OpenAI presenta un atlas de razonamiento sobre el cerebro del ratón creado por agentes GPT-Rosalind

El 21 de octubre de 2026, OpenAI anunció que, junto con PerturbAI y Scripps Research, utilizó miles de agentes de IA basados en GPT-Rosalind para analizar, en 32 minutos, datos experimentales existentes de millones de células cerebrales de ratón y reunir los informes de los agentes en un atlas de razonamiento de acceso público.

Razonamiento biológico distribuido

El método, al que OpenAI denomina razonamiento biológico distribuido, repartió el análisis entre miles de agentes que examinaron un atlas CRISPR de todo el cerebro: un conjunto de datos que muestra cómo las alteraciones de genes afectan a distintos tipos de células en el cerebro del ratón. Cada agente investigó una alteración genética, analizó las respuestas celulares, consultó la literatura científica y propuso explicaciones para los resultados. Los informes de los agentes se combinaron en un atlas de razonamiento que vincula genes, efectos celulares, publicaciones pertinentes y posibles mecanismos biológicos.

OpenAI afirmó que el equipo de investigación calculó que un análisis humano comparable, incluida la revisión de la literatura y realizado de una perturbación a la vez, llevaría entre varios meses y un año. Los agentes reprodujeron los hallazgos de los análisis humanos y, al mismo tiempo, descubrieron nuevas pistas; además, sus evaluaciones de novedad y valor científico coincidieron con las valoraciones de expertos humanos que desconocían los resultados.

Sarah Teichmann, titular de la cátedra de Medicina de Células Madre de la University of Cambridge y copresidenta fundadora del Human Cell Atlas, dijo en el anuncio de OpenAI: «Creamos atlas celulares para que otros científicos puedan hacer descubrimientos que aún no hemos imaginado. La IA podría ayudar a más investigadores a explorar estos recursos y convertir observaciones inesperadas en nuevas preguntas que poner a prueba».

Un preprint complementario, Los agentes de IA distribuidos permiten descubrir de forma exhaustiva conocimientos biológicos a gran escala, se publicó en bioRxiv el 16 de octubre de 2026 y aún no ha sido certificado mediante revisión por pares. Sus autores están afiliados al Howard Hughes Medical Institute y Scripps Research, OpenAI, PerturbAI y la University of California San Diego; Xin Jin, de Scripps Research, figura como autor de correspondencia. La declaración de conflictos de intereses revela que seis de los autores son empleados de OpenAI, dos son empleados de PerturbAI y Grace Zheng y Xin Jin son cofundadores de PerturbAI.

Diferencias entre Tsc2 y Tsc1 y una pista sobre el colesterol

Según el anuncio, los agentes detectaron una diferencia inesperada entre Tsc1 y Tsc2, dos genes que actúan conjuntamente para controlar mTOR, un importante regulador del crecimiento celular, el metabolismo y el envejecimiento. La alteración de cualquiera de los dos genes tuvo efectos similares en varios grupos de neuronas. En el cerebelo, que ayuda a coordinar el movimiento, la alteración de Tsc2 modificó la actividad de decenas de genes implicados en la comunicación neuronal, mientras que la alteración de Tsc1 produjo pocos cambios.

El anuncio señala que, en las personas con esclerosis tuberosa, las anomalías cerebelosas están estrechamente relacionadas con mutaciones de TSC2 y que, aunque los medicamentos que reducen la actividad de mTOR pueden tratar ciertos tumores cerebrales y las convulsiones, sigue siendo difícil abordar las dificultades de aprendizaje y conducta asociadas a la enfermedad. Los agentes identificaron un grupo específico de neuronas y cambios celulares que conviene investigar más a fondo.

