피터 엘만, Certis Oncology Solutions의 사장 및 CEO – 인터뷰 시리즈

Certis Oncology Solutions, 피터 엘만 사장 및 CEO가 이끄는 생명과학 기술 회사로, 정밀 암학의 약속을 실현하기 위해 노력하고 있습니다. 회사의 제품인 Oncology Intelligence는 고급 암 모델에서 유도된 예측 가능한 치료 반응 데이터입니다. Certis는 의사 과학자와 산업 연구자와 협력하여 정밀 암학에 대한 접근성을 확대하고 전임상 연구와 임상 시험 사이의 임계 간격을 해결합니다.

암 연구에서 CertisOI Assistant가 해결하는 더广い 문제는 무엇입니까?

암 연구에서 조사적 약물 후보의 실패율이 높습니다. 2023년에 암 프로그램이 궁극적으로 실패한 비율은 90%로 보고되었는데, 이는 2022년까지 96%에 달했던 역사적인 추세에 비해 현격한 개선입니다. 약물 개발 비용을 고려할 때 90%의 실패율은 지속 가능하지 않습니다. 성공률이 50%라면 환자들에게 얼마나 도움이 될지 상상해 보세요.

CertisOI Assistant는 두 가지 중요한 문제를 즉시 해결합니다.

• 개선된 전임상 모델 선택: 많은 화합물은 전임상 연구에서 약속을 보여주지만 인간에서 충분한 치료 효과를 나타내지 못합니다. 과학 커뮤니티의 대부분은 전임상 모델이 문제의 일부라고 지적합니다. 올바른 유전자 발현 서명과 정위적 이식(orthotopic engraftments)을 사용하여 전임상 모델을 선택하면 임상에 대한 “번역”을 개선할 수 있습니다.
• 더早い, 더 나은 바이오마커 식별: 치료 반응을 예측하지 못하는 바이오마커에 의존하면 임상 시험에 실패할 수 있습니다. CertisOI Assistant는 우리의 특허 출원 예측 AI/ML 플랫폼인 CertisAI와 통합되어 개발 초기에 예측 바이오마커를 식별하는 것을 가능하게 합니다.

CertisOI Assistant는 암학 데이터에 대한 접근성을 높이고 암 연구 분야의 다른 AI 도구와 어떻게 차별화되는가?

CertisOI Assistant는 사용자 친화적인 자연어 인터페이스를 통해 고급 데이터 분석 및 예측 모델링 기능을 제공합니다. 여러 가지면에서 두드러집니다.

• 전체 데이터셋 통합: 조수로 암 데이터를 통합하여 환자 정보, 종양 특성, 유전적 프로파일 및 약물 반응 예측을 포함합니다. 이러한 종합적인 접근 방식은 분리된 데이터 유형에 중점을 둔 도구보다 더 포괄적인 분석을 허용합니다.
• AI 기반 예측: 약물 반응 및 내성에 대한 예측을 제공하여 특정 암 모델에 대한 치료의 효과를 예측합니다. 이는 개인화된 의학을 위한 예측 기능이며 역사적 데이터만을 사용하는 도구와는 다릅니다.
• 사용자 친화적인 인터페이스: 복잡한 데이터셋을 쿼리하고 분석하기 위한 직관적인 인터페이스를 제공하여 연구자들이 고급 기술적인 기술을 필요로 하지 않고 암학 데이터에 접근하고 해석할 수 있도록 합니다.
• 전임상 모델에 대한 중점: 전임상 암 연구, 특히 PDX 및 세포 라인 모델에 중점을 둡니다. 이는 초기 약물 개발 및 종양 생물학에 대한 고유한 통찰력을 제공합니다.
• 상호작용형 시각화: 약리학 및 종양 성장 연구와 같은 상호작용형 시각화를 지원하여 연구자들이 데이터를 더 흥미롭고 정보적으로 탐색할 수 있도록 합니다.

연구자들이 CertisOI Assistant를 사용하여 복잡한 데이터를 행동할 수 있는 통찰력으로 변환하는 방법은 무엇인가?

