OpenAI lanserer resonneringsatlas over musehjernen fra GPT-Rosalind-agenter

OpenAI kunngjorde 21. oktober 2026 at selskapet, PerturbAI og Scripps Research hadde brukt tusenvis av AI-agenter drevet av GPT-Rosalind til å analysere eksisterende eksperimentelle data fra millioner av musehjerneceller på 32 minutter. Agentenes rapporter ble samlet i et offentlig tilgjengelig resonneringsatlas.

Distribuert biologisk resonnering

Metoden, som OpenAI kaller distribuert biologisk resonnering, fordelte analysen mellom tusenvis av agenter som undersøkte en CRISPR-atlas over hele hjernen – et datasett som viser hvordan genforstyrrelser påvirker ulike celletyper i musehjernen. Hver agent undersøkte en genforstyrrelse, analyserte cellenes reaksjoner, søkte i den vitenskapelige litteraturen og foreslo forklaringer på resultatene. Agentenes rapporter ble samlet i et resonneringsatlas som knytter sammen gener, cellepåvirkninger, relevante publikasjoner og mulige biologiske mekanismer.

OpenAI opplyste at forskerteamet anslo at en tilsvarende analyse og litteraturgjennomgang utført av mennesker, én perturbasjon om gangen, ville tatt fra flere måneder til ett år. Agentene gjenskapte funn fra menneskelige analyser, samtidig som de avdekket flere mulige spor. Vurderingene deres av hvor nyskapende og vitenskapelig verdifulle funnene var, samsvarte med vurderingene fra blindede menneskelige eksperter.

Sarah Teichmann, professor i stamcellemedisin ved University of Cambridge og grunnleggende medleder for Human Cell Atlas, sa i OpenAIs kunngjøring: «Vi bygger celleatlaser slik at andre forskere kan gjøre oppdagelser vi ennå ikke har forestilt oss. AI kan hjelpe flere forskere med å utforske disse ressursene og gjøre uventede observasjoner om til nye spørsmål som kan undersøkes.»

Et tilhørende preprint, Distribuerte AI-agenter muliggjør omfattende oppdagelser av biologisk innsikt i stor skala, ble lagt ut på bioRxiv 16. oktober 2026 og er ikke fagfellevurdert. Forfatterne er tilknyttet Howard Hughes Medical Institute and Scripps Research, OpenAI, PerturbAI og University of California San Diego. Xin Jin fra Scripps Research er oppført som korresponderende forfatter. Erklæringen om interessekonflikter opplyser at seks av forfatterne er ansatt i OpenAI, to er ansatt i PerturbAI, og at Grace Zheng og Xin Jin er medgrunnleggere av PerturbAI.

Forskjeller mellom Tsc2 og Tsc1 og et spor knyttet til kolesterol

Ifølge kunngjøringen fant agentene en uventet forskjell mellom Tsc1 og Tsc2, to gener som samarbeider om å regulere mTOR, en viktig regulator av cellevekst, stoffskifte og aldring. Forstyrrelser i hvert av genene hadde lignende virkninger i flere grupper av nerveceller. I lillehjernen, som bidrar til å koordinere bevegelser, endret forstyrrelser i Tsc2 aktiviteten til flere titalls gener som er involvert i kommunikasjon mellom nerveceller, mens forstyrrelser i Tsc1 førte til liten endring.

Kunngjøringen påpeker at avvik i lillehjernen hos personer med tuberøs sklerose er sterkt knyttet til TSC2-mutasjoner, og at selv om legemidler som reduserer mTOR-aktiviteten kan behandle visse hjernesvulster og anfall, er det fortsatt utfordrende å behandle lærevanskene og atferdsvanskene som er forbundet med sykdommen. Agentene identifiserte en bestemt gruppe nerveceller og celleforandringer som bør undersøkes nærmere.

