Нахид Курджи, сооснователь, президент и генеральный директор Cyclica – Интервью

Нахид Курджи является президентом и генеральным директором Cyclica, торонтской биотехнологической компании, которая использует искусственный интеллект и вычислительную биофизику для изменения процесса открытия лекарств. Cyclica предоставляет фармацевтической промышленности интегрированную, целостную и комплексную платформу, которая улучшает то, как ученые проектируют, тестируют и персонализируют лекарства для пациентов, и недавно была признана компанией Deep Knowledge Analytics одним из лучших 20 компаний в области ИИ в фармацевтике.

Cyclica использует искусственный интеллект и вычислительную биофизику для изменения процесса открытия лекарств. Можете ли вы рассказать, каким образом ИИ используется в этом процессе?

Технологии играли решающую роль в открытии лекарств с 80-х годов. Однако процесс открытия и разработки лекарств все еще очень неэффективен, длительный и дорогой, стоимостью более 2 миллиардов долларов за 12 лет. Плохая эффективность часто приводит к высоким уровням отсева и неудовлетворению требований безопасности и эффективности лекарств. Исследователи знают об этом и активно ищут инструменты для целостного понимания качеств, которые определяют лучшие лекарства, чтобы разработать более безопасные и эффективные лекарства.

Недавние достижения в облачных вычислениях, ИИ и биофизике создали возможность получить глубокое понимание из огромного количества биохимических, биологических, медицинских и пациентских данных, чтобы лучше понять заболевания. Эти достижения также позволили медикам-химикам улучшить проектирование новых терапий и использовать ИИ для получения более точных прогнозов на ранних этапах процесса разработки лекарств. В Cyclica мы разработали собственные движки глубокого обучения, MatchMaker и POEM, для поддержки процесса проектирования лекарств. MatchMaker предсказывает, как химические соединения и лекарства взаимодействуют с несколькими белками, известными как полифармакология. Мы обнаружили, что сочетание знаний и структуры-основанного подхода дало наибольшую прогностическую точность и производительность. POEM (Парето-оптимальное встроенное моделирование) – это параметр-свободный подход к построению моделей прогнозирования свойств лекарств и решает несколько ограничений других подходов ИИ, что приводит к меньшему переобучению и повышению интерпретируемости.

В Cyclica мы используем ИИ, чтобы предоставить ученым прочную и проверенную платформу для ускорения принятия решений и генерации гипотез, чтобы увеличить общую эффективность процесса открытия лекарств и уменьшить количество неудач на более поздних этапах.

Cyclica разработала платформу Ligand Design и Ligand Express, что это именно?

Мы первая компания, которая подходит к вычислительной полифармакологии (признание того, что лекарства взаимодействуют с несколькими мишенями) с интегрированной платформой открытия лекарств, которая исследует молекулярные взаимодействия на уровне протеома. Наша платформа состоит из двух ключевых компонентов: Ligand Express, нашей первой платформы профилирования и деконволюции мишеней, и Ligand Design, нашей следующей платформы проектирования лекарств. Ligand Express и Ligand Design работают на двух внутренних движках машинного обучения и глубокого обучения: MatchMaker и POEM. Основанные на биофизике белков, MatchMaker – это движок глубокого обучения для взаимодействия лекарств и мишеней, который обобщает как данные- богатые, так и данные- бедные мишени. POEM, технология машинного обучения, реализованная для прогнозирования свойств ADME, – это новый, параметр-свободный подход к построению моделей.

Все вместе Ligand Design и Ligand Express предлагают мощную платформу открытия лекарств, которая позволяет проектировать передовые, химически новые молекулы, которые одновременно отдают приоритет соединениям на основе их полифармакологического профиля, эффективно минимизируя нежелательные эффекты. Наша дифференцированная платформа открывает новые возможности для открытия лекарств, включая многомишенные и многоцелевые проектирования лекарств, оптимизацию лидов, прогнозирование свойств ADME, деконволюцию мишеней и репозиционирование лекарств. Благодаря разнообразной и высококвалифицированной команде с глубоким опытом в области машинного обучения, вычислительной биофизики/химии/биологии, биохимии и медико-химии, мы продолжаем инновации через нашу прочную линию исследований и разработок.

Насколько важно децентрализовать открытие лекарств для бизнес-модели Cyclica?

Наша видение – децентрализовать открытие лучших лекарств, сочетая наши глубокие корни в искусственном интеллекте и биофизике белков с инновационной бизнес-моделью. И в сердце эфики Cyclica лежит непоколебимое желание помочь пациентам, продвигая открытие и разработку лучших лекарств, принимая целостный, но персонализированный подход.

Для этого мы считаем, что будущее открытия лекарств находится в руках инновационных исследовательских учреждений и биотехнологических компаний (о чем мы написали в Forbes здесь). Поддерживая нашу философию, в 2019 году IQIVIA сообщила, что биотехнологические компании занимают более 70% общего количества исследований и разработок (по сравнению с 50% в 2003 году), и что эти компании запатентовали более 2/3 новых лекарств в 2018 году (по сравнению с 50% в 2010 году). Хотя биотехнологические компании будут лидировать в инновациях в открытии лекарств, крупная фармацевтика будет продолжать инвестировать в продвижение клинических испытаний и проникновение на рынок через свои каналы продаж.

