Modely a platformy AI
BioNTech a InstaDeep vyvinuli systém pro včasné varování pro detekci variant COVID
Přidejte Unite.AI mezi své preferované zdroje na Google
Imunoterapeutická společnost BioNTech (BNTX ) a společnost pro umělou inteligenci InstaDeep vyvinuli novou výpočetní metodu, která analyzuje celosvětová sekvencovací data, aby předpovídala varianty SARS-CoV-2 s vysokým rizikem. Systém pro včasné varování (EWS) používá metriky imunitního úniku a fitness vypočítané pomocí umělé inteligence.
Detekce variant s vysokým rizikem
Kombinací strukturálního modelování virového proteinu Spike a algoritmu umělé inteligence může metoda rychle detekovat potenciální varianty s vysokým rizikem, které jsou vloženy do repozitářů sekvencí SARS-CoV-2. To může být provedeno během jednoho dne a společnosti byly schopny ověřit předpovědi pomocí generovaných a veřejně dostupných dat.
Systém identifikoval více než 90 % variant označených Světovou zdravotnickou organizací (WHO) v průměru dva měsíce předem. Pro varianty Alpha, Beta, Gamma, Theta, Eta a Omicron systém EWS detekoval je ve stejném týdnu, kdy byla jejich sekvence poprvé nahrána.
Nová studie prokázala, že EWS může vyhodnotit nové varianty během několika minut a je plně škálovatelný, jakmile jsou uvolněna nová data o variantách.
BioNTech a InstaDeep
Ugur Sahin, M.D., je generální ředitel a spoluzakladatel BioNTech.
„S pokročilými výpočetními metodami, které jsme vyvinuli v posledních měsících, můžeme analyzovat sekvencovací informace proteinu Spike a řadit nové varianty podle jejich předpověděného imunitního úniku a skóre vazby ACE2,“ řekl Sahin. „Brzké označení potenciálních variant s vysokým rizikem by mohlo být účinným nástrojem pro upozornění výzkumníků, vývojářů vakcín, zdravotnických orgánů a tvůrců politik, aby měli více času na reakci na nové varianty, které vyvolávají obavy.“
Karim Beguir je spoluzakladatel a generální ředitel InstaDeep.
„V současné době je objeveno více než 10 000 nových sekvencí variant každý týden a lidský personál jednoduše nemůže zvládnout komplexní data v tomto měřítku. Zmírnili jsme tuto výzvu nasazením výkonných schopností umělé inteligence platformy DeepChain společnosti InstaDeep v kombinaci s know-how a technologií SARS-CoV-2 společnosti BioNTech. Poprvé mohou být varianty s vysokým rizikem detekovány na místě, potenciálně šetřící měsíce cenného času. Rádi zpřístupníme naše výzkumné práce veřejnosti a především se těšíme na jejich pokračující praktický dopad,“ řekl Beguir.
Během jedenáctiměsíčního období byl EWS schopen rozlišit varianty označené WHO od těch, které nebyly označeny.
Nově vyvinutý systém přichází, když BioNTech a InstaDeep pokračují ve spolupráci na kombinaci umělé inteligence a imunologie, kterou společnosti provádějí od listopadu 2020. Obě společnosti založily společnou inovační laboratoř umělé inteligence v Londýně, Spojeném království, a v Mainzu, Německu. Laboratoř je zaměřena na rozvoj nových metod objevu a návrhu léků, inženýrství proteinů, výroby a optimalizace dodavatelského řetězce.
