Konsorsium AI Terbuka COVID-19 – Wawancara dengan Dr. Stephen Weng, Penyelidik Utama

Konsorsium AI Terbuka COVID-19 (COAI) bertujuan membawa penemuan medis yang inovatif dan temuan yang dapat diambil tindakan untuk melawan pandemi COVID-19.

COAI bertujuan meningkatkan penelitian kolaboratif, untuk mempercepat pengembangan klinis pengobatan efektif untuk COVID-19, dan untuk berbagi semua temuan dengan komunitas medis dan ilmiah global. COAI akan menyatukan kolaborator: lembaga akademik, peneliti, ilmuwan data, dan mitra industri, untuk melawan pandemi COVID-19.

Ini adalah kedua dari tiga wawancara dengan pemimpin utama di balik COAI. Wawancara pertama adalah dengan Owkin’s Sanjay Budhdeo, MD, Business Development.

Stephen Weng adalah Asisten Profesor Epidemiologi Terintegrasi dan Ilmu Data yang memimpin penelitian ilmu data dalam Kelompok Penelitian Medis Stratifikasi Primer.

Dia mengintegrasikan metode epidemiologi tradisional dan desain studi dengan pendekatan berbasis informasi baru, menggunaan dan menginterogasi “data perawatan kesehatan besar” dari catatan medis elektronik untuk tujuan pemodelan prediksi risiko, fenotipik penyakit kronis, penelitian metode ilmu data, dan terjemahan medis stratifikasi ke perawatan primer.

Anda baru saja bergabung dengan Konsorsium AI Terbuka COVID-19 (COAI) sebagai penyelidik utama. Bisakah Anda membahas apa yang membuat Anda bergabung dengan proyek ini?

Saya telah berkolaborasi dengan Owkin dan mitra Eropa dalam proyek yang bertujuan meningkatkan pencegahan sekunder untuk sindrom koroner akut selama setahun terakhir. Ketika Owkin meluncurkan Konsorsium AI Terbuka COVID-19 untuk menggunakan teknologi, keahlian, dan infrastruktur kami untuk berkontribusi pada perjuangan global melawan COVID-19, ini adalah pilihan yang jelas dan cocok untuk bergabung dengan konsorsium. Kami memiliki mitra yang sangat baik yang merupakan ahli jantung terkemuka di Eropa di antara kelompok penyelidik kami dari konsorsium sebelumnya. Dengan menggunakan sumber daya dan keahlian ini, kami dapat bergerak sangat cepat dan pada kecepatan untuk meluncurkan konsorsium ini dalam waktu beberapa minggu dan pada akhirnya meningkatkan pemahaman kami tentang progresi penyakit, aetiology yang mendasarinya, dan faktor risiko dalam populasi kami.

Sebagian dari populasi yang terkena COVID-19 menunjukkan tanda-tanda kerusakan jantung. Apa jenis masalah jantung yang sedang terlihat?

Terdapat bukti yang muncul bahwa faktor risiko kardiovaskuler dan penyakit kardiovaskuler adalah kontributor utama terhadap keparahan penyakit. Analisis baru-baru ini dari 17000 kasus COVID-19 yang memerlukan rawat inap di Inggris mengidentifikasi bahwa penyakit jantung hadir pada 29% dari semua kasus rawat inap. Faktor risiko kardiovaskuler yang mendasarinya, termasuk usia yang meningkat, tekanan darah tinggi, obesitas, hipertensi, dan diabetes tipe 2, menyumbang secara signifikan terhadap keparahan penyakit.

Apakah Anda percaya bahwa kita saat ini memiliki pemahaman tentang mengapa COVID-19 menyebabkan kerusakan jantung seperti itu?

Masih banyak pertanyaan yang perlu dijawab seputar epidemiologi seputar progresi dan keparahan COVID-19, terutama mengenai pasien dengan penyakit jantung. Pasien dengan penyakit jantung berisiko lebih tinggi mengalami sakit parah yang mungkin memerlukan dukungan kardiorespirasi di unit perawatan intensif. Keparahan COVID-19 dan progresinya menuju hasil yang parah kemungkinan dipengaruhi oleh cedera langsung pada sistem kardiovaskuler, yang mungkin akut. Jenis cedera jantung pada pasien COVID-19 memerlukan investigasi lebih lanjut.

Apa peran Anda dengan COAI?

Saya adalah seorang epidemiolog dan ilmuwan data dengan fokus penelitian pada prognosis hasil kardiovaskuler. Sebagian besar pekerjaan saya adalah penyelaman dalam dataset yang sangat besar untuk menjawab pertanyaan klinis ini. Dalam peran saya, serta mencoba menjawab beberapa pertanyaan penelitian yang penting dengan menggunakan kemampuan saya untuk mengakses dataset populasi yang besar, saya juga mencoba memfasilitasi akademisi dan rekan lain untuk berkontribusi pada konsorsium kami.