С помощью нашего финансирования серии B мы ускорим коммерческие планы по продвижению растущего портфеля препринтов и клинических активов через инновационную децентрализованную модель партнерства. Наша цель – создать и владеть сотнями программ открытия лекарств в нескольких терапевтических областях. Эти программы создаются через спин-оффы и совместные предприятия (СВ) с лучшими исследовательскими учреждениями, облегченными в основном через программу академического партнерства Cyclica (CAPP).

Стимулируемые быстро растущим портфелем из более чем 30 активных и развивающихся программ открытия лекарств, мы продолжим инновации через комбинацию создания предприятий и партнерства с биотехнологическими компаниями на ранних этапах. Недавние партнерства включают EntheogeniX Biosciences, NineteenGale Therapeutics, Rosetta Therapeutics, ускоритель лекарств от редких заболеваний и два секретных СВ, охватывающих более 50 программ в нескольких терапевтических областях. Выполняя нашу децентрализованную бизнес-модель, создавая новые компании через спин-оффы и СВ и помогая им масштабироваться, мы фактически создаем биотехнологический конвейер будущего.

Многие ваши технологии основаны на облачных вычислениях, почему это так важно?

Доступ к облачным вычислениям позволяет нам масштабировать вычислительные потоки, которые мы проводим, а также выигрывать от регулируемой безопасности инфраструктуры. Кроме того, как компания на ранней стадии, возможность запуска и работы в облаке без необходимости инвестировать в наш собственный аппаратное обеспечение была критически важна для финансовой жизнеспособности в наши ранние дни. Смотря вперед, хотя большая часть нашей работы по исследованию и разработкам проводится в облаке, за последние несколько лет мы стали менее зависимыми от облака, с возможностью запуска проектов на отдельных машинах. Мы также стремимся поддерживать частные облачные установки, поскольку это то, что, как мы считаем, могут желать наши партнеры. Технологические достижения сделали возможным то, что можно сделать на личном ноутбуке, что ранее требовало многих машин в облаке, но продолжая использовать облако, мы можем значительно расширить объем проблем, которые мы решаем.

Cyclica часто принимает доли в компаниях, с которыми они сотрудничают. Можете ли вы обсудить бизнес-логику за этим?

Меньшие биотехнологические компании и академические группы обычно упускаются из виду рынком в плане партнерских возможностей. Хотя они могут не иметь ресурсов, инфраструктуры или объектов по сравнению с зрелыми крупными фармацевтическими компаниями, небольшие биотехнологические компании все чаще привлекают внимание с комбинацией глубокой экспертизы в конкретных показаниях и преимуществами гибкой организации, способствующей быстрому инновациям.

Это заставило нас подумать, как мы можем взаимодействовать с этими небольшими компаниями с авангардной стратегией. Мы сотрудничаем с учеными в исследовательских организациях, которые заинтересованы в создании компании или ранних биотехнологических компаниях, и предоставляем им нашу платформу открытия лекарств, усиленную ИИ, через взносы в натуральной форме. В ответ мы принимаем доли в компаниях и/или делимся владением соединениями и активами, которые создаются и преследуются. Способствуя всплеску инноваций через комбинацию создания предприятий и партнерства, мы можем захватить большую ценность и развивать долгосрочные отношения с нашими партнерами, чтобы решить спектр неудовлетворенных медицинских потребностей и улучшить жизнь пациентов.

Entheogenix Biosciences – это совместное предприятие между Cyclica и ATAI Life Science. Что именно такое Entheogenix Biosciences?

Существует уникальная возможность инноваций в нейропсихиатрическом ландшафте, чтобы лучше обслуживать пациентов, страдающих от сложных психических заболеваний. Текущие лекарства и терапии, которые полагаются на воздействие на одну мишень, часто не оправдывают ожиданий, требуя от пациентов принимать несколько лекарств, которые могут представлять потенциальные проблемы безопасности, а также снижать приверженность лечению. Мы сотрудничаем с ATAI Life Science, чтобы использовать их глубокий опыт в области психического здоровья и психоделиков, а также предоставить им нашу платформу открытия лекарств, усиленную ИИ, чтобы создать не только новые лекарства, но и правильные, чтобы решить психические заболевания. Entheogenix Biosciences – одно из многих совместных предприятий, которые мы сформировали, и является свидетельством нашей веры в изменение парадигмы, в которой лечатся психические расстройства, введя нашу платформу, устойчивую к заболеваниям, прочную и научно обоснованную вычислительную платформу, в руки экспертов и мировых ученых.

Есть ли что-то еще, что вы хотели бы поделиться о Cyclica?

Хотя мы очень рады поделиться объявлением о нашем раунде финансирования серии B, мы также с нетерпением ждем запуска программы академического партнерства Cyclica (CAPP) и новых партнерств в течение следующих нескольких месяцев.

Спасибо за интервью. Я с нетерпением жду возможности следить за будущим прогрессом Cyclica.