OpenAI dezvăluie atlasul raționamentului asupra creierului de șoarece realizat de agenții GPT-Rosalind

Pe 21 octombrie 2026, OpenAI a anunțat că, împreună cu PerturbAI și Scripps Research, a folosit mii de agenți IA bazați pe GPT-Rosalind pentru a analiza, în 32 de minute, date experimentale existente provenite de la milioane de celule din creierul de șoarece, reunind rapoartele agenților într-un atlas al raționamentului disponibil public.

Raționament biologic distribuit

Abordarea, pe care OpenAI o numește raționament biologic distribuit, a împărțit analiza între mii de agenți care au examinat un atlas CRISPR al întregului creier, un set de date care arată cum afectează perturbările genetice diferite tipuri de celule din creierul de șoarece. Fiecare agent a investigat o perturbare genetică, a analizat răspunsurile celulare, a căutat în literatura științifică și a propus explicații pentru rezultate. Rapoartele agenților au fost reunite într-un atlas al raționamentului care conectează genele, efectele celulare, publicațiile relevante și posibilele mecanisme biologice.

OpenAI a declarat că echipa de cercetare a estimat că o analiză umană comparabilă și o documentare similară în literatura de specialitate, realizate pe rând pentru fiecare perturbare, ar dura de la câteva luni până la un an. Agenții au reprodus rezultate obținute prin analize umane, descoperind totodată piste suplimentare, iar evaluările lor privind noutatea și valoarea științifică au fost în concordanță cu judecățile experților umani care nu știau care rezultate proveneau de la agenți.

Sarah Teichmann, titulară a catedrei de medicină a celulelor stem la University of Cambridge și copreședintă fondatoare a Human Cell Atlas, a declarat în anunțul OpenAI: „Construim atlase celulare pentru ca alți oameni de știință să poată face descoperiri la care încă nu ne-am gândit. IA ar putea ajuta mai mulți cercetători să exploreze aceste resurse și să transforme observațiile neașteptate în noi întrebări de verificat.”

Un preprint conex, Agenții IA distribuiți permit descoperirea cuprinzătoare a perspectivelor biologice la scară largă, a fost publicat pe bioRxiv la 16 octombrie 2026 și nu a fost certificat prin evaluare inter pares. Autorii sunt afiliați la Howard Hughes Medical Institute and Scripps Research, OpenAI, PerturbAI și University of California San Diego, iar Xin Jin, de la Scripps Research, este indicat drept autor corespondent. Declarația privind conflictele de interese precizează că șase dintre autori sunt angajați ai OpenAI, doi sunt angajați ai PerturbAI, iar Grace Zheng și Xin Jin sunt cofondatori ai PerturbAI.

Diferențe între Tsc1 și Tsc2 și o pistă legată de colesterol

Agenții au identificat o diferență neașteptată între Tsc1 și Tsc2, două gene care acționează împreună pentru a controla mTOR, un regulator major al creșterii, metabolismului și îmbătrânirii celulare, potrivit anunțului. Perturbarea oricăreia dintre gene a avut efecte similare în mai multe grupuri de neuroni. În cerebel, care ajută la coordonarea mișcărilor, perturbarea Tsc2 a modificat activitatea a zeci de gene implicate în comunicarea neuronală, în timp ce perturbarea Tsc1 a produs puține schimbări.

Anunțul menționează că, la persoanele cu scleroză tuberoasă, anomaliile cerebelului sunt puternic asociate cu mutațiile TSC2 și că, deși medicamentele care reduc activitatea mTOR pot trata anumite tumori cerebrale și crize epileptice, dificultățile de învățare și de comportament asociate bolii rămân greu de abordat. Agenții au identificat un grup specific de neuroni și schimbări celulare care merită investigate în continuare.

