Consorzio COVID-19 Open AI – Intervista con il dottor Stephen Weng, Principal Investigator

Il Consorzio COVID-19 Open AI (COAI) intende portare scoperte mediche innovative e risultati azionabili nella lotta contro la pandemia di COVID-19.

COAI mira a aumentare la ricerca collaborativa, ad accelerare lo sviluppo clinico di trattamenti efficaci per il COVID-19 e a condividere tutti i suoi risultati con la comunità medica e scientifica globale. COAI unirà collaboratori: istituzioni accademiche, ricercatori, scienziati dei dati e partner industriali, per combattere la pandemia di COVID-19.

Questa è la seconda di tre interviste con i principali leader dietro COAI. La prima intervista è stata con Sanjay Budhdeo, MD, Business Development di Owkin.

Stephen Weng è un Assistant Professor di Epidemiologia Integrata e Scienza dei Dati che guida la ricerca sulla scienza dei dati all’interno del Gruppo di Ricerca sulla Medicina Stratificata della Cura Primaria.

Integra metodi epidemiologici tradizionali e progettazione dello studio con nuovi approcci basati sull’informatica, sfruttando e interrogando i “big data sanitari” dai registri medici elettronici per lo scopo di modellazione della predizione del rischio, fenotipizzazione delle malattie croniche, ricerca sui metodi della scienza dei dati e traduzione della medicina stratificata nella cura primaria.

Recentemente si è unito al Consorzio COVID-19 Open AI (COAI) come principale investigatore. Può discutere cosa l’ha spinto a unirsi a questo progetto?

Ho collaborato con Owkin e partner europei in progetti volti a migliorare la prevenzione secondaria per la sindrome coronarica acuta nell’ultimo anno. Quando Owkin ha lanciato il Consorzio COVID-19 Open AI per sfruttare la loro tecnologia, l’esperienza e la nostra infrastruttura per contribuire alla lotta globale contro il COVID-19, questa è stata una scelta ovvia e una scelta naturale per unirsi al consorzio. Abbiamo ottimi partner che sono cardiologi di spicco in Europa tra il nostro gruppo di investigatori del nostro consorzio precedente. Utilizzando queste risorse e competenze, possiamo muoverci molto rapidamente e a un ritmo per lanciare questo consorzio nell’arco di poche settimane e migliorare la nostra comprensione della progressione della malattia, dell’eziologia sottostante e dei fattori di rischio nelle nostre popolazioni.

Una percentuale della popolazione colpita dal COVID-19 mostra segni di danni cardiovascolari. Quali sono i problemi di cuore che si stanno verificando?

C’è evidenza che emerge che i fattori di rischio cardiovascolari e le malattie cardiovascolari sono un contributo significativo alla gravità della malattia. Un’analisi recente di 17.000 casi di COVID-19 che richiedevano ricovero in ospedale nel Regno Unito ha identificato che la malattia cardiaca era presente nel 29% di tutti i casi ricoverati. I fattori di rischio cardiovascolari sottostanti, tra cui l’età avanzata, l’ipertensione, l’obesità, l’ipertensione e il diabete di tipo 2, contribuiscono in modo significativo alla gravità della malattia.

Credi che attualmente abbiamo una comprensione di perché il COVID-19 provoca questo tipo di danno al cuore?

Ci sono ancora molte domande che devono essere risposte intorno all’epidemiologia intorno alla progressione e alla gravità del COVID-19, in particolare per quanto riguarda i pazienti con malattie cardiache. I pazienti con malattie cardiache sono a rischio aumentato di esperire una malattia grave che può richiedere un supporto cardiorespiratorio in un’unità di cura intensiva. La gravità del COVID-19 e la progressione verso esiti gravi è probabilmente guidata da un danno diretto al sistema cardiovascolare, che può essere acuto. Il tipo esatto di lesione cardiaca nei pazienti con COVID-19 richiede ulteriori indagini.

Qual sarà il tuo ruolo all’interno di COAI?

Sono un epidemiologo e uno scienziato dei dati con un focus di ricerca sulla prognosi degli esiti cardiovascolari. Gran parte del mio lavoro è un’analisi approfondita di grandi set di dati per rispondere a queste domande cliniche. Nel mio ruolo, oltre a cercare di rispondere a queste importanti domande di ricerca sfruttando la mia capacità di accedere a grandi set di dati della popolazione, sto anche cercando di facilitare altri accademici e colleghi a contribuire al nostro consorzio.

