati ta' mediċina għal molekula fil-mira. Mudelli ta' tagħlim profond huma invokati biex iwettqu dawn is-simulazzjonijiet. 

Mudell HoTS

Il-mudell żviluppat ġdid jista 'wkoll ibassar l-interazzjonijiet fil-mira tad-droga (DTIs) mingħajr il-ħtieġa ta' simulazzjonijiet jew strutturi 3D. 

"L-ewwel, aħna ngħallmu b'mod espliċitu l-mudell liema partijiet ta 'sekwenza ta' proteina se jinteraġixxu mal-mediċina bl-użu ta 'għarfien minn qabel," jispjega l-Professur Nam. “Il-mudell imħarreġ imbagħad jiġi utilizzat biex jirrikonoxxi u jbassar l-interazzjonijiet bejn id-drogi u l-proteini fil-mira, u jagħti prestazzjonijiet ta’ tbassir aħjar. Bl-użu ta’ dan, bnejna mudell li jista’ jbassar ir-reġjuni li jorbtu l-proteini fil-mira u l-interazzjonijiet tagħhom ma’ mediċini mingħajr kumpless 3D.” 

Il-mudell m'għandux għalfejn jittratta mat-tul sħiħ tas-sekwenza tal-proteini. Minflok, jista 'jagħmel previżjonijiet ibbażati fuq partijiet tal-proteina li huma rilevanti għall-interazzjoni DTI. 

“Għallimna l-mudell fejn ‘tiffoka’ biex niżguraw li jkun jista’ jifhem sub-reġjuni importanti ta’ proteini fit-tbassir tal-interazzjoni tiegħu ma’ mediċini kandidati,” ikompli l-Professur Nam. 

Dan jippermetti lill-mudell ibassar id-DTIs b'mod aktar preċiż minn mudelli eżistenti. 

Dawn is-sejbiet il-ġodda se jipprovdu punt ta 'tluq tajjeb għal simulazzjonijiet ta' docking futuri biex ibassru kandidati ġodda ta 'drogi. 

“Dan il-mudell użat fl-istudju tagħna jagħmel il-proċess ta’ skoperta tad-droga aktar trasparenti kif ukoll b’riskju baxx u bi prezz baxx. Dan se jippermetti lir-riċerkaturi jiskopru aktar mediċini għall-istess ammont ta’ baġit u ħin,” temm jgħid il-Professur Nam.