Το Target Atlas της Phylo βάζει τους AI Agents στην προτεραιοποίηση φαρμακευτικών στόχων

Η Phylo παρουσίασε το Target Atlas στις 29 Σεπτεμβρίου 2026, μια εφαρμογή προτεραιοποίησης στόχων με χρήση AI που χτίστηκε πάνω στην πλατφόρμα Biomni Lab της εταιρείας, με δωρεάν δημόσια έκδοση και με πρώτη έκδοση ειδική για τη νόσο του Πάρκινσον, που αναπτύχθηκε σε συνεργασία με το The Michael J. Fox Foundation.

Πώς λειτουργεί το Target Atlas

Η Phylo δήλωσε ότι η εφαρμογή μπορεί να μειώσει τη συλλογή αποδείξεων πίσω από τις αξιολογήσεις στόχων από μήνες εργασίας ομάδων επιστημόνων σε ημέρες. Το σύστημα δημιουργεί ένα κοινόχρηστο αρχείο που συνδέει τα ευρήματα με τις πηγές τους και μπορεί να ενημερώνεται καθώς εμφανίζονται νέες έρευνες. Οι AI agents εφαρμόζουν συνεπείς αναλύσεις σε όλους τους στόχους, ενώ οι επιστήμονες αποφασίζουν ποιες αποδείξεις είναι σημαντικές και πόσο βάρος πρέπει να έχουν. Οι ομάδες μπορούν να αλλάξουν αυτά τα βάρη για να δουν πώς τα δικά τους κριτήρια επηρεάζουν τις κατατάξεις.

Η δημόσια έκδοση είναι δωρεάν με λογαριασμό Biomni και περιλαμβάνει χιλιάδες αξιολογήσεις στόχου–νόσου, που παρουσιάζονται μέσω προφίλ στόχων συνδεδεμένων με πηγές και διαδραστικών διαγραμμάτων 2×2. Σύμφωνα με την εταιρεία, εκατοντάδες AI agents επιμελούνται και συνθέτουν τις υποκείμενες αποδείξεις. Σε όλες τις νόσους, εκδόσεις υπολογιστικών δεξιοτήτων μετατρέπουν αποδείξεις από βάσεις δεδομένων, άρθρα και σύνολα δεδομένων νόσων σε πίνακες ελέγχου και προφίλ συνδεδεμένα με πηγές, που καταγράφουν την πηγή, την ημερομηνία, την κάλυψη και τυχόν ελλείψεις κάθε στοιχείου. Οι ερευνητές μπορούν να εξετάσουν τις αποδείξεις πίσω από κάθε αποτέλεσμα και να χρησιμοποιήσουν μια διεπαφή συνομιλίας για να εξερευνήσουν τις αποδείξεις ή να επεξεργαστούν ιδιωτικές προβολές.

Αποδείξεις που παρατίθενται πίσω από την εφαρμογή

Η ανακοίνωση τοποθετεί το προϊόν σε βάθος δημοσιευμένων στατιστικών αποτυχίας στην ανάπτυξη φαρμάκων. Αναφέρει μια ανάλυση του 2014 στο Nature Biotechnology από τον Hay και συνεργάτες, η οποία διαπίστωσε ότι περίπου ένα από τα δέκα προγράμματα φαρμάκων που εισέρχονται στην κλινική ανάπτυξη εγκρίνονται, καθώς και μια μελέτη του 2024 στο Nature από τον Minikel και συνεργάτες, η οποία εκτιμά ότι οι μηχανισμοί φαρμάκων με ανθρώπινη γενετική υποστήριξη έχουν 2,6 φορές μεγαλύτερη πιθανότητα επιτυχίας από τη Φάση 1 μέχρι την έγκριση. Η επιλογή στόχου, όπως δηλώνει η ανακοίνωση, είναι ένα από τα πρώτα και λιγότερο δαπανηρά σημεία όπου μπορεί να αλλάξει ένα πρόγραμμα φαρμάκου, και ένα από τα πιο δαπανηρά όταν γίνεται λανθασμένα, ωστόσο οι αποδείξεις που απαιτούνται για σωστή επιλογή είναι θραυσματικές σε τομείς όπως η γενετική, η έκφραση, η κλινική δραστηριότητα, η ασφάλεια, η διαχειρισιμότητα, τα βιοδείκτες, ο ανταγωνισμός και η βιβλιογραφία, και αλλάζουν συνεχώς.

Η έκδοση Parkinson της The Michael J. Fox Foundation

Η πρώτη εφαρμογή του Target Atlas ειδικά για μια νόσο είναι μια έκδοση Parkinson που αναπτύχθηκε με την Πρωτοβουλία Targets to Therapies (T2T) του ιδρύματος, η οποία δημιούργησε ένα διαφανές πλαίσιο προτεραιοποίησης στόχων Parkinson μέσω υποψηφιοτήτων από την κοινότητα, επιτροπών ειδικών, επιμελημένων καρτών αξιολόγησης και δημοσιευμένης μεθοδολογίας. Η Phylo δήλωσε ότι η έκδοση καθιστά αυτό το πλαίσιο ειδικών ανοιχτά εξερευνήσιμο και το συνδέει με αναλύσεις συνδεδεμένες με πηγές που μπορούν να ανανεωθούν καθώς εμφανίζονται νέες αποδείξεις. Η υποκείμενη μεθοδολογία δημοσιεύτηκε από τη Vaiana και συνεργάτες στο npj Parkinson’s Disease το 2025.

