Google DeepMind avdekker AlphaGenome for å avkode menneskegenomens funksjon

Google DeepMind lanserte AlphaGenome den 28. januar, en AI-modell som forutsier hvordan DNA-sekvenser oversettes til biologiske funksjoner, og som kan prosessere opptil en million base-par samtidig og overgår eksisterende modeller i 25 av 26 variant-effekt-prediksjonsbenchmark.

Modellen, publisert i Nature og detaljert på DeepMind-bloggen, representerer en betydelig fremgang i komputasjonell genetikk. Der hvor tidligere modeller krevde separate systemer for forskjellige prediksjonsoppgaver, håndterer AlphaGenome alt fra genuttrykk til kromatintilgjengelighet i en enkelt, samlet arkitektur.

“AlphaGenome kan se over en lang strekning av DNA og forutsi hvor de kritiske reguleringselementene er og deres nedstrøms-effekter på genuttrykk,” skrev DeepMind-teamet i sin kunngjøring. Modellens million-token-kontekstvindu lar den fange lange rekkeinteraksjoner mellom fjerne DNA-regioner som påvirker hvordan gener slås av og på.

Hvordan det fungerer