Anthropic、Claudeを活用した創薬の初期段階での進展を報告

Anthropicは2026年10月27日、ライフサイエンス分野での取り組みに関する進捗を発表し、BigHat Biosciences、Bristol Myers Squibb、Divergence Labs、Enveda、Generate Biomedicines、The Column Groupという6つの創薬組織との研究提携で得られた初期成果と、同社初の自社創薬プログラムについて報告した。

同社によると、創薬プロセスの一部にボトルネックが集中しているのではなく、プロセス全体に分散していることから、標的の特定や分子設計から、製造文書の作成、臨床試験の計画に至るまで、創薬のあらゆる段階にClaudeを活用する方針だという。Anthropicは、この取り組みを通じて自社モデルの強みと限界を明らかにし、ライフサイエンス分野全体に事例を提供するとともに、現在の進展が続けば、食物アレルギー、希少小児疾患、複数のがんを対象とする医薬品の創出につながる可能性があると述べた。同社は、研究はまだ初期段階で、その大半は前臨床段階にあると注意を促しており、対象となる医薬品のほとんどは、まだヒトを対象とした試験が行われていない。

細胞療法と抗体を再設計

Generate Biomedicinesでは、6人の科学者がClaude Codeを使い、CAR-T細胞療法向けのシグナル伝達ドメインを再設計する案を提示するAIエージェントのシステムを構築した。Generateは、受容体の遺伝情報をよりコンパクトにすることで、血液がん向けの治療法を固形腫瘍にも適用できるようにすることを目指している。このエージェントシステムは2026年2月に構築が始まり、チームは初回の実験室試験に向けて186種類の設計を選定した。Generateによると、ある設計は標準型より約70％短い一方、実験室試験では細胞表面の受容体数が約10倍に増え、腫瘍細胞をより効率よく殺傷し、免疫細胞の活動をより長く維持した。GenerateとAnthropicは、これらは初期段階の実験室での結果であり、患者における安全性や有効性はまだ検証されていないと述べた。次の段階として、マウスモデルでの試験と、固形腫瘍を標的とする戦略の検討を挙げている。

2025年に設立されたバイオテクノロジー企業Divergence Labsは、遊離状態のIgEを中和すると同時に、免疫細胞にすでに結合しているIgEを引き離すことを目的とした、2本腕の抗体設計による食物アレルギー治療薬を開発している。Anthropicによると、Claudeは22回にわたる自律的な作業期間に、Nvidia H100 GPUで合計約2,750時間の計算処理を行い、約35,000種類の抗体設計を生成した。Divergenceは、両方の腕で初期段階の成果が得られたと報告した。試験した91種類の引き離し設計のうち20種類は、結合したIgEを測定可能なほど引き離し、そのうち3種類は、患者が現実的に投与を受けられる濃度で、承認薬Xolairを上回るように見えた。また、試験した57種類の結合設計のうち3種類がIgEに結合した。報告によると、アイデアの段階から実験室で結果を得るまでにかかった期間は、引き離し側で約3週間、結合側で4週間半だった。これは、同様の従来の研究にかかる最長9カ月に比べて短い。Divergenceのチームは限界についても指摘し、結果をさらに調べるか次に進むかを判断する際、Claudeは人間の担当者ほど実務的ではなかったと述べた。また、今回の結果は新薬の実現にはまだ遠いともしている。

実験室での最適化と規制関連文書

BigHat Biosciencesとの試験的な取り組みでは、Anthropicの研究者がBigHatの実験室データシステムReccyに接続したClaudeを使い、抗アルブミンVHHと、がんを標的とする抗メソテリンscFvという2つの抗体断片を最適化した。BigHatの自動化実験室は、約10週間にわたる7回の試験で約1,010種類の変異体を作製し、1,232個のサンプルを試験した。各回で試験した変異体は176種類だった。BigHatによると、最終的な分子は出発時の分子に比べて結合力が6～9倍強く、8～18°C高い温度まで安定し、凝集にもより強い耐性を示した。最終的なVHHが融解した温度は約71°Cで、出発時の分子では約62°Cだった。最終的なscFvは約74°Cで溶液から析出し、出発時の分子では約56°Cだった。研究の途中で研究者とClaudeは機器の生データを再分析し、標準的な融解スコアと凝集スコアは誤解を招くと判断した。そして、指標の改訂に加え、2つの濃度と2つの加熱速度でサンプルを試験する手順変更を提案した。Claudeが事前に予測した数値のうち、安定して維持されるものについては、その予測が正しかった。Anthropicは実験室での作業に対してBigHatに費用を支払った。

