OpenAI przedstawia atlas rozumowania mózgu myszy opracowany przez agentów GPT-Rosalind

21 października 2026 r. OpenAI poinformowało, że wraz z PerturbAI i Scripps Research wykorzystało tysiące agentów AI opartych na GPT-Rosalind do analizy istniejących danych eksperymentalnych dotyczących milionów komórek mózgu myszy. Analiza trwała 32 minuty, a raporty agentów połączono w publicznie dostępny atlas rozumowania.

Rozproszone rozumowanie biologiczne

Metoda, którą OpenAI określa mianem rozproszonego rozumowania biologicznego, polegała na podzieleniu analizy między tysiące agentów badających atlas CRISPR całego mózgu — zbiór danych pokazujący, jak zaburzenia funkcji genów wpływają na różne typy komórek w mózgu myszy. Każdy agent badał zaburzenie funkcji genu, analizował reakcje komórek, przeszukiwał literaturę naukową i proponował wyjaśnienia uzyskanych wyników. Raporty agentów połączono w atlas rozumowania, który zestawia geny, skutki komórkowe, powiązane publikacje i możliwe mechanizmy biologiczne.

OpenAI poinformowało, że zespół badawczy oszacował, iż porównywalna analiza przeprowadzona przez ludzi wraz z przeglądem literatury, wykonywana po jednym zaburzeniu funkcji genu naraz, zajęłaby od kilku miesięcy do roku. Agenci odtworzyli wyniki analiz przeprowadzonych przez ludzi, a jednocześnie wskazali dodatkowe tropy; oceny nowatorskości i wartości naukowej ich ustaleń były zgodne z opiniami ekspertów, którzy nie znali ich źródła.

Sarah Teichmann, kierująca katedrą medycyny komórek macierzystych na University of Cambridge i współzałożycielka oraz współprzewodnicząca Human Cell Atlas, powiedziała w komunikacie OpenAI: „Tworzymy atlasy komórek po to, by inni naukowcy mogli dokonywać odkryć, których sami sobie jeszcze nie wyobrażamy. AI może pomóc większej liczbie badaczy eksplorować te zasoby i przekształcać nieoczekiwane obserwacje w nowe pytania, które warto sprawdzić”.

Powiązany z badaniem preprint zatytułowany Rozproszone agenty AI umożliwiają wszechstronne odkrywanie zależności biologicznych na dużą skalę opublikowano w serwisie bioRxiv 16 października 2026 r.; nie został on poddany ocenie recenzentów. Jego autorzy są związani z Howard Hughes Medical Institute i Scripps Research, OpenAI, PerturbAI oraz University of California San Diego. Xin Jin z Scripps Research figuruje jako autor korespondencyjny. Oświadczenie o potencjalnym konflikcie interesów ujawnia, że sześciu autorów jest pracownikami OpenAI, dwóch pracuje w PerturbAI, a Grace Zheng i Xin Jin są współzałożycielami PerturbAI.

Różnice w działaniu Tsc2 i trop związany z cholesterolem

Jak podano w komunikacie, agenci wykryli nieoczekiwaną różnicę między Tsc1 i Tsc2 — dwoma genami, które wspólnie regulują mTOR, ważny regulator wzrostu komórek, metabolizmu i starzenia. Zaburzenie funkcji każdego z tych genów wywoływało podobne skutki w kilku grupach neuronów. W móżdżku, który pomaga koordynować ruch, zaburzenie funkcji Tsc2 zmieniło aktywność dziesiątek genów związanych z komunikacją między neuronami, podczas gdy zaburzenie funkcji Tsc1 spowodowało niewielkie zmiany.

W komunikacie zaznaczono, że u osób ze stwardnieniem guzowatym nieprawidłowości w móżdżku są silnie związane z mutacjami TSC2. Leki zmniejszające aktywność mTOR mogą wprawdzie leczyć niektóre guzy mózgu i napady padaczkowe, ale trudności w nauce i problemy behawioralne związane z tą chorobą nadal trudno jest łagodzić. Agenci wskazali konkretną grupę neuronów i zmiany komórkowe, które warto poddać dalszym badaniom.