Jenis apa orang yang kita butuhkan untuk bergabung dengan proyek COAI agar maksimal efektivitasnya?

Tidak hanya penting untuk mendapatkan jumlah yang lebih besar dari ilmuwan dan rekan klinis yang berkontribusi data, tetapi kita juga perlu meningkatkan keragaman sumber daya data. Kita tahu COVID-19 memiliki spektrum keparahan yang luas dari individu asimtomatik hingga penyakit yang sangat parah yang menghasilkan kematian. Berbagai jenis data di seluruh spektrum pengaturan perawatan kesehatan dari perawatan primer hingga perawatan sekunder diperlukan untuk menjawab pertanyaan tentang progresi penyakit dan keparahan.

Anda saat ini adalah Asisten Profesor Epidemiologi Terintegrasi dan Ilmu Data yang memimpin penelitian ilmu data dalam Kelompok Penelitian Medis Stratifikasi Primer Universitas Nottingham. Bisakah Anda membahas cara big data dapat digunakan untuk menargetkan COVID-19 dengan informasi yang kita miliki saat ini?

Kita memiliki beberapa dataset besar yang dapat kita gunakan. Kemenangan besar telah menjadi investasi baru-baru ini dalam tautan data yang benar-benar dilakukan dan kita mulai melihat inisiatif ini menghasilkan buah. Faktanya, kita sedang memulai untuk mendapatkan akses ke kohort populasi besar yang telah ditautkan ke perawatan primer, catatan rumah sakit, registri kematian, dan data pengujian COVID-19. Selain itu, data ini memiliki kesempatan untuk menyelidiki pengaruh genetik pada hasil COVID-19. Tautan ini hanya mungkin dilakukan dengan munculnya tautan data besar dan biobank populasi besar. Karena jumlah data dan variabel yang dikumpulkan, model AI yang dikembangkan oleh Owkin sangat berguna untuk menganalisis data dengan kecepatan untuk menghasilkan wawasan yang bermakna.

Apa informasi yang kita butuhkan untuk mengumpulkan untuk membuat kedokteran presisi menjadi alat yang efektif dalam mengobati pasien COVID-19?

Lebih banyak jenis data, termasuk citra, genetik, biomarker, serta fitur klinis dan demografi pasien.

Dalam dunia yang ideal, apa jenis data yang seharusnya dikumpulkan dari pasien COVID-19?

Dalam penyakit yang baru seperti COVID-19, saya tidak pikir ada batas atas data yang diperlukan. Ada istilah “kita tidak tahu apa yang kita tidak tahu”, jadi semakin banyak jenis data dan informasi yang dapat kita kumpulkan sekarang, mungkin akan berguna di masa depan. Misalnya, berapa banyak kemajuan genomik yang telah kita alami karena kita dapat mengurutkan data dan menjaganya tetap dapat diakses untuk peneliti di biobank? Saya melihat ini terjadi pada COVID-19. Jika kita menciptakan sumber daya data yang beragam dan besar sekarang, saya tidak ragu bahwa akan ada temuan baru yang muncul untuk membantu pemahaman kita di masa depan.

Apakah kita juga harus mengumpulkan data dari segmen populasi yang kebal terhadap COVID-19, agar lebih memahami apa yang membuat mereka kebal?

Dalam epidemiologi, pilihan kelompok pembanding sangat penting. Risiko dalam banyak hal adalah relatif. Jika dasar kita dimulai dengan dirawat di rumah sakit, maka kita hanya memahami aetiology penyakit pada mereka yang menunjukkan gejala yang lebih parah. Saya pikir pemahaman yang lebih baik tentang individu asimtomatik dan apa yang membuat mereka asimtomatik terhadap COVID-19 sangat diperlukan. Berapa banyak terapi yang dikembangkan karena menyelidiki mutasi fungsional atau kehilangan fungsional yang terjadi secara alami dalam populasi.

Terima kasih atas wawancara yang fantastis. Pembaca yang ingin mempelajari lebih lanjut, dapat membaca artikel kami yang menjelaskan proyek COAI.

Wawancara pertama dalam seri ini adalah dengan Owkin’s Sanjay Budhdeo, MD, Business Development.

Wawancara ketiga dalam seri ini adalah dengan Folkert W. Asselbergs, Penyelidik Utama

Anda juga dapat mengunjungi situs web Konsorsium AI Terbuka COVID-19.