Envedaは、製造バッチ記録を確認するため、Claudeを活用したCMC Document Processorを構築した。後にFDAへ提出された第2相製造キャンペーンから得られた、合計1,061ページの4つの記録を評価したところ、このシステムは人間のレビュアーが発見した11件すべての問題に加え、人間が見落としていた7件も検出した。Envedaによると、この用途ではレビュー時間を25.9時間から2.8時間へ短縮し、89％削減した。Envedaはまた、治験薬申請（IND）のモジュール2を4時間で作成するためにClaudeを使った。手作業では約3カ月かかる作業だった。さらに、治験責任医師向け治験薬概要書の作成にもClaudeを用い、FDAへの提出前にレビュアーが軽微な単位換算の誤りを1件見つけた。Envedaによると、同社のチームはIND申請の草案を、専門のメディカルライターが作成したものと同等と評価した。

企業の立ち上げと自社創薬プログラム

2007年からバイオテクノロジー分野に投資しているベンチャーキャピタル企業のThe Column Groupは、Anthropicのエンジニアとともに、新たなバイオテクノロジー企業Pleiadesの設立を進めている。同社は初日から全面的にAIを活用できる体制を整える。TCGの科学者とAnthropicは、初期段階の標的評価に用いるClaudeのスキルを開発し、45組の標的と疾患のペアで評価した。TCGによると、専門家の判断と組み合わせることで、関連する科学文献を探して解釈するプロセスを数週間から数日に短縮できた。臨床戦略向けの2つ目のスキルは、8月から開発が続いている。

AnthropicはBristol Myers Squibbとの協業にも着手し、臨床試験の計画におけるボトルネックの特定に取り組んでいる。BMSはClaudeを使って初期段階の医薬品の計画を評価し、試験が成功する可能性を推定している。「単一のプロンプトから、Claudeは堅実な初期分析を生成しました。これにより、さまざまな開発案の評価に役立つ情報が得られました。こうした分析を自力で行えば、通常は完了までに数日かかります」と、BMSで早期臨床開発、血液学、腫瘍学、細胞療法を統括するシニアバイスプレジデントのMichael Pourdehnad氏は述べた。両社は2027年に協業を拡大する計画だ。

Anthropicはこれとは別に、Cody Tranbarger氏が創業した一人会社Mithril Medicineを買収した。同社は、まれな筋ジストロフィーであるLAMA2関連先天性筋ジストロフィーとα-ジストログリカノパチーの治療法を開発している。7月の買収前、Tranbarger氏はClaudeを使って契約、物流、11カ所の外部研究機関との実験を管理し、二重特異性抗体のアイデアを18カ月未満でマウスにおける原理実証まで進めた。重症型のLAMA2-CMDを対象とした短期マウス試験では、最高用量を投与されたマウスの握力と上腕三頭筋の力は、未治療マウスのおよそ2倍だったとAnthropicは報告した。また、治療群では8匹中1匹が生後2～6週の間に死亡したのに対し、未治療群では8匹中4匹が死亡した。Anthropicは、これらは初期段階のマウス試験の結果であり、患者における安全性や有効性を示すものではないと指摘した。

Mithrilは新たな二重特異性抗体を100種類以上作製し、現在、細胞ベースの試験を進めている。同社は2027年に両疾患の正式な医薬品候補を発表することを目指しており、臨床試験の開始時期は、LAMA2-CMDでは早ければ2028年後半、α-ジストログリカノパチーでは早ければ2029年を見込んでいる。Anthropicはまた、ライフサイエンス分野での取り組みを広げる関連施策として、Claude Scienceのワークベンチ、ライフサイエンス研究者向けのClaudeクレジット、ライフサイエンス検証プログラム、客員研究者の公募を挙げた。