Agenci znaleźli również trop związany z DCTN1 — genem, którego mutacje wywołują zespół Perry’ego, chorobę neurodegeneracyjną z objawami przypominającymi chorobę Parkinsona. DCTN1 uczestniczy w transporcie ładunków wewnątrz neuronów, a w atlasie zaburzenie funkcji Dctn1 zwiększyło ekspresję genów zaangażowanych w wytwarzanie cholesterolu. Agenci powiązali tę obserwację z badaniami sugerującymi, że problemy z transportem cholesterolu mogą skłaniać komórki do jego zwiększonej produkcji. To nasunęło kolejne pytania: czy zaburzenie funkcji DCTN1 zmienia rozmieszczenie cholesterolu w neuronach i czy takie zmiany mogą przyczyniać się do neurodegeneracji. Jak podano w komunikacie, eksperci uznali tę hipotezę za nowatorską, istotną i wartą dalszych badań.

Tomasz Nowakowski, profesor nadzwyczajny neurochirurgii w UCSF, powiedział, że możliwy związek między funkcjonowaniem neuronów a metabolizmem cholesterolu pokazuje, jak połączenie wskazówek rozproszonych w różnych dziedzinach może otworzyć nową perspektywę badania biologicznych podstaw chorób.

Agenci działający w rozproszeniu a pojedynczy agent

Zespół sprawdził, czy pojedynczy agent, któremu udostępniono cały zbiór danych, może dorównać tysiącom agentów pracujących równolegle, przy niezmienionym modelu i zasobach. Wraz ze wzrostem zakresu zadań pojedynczy agent przeszukiwał mniejszą część literatury i przy największym obciążeniu przytoczył zaledwie 11 źródeł, podczas gdy agenci działający w rozproszeniu cytowali ich ponad 700. W zaślepionych porównaniach eksperci w 75% przypadków wyżej oceniali raporty agentów działających w rozproszeniu niż raporty pojedynczego agenta.

Z preprintu wynika, że bez dostępu do pierwotnego manuskryptu agenci odtworzyli jego wnioski, przewidzieli skutki zaburzeń funkcji genów, których wyników nie udostępniono im podczas analizy, oraz wskazali zależności między zaburzeniami prowadzącymi do podobnych lub przeciwnych skutków o różnej sile. Autorzy stwierdzają, że agenci działający w rozproszeniu zwiększali zakres przeglądanej literatury wraz ze wzrostem obciążenia, wyszukując setki razy więcej źródeł niż w trybie pojedynczego agenta, a eksperci, którzy nie znali źródła ocenianych wyników, poparli ranking odkryć przygotowany przez agentów.

Dostęp do atlasu, kodu i zbioru danych

Atlas rozumowania i stanowiący jego podstawę framework Distributed Agents są publicznie dostępne w repozytorium GitHub opublikowanym na licencji MIT. Repozytorium zawiera środowisko uruchomieniowe agentów, narzędzia do pracy z korpusem oraz notatniki wykorzystane do analiz, ilustracji i tabel uzupełniających w manuskrypcie. Dokumentacja opisuje hostowaną usługę korpusową działającą w trybie tylko do odczytu, z punktami końcowymi MCP udostępniającymi ustalenia, twierdzenia, dowody na ich poparcie oraz narzędzia analityczne; ponieważ hostowany serwer nie zawiera surowych plików zbioru danych, repozytorium zawiera również instrukcje lokalnego uruchamiania frameworka za pomocą Codex CLI. Najnowszy commit w repozytorium, który zaktualizował cytowanie publikacji bioRxiv, licencję i dokumentację hostowanej usługi, pochodzi z 21 października 2026 r.

Analizowany zbiór danych to atlas perturbacji sekwencji CRISPR całego mózgu in vivo Perturb-seq firmy PerturbAI na platformie Hugging Face. Karta zbioru danych opisuje 7,7 miliona komórek, 7 739 370 wierszy o łącznej objętości 205 GB, z profilowaniem pojedynczych jąder komórkowych obejmującym 19 070 mRNA i 8 588 sgRNA, mierząc wpływ blisko 2000 genów powiązanych z chorobami, z adnotacjami komórkowymi pochodzącymi z taksonomii Allen Institute Whole Mouse Brain. Karta wskazuje na manuskrypt bioRxiv z marca 2026 roku, “Mapowanie funkcjonalne na skalę genomu mózgu ssaków przy użyciu in vivo Perturb-seq,” jako publikację będącą podstawą atlasu.

OpenAI poinformowało, że badacze mogą wykorzystać atlas do porównywania powiązanych genów, analizowania nieoczekiwanych reakcji i identyfikowania obiecujących tropów do dalszych badań. Dodano, że wyniki pomagają ustalić priorytety dalszych eksperymentów potrzebnych do sprawdzenia proponowanych mechanizmów biologicznych.