CertisOI Assistant는 구조화된 워크플로를 사용하여 원시 데이터를 의미 있는 통찰력으로 변환합니다. 이는 포괄적인 암학 데이터셋을 쿼리하고, 데이터를 분석하고, 결과를 명확하고 해석 가능한 형식으로 제공하는 것을 포함합니다. 여기서 작동하는 방식입니다.

• 데이터 쿼리: CertisOI Assistant는 암 모델, 환자 데이터, 종양 특성, 유전적 데이터 및 약물 반응 예측과 같은 정보를 포함하는 관계형 데이터베이스에 액세스할 수 있습니다. 연구자의 특정 요구에 따라 관련 데이터를 추출하기 위해 SQL과 유사한 쿼리를 사용합니다.
• 데이터 분석: 데이터를 검색한 후 CertisOI Assistant는 공통 돌연변이를 식별하거나 약물 감수성과 유전자 발현을 상관시키거나 약리학 연구 결과를 평가하는 것과 같은 다양한 분석을 수행할 수 있습니다. 또한 데이터를 랭크하고 필터링하여 가장 중요한 발견을 강조할 수 있습니다.
• 시각화: 데이터를 표 형식으로 표시하거나 약리학 및 종양 성장 연구를 위한 상호작용형 차트를 생성하거나 조직학 이미지를 표시할 수 있습니다. 이러한 시각화는 연구자들이 복잡한 데이터 패턴과 관계를 빠르게 이해하는 데 도움이 됩니다.
• 해석 및 통찰력: 데이터의 명확한 해석을 제공함으로써, 약물 감수성 또는 내성에 대한 예측을 포함하여, CertisOI Assistant는 연구자들이 잠재적인 치료 전략 또는 추가 실험 방향에 대한 정보에 입각한 결정을 내리도록 도와줍니다.
• 사용자 지정 및 유연성: 연구자들은 특정 암 유형, 유전적 표지자 또는 치료 반응에 초점을 맞춘 사용자 지정 쿼리를 생성할 수 있습니다. 이는 분석이 연구 목표와 일치하도록 높은 수준의 맞춤 설정을 허용합니다.

연구자들은 암 모델을 선택하거나 바이오마커 전략을 설계하거나 실질적인 검증을 수행하는 데 CertisOI Assistant를 어떻게 사용하는가?

나는 이 인터뷰의 시작 부분에서 암 모델 섹션과 바이오마커 전략 설계에 대해 다루었으므로 실질적인 검증에 중점을 둘 것입니다. CertisOI Assistant는 연구자들이 실험실 실험 없이 약물 효능, 표적 결합 및 바이오마커 발견과 관련된 가설을 테스트하고 검증할 수 있는 가상 환경을 제공합니다. 이를 통해 가설을 신속하게 정제하고 가장 약속을 보여주는 방향으로 실험 노력을 집중할 수 있습니다.

여기에는 몇 가지 예가 있습니다.

• 약물 반응 예측: 특정 약물에 대한 암 모델의 반응 및 내성에 대한 AI 기반 예측을 사용하여 약물의 효능을 실질적으로 검증하기 전에 약물의 잠재적인 효능을 평가합니다.
• 유전적 및 분자적 프로파일링: 돌연변이, 유전자 발현 및 복제 수 변이를 포함한 유전적 데이터를 분석하여 약물의 작용 기전과 관련된 잠재적인 표적을 식별합니다. 이는 약물 감수성 또는 내성의 분자적 기초를 이해하는 데 도움이 됩니다.
• 바이오마커 발견: 분자적 특성과 약물 반응 예측을 상관시켜 잠재적인 예측 바이오마커를 식별합니다. 이는 특정 치료에서 이익을 얻을 가능성이 있는 환자 집단을 선택하는 데 도움이 됩니다.
• 조합 치료 탐색: 약물 상승 예측을 탐색하여 치료 결과를 향상시키는 약물 조합을 식별합니다. 이는 실험적으로 검증할 수 있는 잠재적인 조합 전략에 대한 통찰력을 제공합니다.
• 조직학적 분석: 약물의 종양 조직에 대한 형태학적 영향을 보여주는 조직학 이미지를 사용하여 약물의 작용 기전과 잠재적인 효능에 대한 추가 증거를 제공합니다.
• 모델 간 비교: 다양한 유전적 배경이 약물 반응에 미치는 영향을 이해하기 위해 다른 모델을 비교합니다. 이는 특정 유전자 또는 경로가 약물 반응에 미치는 역할에 대한 가설을 실질적으로 검증하는 데 도움이 됩니다.
• 가상 스크리닝: 다양한 모델에 대한 약물의 가상 스크리닝을 수행하여 추가 실험적 검증을 위해 후보를 우선순위로 지정합니다.

