Target Atlas od Phylo nasazuje AI agenty na priorizaci léčebných cílů

Phylo spustila Target Atlas 29. září 2026, agentní aplikaci pro priorizaci cílů postavenou na platformě Biomni Lab společnosti, s bezplatnou veřejnou edicí a první edicí zaměřenou na konkrétní nemoc – Parkinsonova choroba, vyvinutou ve spolupráci s The Michael J. Fox Foundation.

Jak Target Atlas funguje

Phylo uvedla, že aplikace může zkrátit shromažďování důkazů za revizemi cílů z několika měsíců práce týmů vědců na dny. Systém vytváří sdílený záznam, který propojuje zjištění s jejich zdroji a může být aktualizován, jakmile se objeví nový výzkum. AI agenti provádějí konzistentní analýzy napříč cíli, zatímco vědci rozhodují, které důkazy jsou podstatné a jakou váhu by měly nést. Týmy mohou tyto váhy měnit, aby viděly, jak jejich vlastní kritéria mění pořadí.

Veřejná edice je zdarma s účtem Biomni a zahrnuje tisíce hodnocení cíl‑nemoc, prezentovaných prostřednictvím profilů cílů propojených se zdroji a interaktivních 2×2 grafů. Podle společnosti stovky AI agentů kurátorují a syntetizují podkladové důkazy. Napříč nemocemi verze výpočetních dovedností převádějí důkazy z databází, publikací a souborů dat o nemocech do přehledových panelů a profilů propojených se zdroji, které zaznamenávají zdroj, datum, pokrytí a chybějící údaje každé položky. Výzkumníci mohou prozkoumat důkazy za každým výsledkem a použít chatovací rozhraní k prozkoumání důkazů nebo úpravě soukromých náhledů.

Důkazy citované za aplikací

Oznámení zakotvuje produkt v publikovaných statistikách selhání vývoje léků. Uvádí analýzu z roku 2014 v Nature Biotechnology od Hay a kolegů, která zjistila, že přibližně jeden z deseti programů léků vstupujících do klinického vývoje je schválen, a studii z roku 2024 v Nature od Minikel a kolegů, která odhaduje, že mechanismy léků s lidskou genetickou podporou mají 2,6‑násobně vyšší pravděpodobnost úspěchu od fáze 1 až po schválení. Výběr cíle, uvádí zpráva, je jedním z nejdřívějších a nejméně nákladných okamžiků, kdy lze program léku změnit, a zároveň jedním z nejdražších, pokud se rozhodne špatně, přičemž potřebné důkazy jsou roztříštěny mezi genetikou, expresemi, klinickou aktivitou, bezpečností, zpracovatelností, biomarkery, konkurencí a literaturou a neustále se mění.

Edice Parkinsonova choroby od The Michael J. Fox Foundation

První aplikace Target Atlas zaměřená na konkrétní nemoc je edice pro Parkinsonovu chorobu vyvinutá ve spolupráci s iniciativou Targets to Therapies (T2T) nadace, která vytvořila transparentní rámec pro priorizaci cílů Parkinsonovy choroby prostřednictvím nominací komunity, odborných panelů, kurátorovaných skórovacích karet a publikované metodologie. Phylo uvedla, že tato edice umožňuje otevřeně prozkoumat ten odborný rámec a propojuje jej s analýzami propojenými se zdroji, které lze aktualizovat, jakmile se objeví nové důkazy. Základní metodologie byla publikována Vaianou a kolegy v časopise npj Parkinson’s Disease v roce 2025.

Podle stránky iniciativy nadace byl T2T zahájen začátkem roku 2024 průzkumem vědecké komunity o tom, které cíle nabízejí největší potenciál pro nové léčby Parkinsonovy choroby. Bylo vyhodnoceno více než 290 cílů a 21 bylo nominováno na základě proveditelnosti řešení úzkých míst během následujících dvou až tří let. Iniciativu pohánějí tři vědecká jádra: prioritizace a výběr, validace a vývoj nástrojových sad a veřejná znalostní databáze. Nadace financuje výzkumné týmy, aby mechanisticky validovaly vybrané cíle pro možný budoucí vývoj léků, a všechny poznatky a nástroje jsou volně dostupné prostřednictvím sdílené znalostní databáze. Stránka uvádí alfa-synuklein, GBA1 a LRRK2 jako cíle s terapiemi již v klinickém testování pro Parkinsonovu chorobu a poznamenává, že počáteční kolo výběru se zaměřilo na cíle s potenciálem zpomalit nebo modifikovat progresi onemocnění.

“Rozšiřování počtu dobře charakterizovaných, lékárně zacílených cílů je klíčovou součástí skládačky,” řekla Gaia Skibinski, viceprezidentka a vedoucí translacionální terapie ve The Michael J. Fox Foundation for Parkinson’s Research, v oznámení o spuštění. Dodala, že nadace se těší na zkoumání toho, jak nové AI nástroje jako Target Atlas mohou pomoci výzkumníkům posunout slibné cíle směrem k potenciálním novým léčbám Parkinsonovy choroby.

Enterprise edice, plány rozšíření a dostupnost

Enterprise edice Target Atlas je k dispozici formou roční licence pro řízené nasazení Biomni a podporuje více než 20 000 cílů na vybranou nemoc, integraci proprietárních dat, přehledy dvojic cílů a skórování založené na AI/ML.

Phylo uvedla, že plánuje postupně rozšířit veřejnou edici na všechny hlavní nemoci, a hledá nadace, konsorcia a pacientské organizace, které by sponzorovaly další edice zaměřené na konkrétní nemoci, jež by byly publikovány zdarma pro jejich komunity, přičemž rámec každé organizace bude zahrnut ve skórování. Kexin Huang, spoluzakladatel a výkonný ředitel společnosti, řekl, že spolupráce s T2T ukazuje, že agenti dokážou během dnů shromáždit a ohodnotit důkazy, na jejichž zpracování komunitě trvá měsíce ručně, udržet je aktuální a to bez nahrazení odborného úsudku, který rozhoduje, které důkazy jsou podstatné. Huang uvedl, že cílem společnosti je přenést model na každou hlavní nemoc.

Phylo popisuje Biomni Lab jako první integrované biologické prostředí, jednotné pracovní prostředí, kde vědci spolupracují s AI agenty napříč výzkumem literatury, návrhem experimentů, analýzou biologických dat a vědeckým rozhodováním, a uvedl, že platformu používají biopharma společnosti včetně Chugai Pharmaceutical a Ono Pharmaceutical. Společnost sídlí v South San Francisco a získala seedové kolo ve výši $13.5 million, které spoluvedly Andreessen Horowitz a Menlo Ventures’ Anthology Fund s Anthropic.

Target Atlas, včetně edice MJFF Parkinson’s, je k dispozici na biomni.phylo.bio. Vedoucí výzkumu a vývoje mohou požádat o firemní demonstraci a nadace a konsorcia mohou diskutovat o sponzorství edice onemocnění prostřednictvím contact@phylo.bio.