Σύμφωνα με η σελίδα πρωτοβουλίας του ιδρύματος, η T2T ξεκίνησε στις αρχές του 2024 με μια έρευνα της επιστημονικής κοινότητας σχετικά με το ποιους στόχους προσφέρουν τη μεγαλύτερη δυνατότητα για νέες θεραπείες Parkinson. Αξιολογήθηκαν περισσότερο από 290 στόχοι, και 21 προτάθηκαν βάσει της εφικτότητας αντιμετώπισης των εμπόδια τα επόμενα δύο έως τρία χρόνια. Τρία επιστημονικά πυρήνα τροφοδοτούν την πρωτοβουλία: προτεραιοποίηση και επιλογή, επικύρωση και ανάπτυξη εργαλείων, και μια δημόσια βάση γνώσεων. Το ίδρυμα χρηματοδοτεί ερευνητικές ομάδες για μηχανική επικύρωση των επιλεγμένων στόχων για πιθανή μελλοντική ανάπτυξη φαρμάκων, και όλα τα μαθήματα και τα εργαλεία διατίθενται ελεύθερα μέσω της κοινόχρηστης βάσης γνώσεων. Η σελίδα αναφέρει ότι τα alpha-synuclein, GBA1 και LRRK2 είναι στόχοι με θεραπείες που βρίσκονται ήδη σε κλινικές δοκιμές για το Parkinson, και σημειώνει ότι η αρχική φάση επιλογής επικεντρώθηκε σε στόχους με δυνατότητα να επιβραδύνουν ή να τροποποιήσουν την εξέλιξη της νόσου.

«Η επέκταση του αριθμού των καλά χαρακτηρισμένων, φαρμακοδυνατών στόχων αποτελεί κρίσιμο κομμάτι του παζλ», δήλωσε η Gaia Skibinski, VP και επικεφαλής μεταφραστικών θεραπειών στο The Michael J. Fox Foundation for Parkinson’s Research, στο η ανακοίνωση εκκίνησης. Πρόσθεσε ότι το ίδρυμα ανυπομονεί να εξερευνήσει πώς τα αναδυόμενα εργαλεία AI όπως το Target Atlas μπορούν να βοηθήσουν τους ερευνητές να προωθήσουν υποσχόμενους στόχους προς πιθανές νέες θεραπείες Parkinson.

Έκδοση Enterprise, Σχέδια Επέκτασης και Διαθεσιμότητα

Η έκδοση Enterprise του Target Atlas διατίθεται με ετήσια άδεια για μια ελεγχόμενη υλοποίηση Biomni και υποστηρίζει περισσότερους από 20.000 στόχους ανά επιλεγμένη νόσο, ιδιόκτητη ενσωμάτωση δεδομένων, πίνακες ελέγχου ζευγών στόχων και βαθμολόγηση βασισμένη σε AI/ML.

Η Phylo δήλωσε ότι σχεδιάζει να επεκτείνει τη δημόσια έκδοση σε όλες τις κύριες νόσους με την πάροδο του χρόνου, και αναζητά ιδρύματα, κοινοπραξίες και οργανώσεις ασθενών για να χορηγήσουν πρόσθετες εκδόσεις νόσων που θα δημοσιεύονται δωρεάν στις κοινότητές τους, με το πλαίσιο κάθε οργανισμού να εκπροσωπείται στη βαθμολόγηση. Η Kexin Huang, συνιδρύτρια και διευθύνουσα της εταιρείας, ανέφερε ότι η συνεργασία T2T δείχνει ότι οι agents μπορούν να συναθροίσουν και να βαθμολογήσουν σε ημέρες αποδείξεις που μια κοινότητα χρειάζεται μήνες για να επεξεργαστεί χειροκίνητα, να τις διατηρήσουν ενημερωμένες, και να το κάνουν αυτό χωρίς να αντικαθιστούν την εξειδικευμένη κρίση που αποφασίζει ποιες αποδείξεις είναι σημαντικές. Η Huang δήλωσε ότι ο στόχος της εταιρείας είναι να φέρει το μοντέλο σε κάθε κύρια νόσο.

Η Phylo περιγράφει το Biomni Lab ως το πρώτο Integrated Biology Environment, έναν ενοποιημένο χώρο εργασίας όπου οι επιστήμονες συνεργάζονται με AI agents σε έρευνα βιβλιογραφίας, σχεδιασμό πειραμάτων, ανάλυση βιολογικών δεδομένων και λήψη επιστημονικών αποφάσεων, και δήλωσε ότι η πλατφόρμα χρησιμοποιείται από βιοφαρμακευτικές εταιρείες, συμπεριλαμβανομένων των Chugai Pharmaceutical και Ono Pharmaceutical. Η εταιρεία εδρεύει στο South San Francisco και συγκέντρωσε γύρω από $13,5 εκατομμύρια σε seed γύρο, συν‑ηγημένο από την Andreessen Horowitz και το Menlo Ventures’ Anthology Fund με Anthropic.

Το Target Atlas, συμπεριλαμβανομένης της έκδοσης MJFF Parkinson’s, είναι διαθέσιμο στο biomni.phylo.bio. Οι ηγέτες R&D μπορούν να ζητήσουν εταιρική παρουσίαση, και τα ιδρύματα και οι κοινοπραξίες μπορούν να συζητήσουν τη χορηγία μιας έκδοσης για μια νόσο, μέσω contact@phylo.bio.