Quali sono le persone di cui abbiamo bisogno per unirsi al progetto COAI per massimizzare la sua efficacia?

Non è importante solo ottenere un numero maggiore di scienziati e colleghi clinici che contribuiscono con i dati, ma abbiamo anche bisogno di aumentare la diversità delle nostre risorse di dati. Sappiamo che il COVID-19 ha uno spettro ampio di gravità, da individui asintomatici a malattie molto gravi che risultano in morte. Sono necessari diversi tipi di dati in tutto lo spettro degli ambienti sanitari, dalla cura primaria alla cura secondaria, per rispondere a queste domande sulla progressione e sulla gravità della malattia.

Attualmente sei un Assistant Professor di Epidemiologia Integrata e Scienza dei Dati che guida la ricerca sulla scienza dei dati all’interno del Gruppo di Ricerca sulla Medicina Stratificata della Cura Primaria dell’Università di Nottingham. Può discutere possibili modi in cui i big data possono essere utilizzati per contrastare il COVID-19 con le informazioni che abbiamo attualmente?

Abbiamo alcuni grandi set di dati che possiamo sfruttare. Le grandi vittorie sono stati gli investimenti recenti nella connessione dei dati, che sono stati messi in azione e stiamo iniziando a vedere questi sforzi portare grandi risultati. In effetti, stiamo iniziando a ottenere l’accesso a grandi coorti di popolazione che sono state collegate ai registri di cura primaria, ai registri ospedalieri, ai registri dei decessi e ai dati di testing del COVID-19. Inoltre, questi dati offrono opportunità per indagare gli influssi genetici sugli esiti del COVID-19. Queste connessioni sono rese possibili solo con la crescita dei collegamenti dei big data e dei grandi biobanche di popolazione. A causa della quantità di dati e delle variabili raccolte, i modelli di intelligenza artificiale che Owkin ha sviluppato e perfezionato sono davvero utili per analizzare i dati in modo efficiente e derivare informazioni significative.

Quali informazioni dobbiamo raccogliere per rendere la medicina di precisione uno strumento efficace nel trattamento dei pazienti con COVID-19?

Un array più diversificato di tipi di dati, tra cui immagini, genetica, biomarcatori insieme a caratteristiche cliniche e demografia dei pazienti.

Nel mondo ideale, quali dati dovrebbero essere raccolti dai pazienti con COVID-19?

In una malattia così nuova come il COVID-19, non credo che ci sia un limite massimo di dati necessari. C’è un termine “non sappiamo cosa non sappiamo ancora”, quindi più tipi di dati e informazioni possiamo raccogliere adesso, potrebbero essere utili in futuro. Ad esempio, quanti progressi genetici abbiamo fatto perché siamo stati in grado di sequenziare i dati e mantenerli accessibili per i ricercatori nelle banche biologiche? Vedrei questo accadere con il COVID-19. Se creiamo una risorsa di dati diversificata e grande adesso, non ho dubbi che emergeranno nuove scoperte per aiutare la nostra comprensione in futuro.

Dovremmo anche raccogliere dati dal segmento della popolazione che è immune al COVID-19, per capire meglio cosa li rende immuni?

Nell’epidemiologia, la scelta del gruppo di confronto è estremamente importante. Il rischio in molti sensi è relativo. Se la nostra base inizia con l’ammissione in ospedale, allora stiamo capendo la malattia solo in coloro che presentano sintomi più gravi. Credo che una migliore comprensione degli individui asintomatici e di cosa li rende asintomatici nei confronti del COVID-19 sia assolutamente necessaria. Quanti trattamenti sono stati sviluppati grazie all’indagine sulle mutazioni di guadagno o di perdita di funzione che si verificano naturalmente nelle popolazioni.

Grazie per l’intervista fantastica. I lettori che desiderano saperne di più, possono leggere il nostro articolo che descrive il progetto COAI.

La prima intervista di questa serie è stata con Sanjay Budhdeo, MD, Business Development di Owkin.

La terza intervista di questa serie è stata con Folkert W. Asselbergs, Principal Investigator

È possibile visitare il sito web del Consorzio COVID-19 Open AI.