Los agentes también encontraron una pista en DCTN1, un gen cuyas mutaciones causan el síndrome de Perry, una enfermedad neurodegenerativa con síntomas similares a los del párkinson. DCTN1 participa en el transporte de carga dentro de las neuronas y, en el atlas, la alteración de Dctn1 aumentó la expresión de genes implicados en la producción de colesterol. Los agentes relacionaron esa observación con investigaciones que sugieren que los problemas en el transporte del colesterol pueden hacer que las células produzcan más colesterol, lo que plantea nuevas preguntas sobre si la alteración de DCTN1 modifica la distribución del colesterol dentro de las neuronas y si esos cambios podrían contribuir a la neurodegeneración. Según el anuncio, los expertos humanos consideraron que la hipótesis era novedosa, trascendente y merecía investigarse más.

Tomasz Nowakowski, profesor asociado de cirugía neurológica en UCSF, afirmó que el posible vínculo entre la función neuronal y el metabolismo del colesterol muestra cómo las pistas dispersas en distintos campos, una vez relacionadas, pueden ofrecer una nueva manera de entender la biología de las enfermedades.

Agentes distribuidos frente a un solo agente

El equipo comprobó si un solo agente con acceso al conjunto de datos completo podía igualar el rendimiento de miles de agentes trabajando en paralelo, manteniendo fijos el modelo y los recursos. A medida que aumentaba la carga de trabajo, el agente único consultaba menos literatura y citó solo 11 referencias con la carga de trabajo más alta, mientras que los agentes distribuidos citaron más de 700. En comparaciones a ciegas, los expertos humanos prefirieron los informes de los agentes distribuidos a los del agente único el 75% de las veces.

El preprint informa que, sin acceso al manuscrito original, los agentes recuperaron sus conclusiones, predijeron los efectos de perturbaciones reservadas y detectaron relaciones entre perturbaciones con resultados coincidentes u opuestos en distintos grados de efecto. Los autores afirman que los agentes distribuidos ampliaron la cobertura de la literatura a medida que aumentaba la carga de trabajo y recuperaron cientos de veces más referencias que el modo de agente único; además, expertos humanos que desconocían los resultados respaldaron la clasificación de los descubrimientos de los agentes.

Acceso al atlas, al código y al conjunto de datos

El atlas de razonamiento y el marco subyacente Distributed Agents están disponibles públicamente en un repositorio de GitHub publicado con una licencia MIT. El repositorio incluye el entorno de ejecución de los agentes, las herramientas para trabajar con el corpus y los cuadernos utilizados en los análisis, las figuras y las tablas complementarias del manuscrito. También documenta un servicio alojado de corpus de solo lectura, con puntos de conexión MCP que permiten acceder a hallazgos, afirmaciones, evidencia de respaldo y herramientas de análisis. Como el servidor alojado no incluye los archivos del conjunto de datos sin procesar, el repositorio también ofrece instrucciones para ejecutar el marco localmente mediante la CLI de Codex. La última confirmación del repositorio, que actualizó la cita de bioRxiv, la licencia y la documentación del servicio alojado, tiene fecha del 21 de octubre de 2026.

El conjunto de datos analizado es el atlas de Perturb-seq CRISPR in vivo de todo el cerebro de PerturbAI, disponible en Hugging Face. La ficha del conjunto de datos describe 7,7 millones de células, 7.739.370 filas que suman 205 GB y el perfilado de núcleos individuales de 19.070 ARNm y 8.588 ARN guía pequeños (sgRNA), con mediciones de los efectos de casi 2.000 genes vinculados a enfermedades y anotaciones celulares extraídas de Allen Institute Whole Mouse Brain Taxonomy. La ficha identifica como publicación subyacente del atlas un manuscrito de bioRxiv de marzo de 2026 titulado «Genome-scale functional mapping of the mammalian whole brain with in vivo Perturb-seq».

OpenAI afirmó que los investigadores pueden usar el atlas para comparar genes relacionados, investigar respuestas inesperadas e identificar pistas prometedoras que merezca la pena explorar. También señaló que los hallazgos ayudan a priorizar los experimentos adicionales necesarios para poner a prueba los mecanismos biológicos propuestos.