PhyloのTarget AtlasがAIエージェントを薬剤ターゲットの優先順位付けに活用

Phyloは2026年9月29日にTarget Atlasを発表しました。このエージェント型ターゲット優先順位付けアプリケーションは、同社のBiomni Labプラットフォーム上に構築されており、無料のパブリックエディションと、The Michael J. Fox Foundationと共同で開発されたパーキンソン病向けの初の疾病特化エディションが提供されます。

Target Atlasの仕組み

Phyloは、このアプリケーションが科学者チームによる数か月にわたる作業で行われていたターゲットレビューの証拠収集を、数日へと短縮できると述べました。システムは、発見とその出典を結びつけた共有レコードを作成し、新たな研究が出るたびに更新可能です。AIエージェントはターゲット全体にわたって一貫した分析を実行し、科学者はどの証拠が重要か、どの程度の重みを付けるかを決定します。チームはその重みを変更して、独自の基準がランキングにどのように影響するかを確認できます。

パブリックエディションはBiomniアカウントで無料利用でき、何千ものターゲット–疾患評価をカバーし、出典にリンクされたターゲットプロファイルとインタラクティブな2×2プロットで提示されます。同社によると、数百のAIエージェントが基礎となる証拠をキュレーションし、統合しています。疾患全体にわたり、バージョン管理された計算スキルがデータベース、論文、疾患データセットからの証拠をダッシュボードや出典リンク付きプロファイルに変換し、各項目の出典、日付、カバレッジ、欠損情報を記録します。研究者は各結果の背後にある証拠を検査し、チャットインターフェースを使って証拠を探索したり、プライベートビューを編集したりできます。

アプリケーションの背後に引用された証拠

この発表は、製品を公表された医薬品開発の脱落率データに基づかせています。Hayらによる2014年のNature Biotechnologyの分析では、臨床開発に入る薬剤プログラムの約10分の1が承認されることが示され、Minikelらによる2024年のNatureの研究では、ヒト遺伝子サポートがある薬剤メカニズムは第1相から承認までの成功確率が2.6倍高いと推定されています。リリースは、ターゲット選択が薬剤プログラムを変更できる最も早く、かつ費用が最も少ない段階の一つであると同時に、誤ると最もコストがかかるポイントでもあると述べています。しかし、適切に選択するために必要な証拠は、遺伝学、発現、臨床活性、安全性、実現可能性、バイオマーカー、競合、文献といった領域に分散しており、継続的に変化しています。

The Michael J. Fox Foundation パーキンソン病エディション

Target Atlasの初の疾病特化アプリケーションは、財団のTargets to Therapies（T2T）イニシアチブと共同で開発されたパーキンソン病エディションです。このイニシアチブは、コミュニティからのノミネーション、専門家パネル、キュレーションされたスコアカード、公開された方法論を通じて、透明性のあるパーキンソン病ターゲット優先順位付けフレームワークを確立しました。Phyloは、このエディションがその専門家フレームワークをオープンに探索可能にし、新たな証拠が出るたびに更新できる出典リンク付き分析と結びつけると述べています。基礎となる方法論は、Vaianaらによって2025年にnpj Parkinson’s Diseaseに掲載されました。

財団のイニシアチブページによると、T2Tは2024年初頭に、どの標的が新しいパーキンソン病治療に最も大きな可能性を提供するかについて科学コミュニティへの調査とともに開始されました。290以上の標的が評価され、次の2〜3年でボトルネックに対処できる実現可能性に基づき、21の標的が指名されました。このイニシアチブは、3つの科学的コアによって支えられています：優先順位付けと選択、検証とツールキット開発、そして公開ナレッジベースです。財団は、将来の医薬品開発の可能性に向けて選択された標的を機構的に検証する研究チームに資金を提供し、すべての知見とツールは共有ナレッジベースを通じて無償で利用可能にしています。ページでは、alpha-synuclein、GBA1、LRRK2 がすでにパーキンソン病の臨床試験中の治療法を有する標的として挙げられ、初期の選択ラウンドは疾患進行を遅延または修正する可能性のある標的に焦点を当てたことが記されています。

「よく特徴付けられた、薬剤化可能なターゲットの数を増やすことは、パズルの重要な要素です」と、The Michael J. Fox Foundation for Parkinson’s ResearchのVP兼トランスレーショナル・セラピューティクス部門長であるGaia Skibinskiは、ローンチ発表で述べました。彼女は、財団がTarget Atlasのような新興AIツールが研究者に有望なターゲットを新たなパーキンソン病治療へと進める手助けになることを期待していると語りました。

エンタープライズエディション、拡張計画、利用可能性

Target Atlasのエンタープライズエディションは、管理されたBiomni導入向けに年次ライセンスで提供され、選択された疾患ごとに20,000以上のターゲット、独自データの統合、ターゲットペアダッシュボード、そしてAI/MLベースのスコアリングをサポートします。

Phyloは、パブリックエディションを時間をかけてすべての主要疾患に拡大する計画であり、追加の疾病エディションをスポンサーし、各コミュニティに無料で公開するために、財団、コンソーシアム、患者団体を募集しています。各組織のフレームワークはスコアリングに反映されます。同社の共同創業者兼CEOであるKexin Huangは、T2Tとの協業により、エージェントが手作業で数か月かかる証拠を数日で組み立ててスコア付けし、最新の状態を保ち、証拠の重要性を判断する専門家の判断を置き換えることなく実現できることを示したと述べました。Huangは、同社の目標はこのモデルをすべての主要疾患に提供することだと語りました。

Phylo は Biomni Lab を、文献調査、実験設計、生物データ解析、科学的意思決定にわたって AI エージェントと科学者が協働できる統合生物学環境（Integrated Biology Environment）として初めて紹介し、同プラットフォームは中外製薬や大野製薬を含むバイオ医薬品企業で利用されていると述べました。同社はサウスサンフランシスコに拠点を置き、Andreessen Horowitz と Menlo Ventures の Anthology Fund が共同リードした 1,350 万ドルのシードラウンドを Anthropic とともに調達しました。

Target Atlas（MJFF パーキンソン版を含む）は biomni.phylo.bio で利用可能です。R&D リーダーはエンタープライズデモのリクエストができ、財団やコンソーシアムは疾病エディションのスポンサーシップについて contact@phylo.bio を通じて相談できます。