OpenAI Perkenalkan Atlas Penalaran Otak Tikus dari Agen GPT-Rosalind

Pada 21 Oktober 2026, OpenAI mengumumkan bahwa mereka, PerturbAI, dan Scripps Research menggunakan ribuan agen AI yang didukung GPT-Rosalind untuk menganalisis data eksperimen yang sudah ada dari jutaan sel otak tikus dalam 32 menit. Laporan para agen kemudian digabungkan menjadi atlas penalaran yang tersedia untuk umum.

Penalaran Biologis Terdistribusi

Pendekatan yang disebut OpenAI sebagai penalaran biologis terdistribusi ini membagi analisis di antara ribuan agen yang memeriksa atlas CRISPR seluruh otak, yakni kumpulan data yang menunjukkan dampak gangguan gen terhadap berbagai jenis sel di seluruh otak tikus. Setiap agen menyelidiki gangguan pada suatu gen, menganalisis respons sel, menelusuri literatur ilmiah, dan mengajukan penjelasan atas hasil yang diperoleh. Laporan para agen digabungkan menjadi atlas penalaran yang menghubungkan gen, dampak pada sel, publikasi terkait, dan kemungkinan mekanisme biologis.

OpenAI menyatakan bahwa tim peneliti memperkirakan analisis dan peninjauan literatur oleh manusia yang sebanding, jika dilakukan satu perturbasi dalam satu waktu, akan memerlukan waktu berbulan-bulan hingga satu tahun. Para agen berhasil mereproduksi temuan dari analisis manusia sekaligus menemukan petunjuk tambahan, dan penilaian mereka atas kebaruan serta nilai ilmiah temuan selaras dengan penilaian para pakar manusia yang tidak mengetahui identitas penilaiannya.

Sarah Teichmann, pemegang jabatan profesor Kedokteran Sel Punca di University of Cambridge dan salah satu ketua pendiri Human Cell Atlas, mengatakan dalam pengumuman OpenAI: “Kami membangun atlas sel agar ilmuwan lain dapat membuat penemuan yang belum pernah kami bayangkan. AI dapat membantu lebih banyak peneliti menjelajahi sumber daya ini dan mengubah pengamatan tak terduga menjadi pertanyaan baru untuk diuji.”

Pracetak pendamping, agen AI terdistribusi memungkinkan penemuan wawasan biologis yang komprehensif dalam skala besar, diunggah ke bioRxiv pada 16 Oktober 2026 dan belum disertifikasi melalui penelaahan sejawat. Para penulisnya berafiliasi dengan Howard Hughes Medical Institute and Scripps Research, OpenAI, PerturbAI, dan University of California San Diego. Xin Jin dari Scripps Research tercantum sebagai penulis korespondensi. Pernyataan konflik kepentingan mengungkapkan bahwa enam penulis adalah karyawan OpenAI, dua penulis adalah karyawan PerturbAI, dan Grace Zheng serta Xin Jin adalah salah satu pendiri PerturbAI.

Perbedaan Tsc2 dan Petunjuk tentang Kolesterol

Menurut pengumuman tersebut, para agen menemukan perbedaan tak terduga antara Tsc1 dan Tsc2, dua gen yang bekerja sama mengendalikan mTOR, regulator utama pertumbuhan, metabolisme, dan penuaan sel. Gangguan pada salah satu gen menimbulkan dampak serupa pada beberapa kelompok neuron. Di serebelum, yang membantu mengoordinasikan gerakan, gangguan Tsc2 mengubah aktivitas puluhan gen yang terlibat dalam komunikasi antarneuron, sedangkan gangguan Tsc1 hanya menimbulkan sedikit perubahan.

Pengumuman itu menyebutkan bahwa, pada penderita sklerosis tuberosa, kelainan di serebelum sangat berkaitan dengan mutasi TSC2. Disebutkan pula bahwa meski obat yang mengurangi aktivitas mTOR dapat mengobati tumor otak dan kejang tertentu, kesulitan belajar dan perilaku yang terkait dengan penyakit tersebut masih sulit ditangani. Para agen menunjukkan kelompok neuron tertentu dan perubahan seluler yang perlu diteliti lebih lanjut.