연구자들은 이 도구를 사용하여 워크플로우를 개선하거나 획기적인 성과를 달성하는 예는 무엇인가?

가장 간단한 예는 전임상 모델 선택입니다. 모든 전임상 연구는 종양 모델의 선택으로 시작됩니다. CertisOI Assistant는 이 프로세스에서 수동 노력을 제거하고 주어진 연구에 대한 최적의 모델을 선택하는 데 큰 정밀도를 제공합니다.

또 다른 예는 바이오마커 전략 개발입니다. 전통적인 접근 방식은 약물의 작용 기전과 관련된 바이오마커 또는 바이오마커를 가정하고 전임상 연구에서 가설을 테스트하는 것입니다. 이는 반복적인 프로세스입니다. 전임상 데이터가 약속을 보여준다면 연구자들은 예측 바이오마커를 인간 임상 시험에서 검증해야 합니다. 그리고 앞서 논의한대로 실패율이 높습니다.

CertisOI Assistant는 연구자들이 개발 프로세스의 초기에 더 정확하고 예측 가능한 유전자 발현 바이오마커를 식별하고 검증하는 데 도움을 줍니다. 이는 시간과 돈을 절약하고 상업적 성공의 기회를 높입니다.

도구는 어떤 종류의 암 모델 또는 데이터셋을 지원하며, 이러한 폭은 연구 커뮤니티에 어떤 이점을 제공하는가?

CertisOI의 현재 버전은 연구자들이 Certis의 급속히 확장하는 PDX 및 PDX 유래 종양 모델 라이브러리와 암 세포 라인 백과사전(CCLE) 모델 전체에 액세스할 수 있도록 합니다. 플랫폼의 알고리즘은 또한 GDSC, ICGC, CI ALMANAC, O’Neil 및 기타 데이터셋의 데이터를 사용합니다. 이러한 데이터 통합의 종합적인 접근 방식은 분리된 데이터 유형에 중점을 둔 도구보다 더 포괄적인 분석을 허용합니다.

CertisOI Assistant는 사용자 친화적이도록 설계되었습니다. 기술 전문 지식이 없는 연구자에게도 어떻게 접근할 수 있게 하는가?

CertisOI Assistant는 여러 기능을 통해 모든 수준의 연구자에게 접근할 수 있도록 합니다.

• 직관적인 인터페이스: 인터페이스는 사용자 친화적이고 탐색하기 쉽게 설계되어 연구자들이 고급 기술적인 기술을 필요로 하지 않고 복잡한 쿼리와 분석을 수행할 수 있도록 합니다.
• 가이드 워크플로우: Assistant는 약물 반응 예측을 쿼리하거나 유전적 데이터를 분석하거나 약리학 연구를 탐색하는 것과 같은 일반적인 연구 작업을 위한 가이드 워크플로우를 제공합니다. 이를 통해 사용자가 기술적인 복잡성에 매몰되지 않고 연구 질문에 집중할 수 있습니다.
• 자연어 처리: 사용자는 자연어 쿼리를 사용하여 Assistant와 상호작용할 수 있습니다. 이를 통해 기술 전문 지식이 없는 사람들도 필요한 정보에 쉽게 접근할 수 있습니다. Assistant는 쿼리를 해석하고 적절한 데이터베이스 쿼리로 변환합니다.
• 포괄적인 문서화: 상세한 문서와 튜토리얼을 통해 사용자가 Assistant를 효과적으로 사용하는 방법을 이해할 수 있습니다. 이는 단계별 가이드, 예제 및 주요 개념에 대한 설명을 포함합니다.
• 상호작용형 시각화: Assistant는 약리학 및 종양 성장 연구를 위한 상호작용형 시각화를 제공하여 사용자가 데이터를 시각적으로 탐색하고 해석할 수 있도록 합니다.
• 반응형 지원: 사용자는 질문이나 문제에 대한 반응형 지원에 액세스할 수 있습니다. 이를 통해 필요한 도움을 신속하게 받을 수 있고 불필요한 지연 없이 연구를 계속할 수 있습니다.
• 사용자 지정 쿼리: Assistant는 기본 워크플로우를 제공하지만 사용자 지정도 허용합니다. 이를 통해 사용자가 쿼리를 자신의 연구 요구에 맞게 맞춤 설정할 수 있습니다.