Agentene fant også et interessant spor knyttet til DCTN1, et gen der mutasjoner forårsaker Perry-syndrom, en nevrodegenerativ sykdom med Parkinson-lignende symptomer. DCTN1 er involvert i transport av materiale inne i nerveceller, og i atlaset førte forstyrrelser i Dctn1 til økt uttrykk av gener som er involvert i kolesterolproduksjon. Agentene knyttet denne observasjonen til forskning som tyder på at problemer med kolesteroltransport kan føre til at celler produserer mer kolesterol. Dette reiser nye spørsmål om hvorvidt forstyrrelser i DCTN1 endrer fordelingen av kolesterol inne i nerveceller, og om slike endringer kan bidra til nevrodegenerasjon. Ifølge kunngjøringen vurderte menneskelige eksperter hypotesen som nyskapende, betydningsfull og verdt å følge opp.

Tomasz Nowakowski, førsteamanuensis i nevrokirurgi ved UCSF, sa at den mulige sammenhengen mellom nervecellenes funksjon og kolesterolstoffskiftet viser hvordan spor fra ulike fagområder kan gi en ny måte å forstå sykdomsbiologi på når de ses i sammenheng.

Distribuerte agenter sammenlignet med én enkelt agent

Teamet undersøkte om én enkelt agent som fikk tilgang til hele datasettet, kunne måle seg med tusenvis av agenter som arbeidet parallelt, mens modellen og ressursene ble holdt uendret. Etter hvert som arbeidsmengden økte, søkte den ene agenten i mindre deler av litteraturen og viste til bare 11 referanser ved den største arbeidsmengden, mens de distribuerte agentene viste til mer enn 700. I blindede sammenligninger foretrakk menneskelige eksperter rapportene fra de distribuerte agentene fremfor rapportene fra den ene agenten i 75 % av tilfellene.

Preprintet opplyser at agentene, uten tilgang til kildemanuskriptet, gjenskapte konklusjonene, forutsa effekter av perturbasjoner som var holdt utenfor analysen, og identifiserte sammenhenger mellom perturbasjoner med felles eller motstridende utfall på tvers av ulike effektstyrker. Forfatterne skriver at de distribuerte agentene dekket en større del av litteraturen etter hvert som arbeidsmengden økte, og fant hundrevis av ganger flere referanser enn i modusen med én enkelt agent. De opplyser også at blindede menneskelige eksperter støttet rangeringen av agentenes oppdagelser.

Tilgang til atlaset, koden og datasettet

Resonnementatlaset og det underliggende Distributed Agents-rammeverket er offentlig tilgjengelig i et GitHub-repositorium utgitt under MIT-lisensen. Repositoriet inneholder agentens kjøretidsmiljø, verktøy for korpuset og notatbøkene som ble brukt til analysene, figurene og tilleggstabellene i manuskriptet. Det dokumenterer en driftet, skrivebeskyttet korpustjeneste med MCP-endepunkter som gir tilgang til funn, påstander, støttende dokumentasjon og analyseverktøy. Siden den driftede serveren ikke inneholder rådatafilene, gir repositoriet også instruksjoner for å kjøre rammeverket lokalt via Codex CLI. Repositoriets siste innsjekking, som oppdaterte bioRxiv-siteringen, lisensen og dokumentasjonen for den driftede tjenesten, er datert 21. oktober 2026.

Det analyserte datasettet er PerturbAIs helhjernen in vivo CRISPR Perturb-seq-atlas på Hugging Face. Datasettkortet beskriver 7,7 millioner celler, 7 739 370 rader som til sammen utgjør 205 GB, med enkeltkjerneprofilering på tvers av 19 070 mRNA-er og 8 588 sgRNA-er, og måler effekten av nesten 2000 sykdomsrelaterte gener, med celleannoteringer hentet fra Allen Institute Whole Mouse Brain Taxonomy. Kortet identifiserer et bioRxiv-manuskript fra mars 2026, “Genome-skala funksjonell kartlegging av hele pattedyrhjernen med in vivo Perturb-seq,” som atlasets underliggende publikasjon.

OpenAI sa at forskere kan bruke atlaset til å sammenligne beslektede gener, undersøke uventede responser og identifisere lovende spor å følge opp, og at funnene bidrar til å prioritere de videre forsøkene som trengs for å teste de foreslåtte biologiske mekanismene.