Agenții au identificat și o pistă legată de DCTN1, o genă ale cărei mutații cauzează sindromul Perry, o boală neurodegenerativă cu simptome asemănătoare celor ale bolii Parkinson. DCTN1 este implicată în transportul încărcăturii în interiorul neuronilor, iar în atlas, perturbarea Dctn1 a crescut expresia genelor implicate în producerea colesterolului. Agenții au pus această observație în legătură cu cercetări care sugerează că problemele de transport al colesterolului pot determina celulele să producă mai mult colesterol, ridicând întrebări pentru cercetările ulterioare: dacă perturbarea DCTN1 modifică distribuția colesterolului în interiorul neuronilor și dacă aceste schimbări ar putea contribui la neurodegenerare. Potrivit anunțului, experții umani au considerat ipoteza nouă, importantă și demnă de investigat în continuare.

Tomasz Nowakowski, profesor asociat de neurochirurgie la UCSF, a declarat că posibila legătură dintre funcția neuronală și metabolismul colesterolului arată cum indicii dispersate în domenii diferite pot, odată conectate, să ofere o nouă modalitate de a înțelege biologia bolilor.

Agenți distribuiți versus un singur agent

Echipa a testat dacă un singur agent căruia i se furniza întregul set de date putea egala performanța miilor de agenți care lucrau în paralel, menținând constante modelul și resursele. Pe măsură ce volumul de lucru creștea, agentul unic căuta în mai puține surse din literatura de specialitate, citând doar 11 referințe la cel mai mare volum de lucru, în timp ce agenții distribuiți citau peste 700. În comparațiile realizate în orb, experții umani au preferat rapoartele agenților distribuiți în locul celor ale agentului unic în 75% din cazuri.

Preprintul relatează că, fără acces la manuscrisul-sursă, agenții i-au reconstituit concluziile, au prezis efectele perturbărilor excluse din setul de date și au identificat relații între perturbări cu rezultate comune sau opuse, la diferite intensități ale efectelor. Autorii afirmă că agenții distribuiți și-au extins acoperirea literaturii de specialitate pe măsură ce creștea volumul de lucru, găsind de sute de ori mai multe referințe decât modul cu un singur agent, și că experții umani care nu știau care rezultate proveneau de la agenți au susținut ierarhizările descoperirilor realizate de aceștia.

Acces la atlas, cod și setul de date

Atlasul de raționament și cadrul Distributed Agents pe care se bazează sunt disponibile public într-un depozit GitHub, publicat sub licență MIT. Depozitul oferă mediul de execuție al agentului, instrumentele pentru corpus și notebookurile folosite pentru analizele, figurile și tabelele suplimentare din manuscris. Acesta documentează un serviciu de corpus găzduit, cu acces doar pentru citire, ale cărui puncte finale MCP oferă acces la constatări, afirmații, dovezi justificative și instrumente de analiză; deoarece serverul găzduit nu include fișierele brute ale setului de date, depozitul oferă și instrucțiuni pentru rularea locală a cadrului prin CLI-ul Codex. Cel mai recent commit al depozitului, care a actualizat citarea bioRxiv, licența și documentația serviciului găzduit, este datat 21 octombrie 2026.

Setul de date analizat este atlasul CRISPR Perturb-seq in vivo al întregului creier al PerturbAI, disponibil pe Hugging Face. Fișa setului de date descrie 7,7 milioane de celule și 7.739.370 de rânduri, însumând 205 GB, cu profilare la nivelul nucleilor individuali pentru 19.070 de ARNm și 8.588 de sgARN-uri, măsurând efectele a aproape 2.000 de gene asociate bolilor; adnotările celulare provin din Allen Institute Whole Mouse Brain Taxonomy. Fișa identifică un manuscris bioRxiv din martie 2026, „Genome-scale functional mapping of the mammalian whole brain with in vivo Perturb-seq”, drept publicația care stă la baza atlasului.

OpenAI a declarat că cercetătorii pot folosi atlasul pentru a compara gene înrudite, a investiga răspunsuri neașteptate și a identifica piste promițătoare de cercetare, iar constatările ajută la stabilirea priorităților pentru experimentele suplimentare necesare testării mecanismelor biologice propuse.