협력은 연구의 핵심입니다. CertisOI Assistant는 연구자 또는 기관 간의 협력을 어떻게 촉진하는가?

CertisOI Assistant를 사용하면 연구자들이 동일한 데이터셋과 도구에 액세스할 수 있으므로 공동 프로젝트 또는 연구 질문에 대해 협력할 수 있습니다. 플랫폼은 또한 데이터 쿼리, 결과 및 통찰력을 팀 구성원间에 쉽게 다운로드하고 공유할 수 있도록 허용하여 모든 프로젝트에 참여하는 사람이 효과적으로 기여할 수 있습니다.

암 연구에서 AI를 채택하는 것을 확대하는 데 가장 큰 도전은 무엇이며, 어떻게 해결할 수 있습니까?

데이터 보안, 데이터 통합 및 AI 기반 결과 예측에 대한 신뢰와 같은 도전이 있습니다. 나는 데이터 보안 또는 데이터 통합의 전문가가 아니지만, 이 도전을 해결하기 위해 훌륭한 인재들이 노력하고 있습니다. AI 생성 예측을 신뢰하는 문제와 관련하여, 우리는 효율적이고 신뢰할 수 있는 방식으로 이러한 예측을 검증해야 합니다.

Certis는 두 가지 접근 방식을 취했습니다. 내부 교차 검증 연구를 통한 실질적인 검증과 임상적으로 관련 있는 마우스 모델에서 연구를 수행하여 플랫폼의 예측의 정확성을 평가합니다. 시간이 지남에 따라 이러한 도구는 인간 환자에서 임상적으로 검증될 것입니다. 그러나 이것은 많은 시간, 돈 및 현재 암 치료 패러다임을 변경하려는 의지, 즉 의료 및 규제 커뮤니티가 항상 그렇게 해왔던 방식에 의존하는 것을 중단하고 계산적 분석의 힘을 의사 결정에 활용하는 것을 필요로 할 것입니다.

도구와 같은 CertisOI Assistant는 암 치료와 정밀 의학의 미래를 어떻게 형성할 것으로 보입니까?

현대 의학은 아직 환자와 최적의 치료를 일치시키는 좋은 방법을 갖고 있지 않습니다. 전체적으로, 암 환자 중 10%만이 종양 DNA 돌연변이와 일치하는 치료에서 임상적 이익을 경험합니다. 이는 환자의 건강뿐만 아니라 재정적으로도 해롭습니다. 추정 25억 달러가 무효 치료에浪費되고 있습니다. 암 환자 중 42%가 진단 2년 이내에 자산을 완전히 소진한다는 것은 매우悲惨한 사실입니다.

도구와 같은 CertisOI Assistant와 CertisAI는 정밀 의학의 약속을 실현하는 데 도움을 줄 것입니다. 즉, 환자들에게 최적의 치료를 제공하는 것입니다. 그리고 더有效하고 개인화된 치료에 대한 접근성을 민주화하는 것입니다…. 그리고 감사합니다. 더 많은 정보를 배우고 싶은 독자들은 Certis Oncology Solutions를 방문하십시오.