Para agen juga menemukan petunjuk pada DCTN1, gen yang mutasinya menyebabkan sindrom Perry, penyakit neurodegeneratif dengan gejala mirip Parkinson. DCTN1 berperan dalam memindahkan muatan di dalam neuron, dan dalam atlas tersebut, gangguan pada Dctn1 meningkatkan ekspresi gen yang terlibat dalam produksi kolesterol. Para agen mengaitkan pengamatan itu dengan penelitian yang menunjukkan bahwa masalah pada pengangkutan kolesterol dapat menyebabkan sel memproduksi lebih banyak kolesterol. Hal ini memunculkan pertanyaan lanjutan tentang apakah gangguan DCTN1 mengubah distribusi kolesterol di dalam neuron dan apakah perubahan tersebut dapat berkontribusi terhadap neurodegenerasi. Menurut pengumuman itu, para pakar manusia menilai hipotesis tersebut baru, penting, dan layak ditindaklanjuti.

Tomasz Nowakowski, profesor madya bedah saraf di UCSF, mengatakan bahwa kemungkinan kaitan antara fungsi neuron dan metabolisme kolesterol menunjukkan bagaimana petunjuk yang tersebar di berbagai bidang dapat menawarkan cara baru untuk memahami biologi penyakit setelah dihubungkan.

Agen Terdistribusi Dibandingkan dengan Agen Tunggal

Tim menguji apakah satu agen yang diberi seluruh kumpulan data dapat menyamai kinerja ribuan agen yang bekerja secara paralel, dengan model dan sumber daya yang tetap sama. Seiring bertambahnya beban kerja, agen tunggal menelusuri lebih sedikit literatur dan hanya mencantumkan 11 referensi pada beban kerja terbesar, sedangkan agen terdistribusi mencantumkan lebih dari 700 referensi. Dalam perbandingan tersamar, para pakar manusia memilih laporan agen terdistribusi daripada laporan agen tunggal sebanyak 75% dari keseluruhan penilaian.

Pracetak tersebut melaporkan bahwa, tanpa akses ke manuskrip sumber, para agen berhasil menemukan kembali kesimpulan di dalamnya, memprediksi dampak perturbasi yang disisihkan dari analisis, dan mengidentifikasi hubungan antarperturbasi dengan hasil yang sama atau berlawanan pada berbagai tingkat kekuatan efek. Para penulis menyatakan bahwa agen terdistribusi memperluas cakupan literatur seiring bertambahnya beban kerja, dengan mengambil ratusan kali lebih banyak referensi daripada mode agen tunggal, dan bahwa para pakar manusia yang tidak mengetahui identitas penilaiannya mendukung pemeringkatan temuan oleh para agen.

Akses ke Atlas, Kode, dan Kumpulan Data

Atlas penalaran dan kerangka Distributed Agents yang mendasarinya tersedia untuk umum di repositori GitHub yang dirilis dengan lisensi MIT. Repositori tersebut menyediakan lingkungan eksekusi agen, perangkat untuk mengelola korpus, dan buku catatan yang digunakan untuk analisis, gambar, serta tabel pelengkap dalam naskah. Repositori ini mendokumentasikan layanan korpus terkelola yang hanya dapat dibaca, dengan titik akhir MCP yang menyediakan Temuan, Klaim, bukti pendukung, dan perangkat analisis; karena server terkelola tersebut tidak menyertakan berkas kumpulan data mentah, repositori ini juga menyediakan petunjuk untuk menjalankan kerangka tersebut secara lokal melalui CLI Codex. Komit terbaru repositori tersebut, yang memperbarui sitasi bioRxiv, lisensi, dan dokumentasi layanan terkelola, bertanggal 21 Oktober 2026.

Dataset yang dianalisis adalah atlas whole-brain in vivo CRISPR Perturb-seq milik PerturbAI di Hugging Face. Kartu dataset menjelaskan 7,7 juta sel, 7.739.370 baris dengan total 205 GB, dengan profil nukleus tunggal di 19.070 mRNA dan 8.588 sgRNA, mengukur efek dari hampir 2.000 gen terkait penyakit, dengan anotasi sel yang diambil dari Taksonomi Otak Tikus Utuh Institut Allen. Kartu ini mengidentifikasi manuskrip bioRxiv Maret 2026, “Pemetaan fungsional skala genom otak mamalia secara keseluruhan dengan in vivo Perturb-seq,” sebagai publikasi yang mendasari atlas ini.

OpenAI menyatakan bahwa peneliti dapat menggunakan atlas tersebut untuk membandingkan gen-gen terkait, menyelidiki respons yang tak terduga, dan mengidentifikasi petunjuk menjanjikan untuk ditindaklanjuti. OpenAI juga menyatakan bahwa temuan tersebut membantu menentukan prioritas eksperimen lanjutan yang diperlukan untuk menguji mekanisme biologis yang diajukan.