Naheed Kurji, Co-Founder, Presiden dan CEO Cyclica – Seri Wawancara

Naheed Kurji adalah Presiden dan CEO Cyclica, sebuah perusahaan bioteknologi yang berbasis di Toronto yang menggunakan kecerdasan buatan dan biophysics komputasi untuk mengubah proses penemuan obat. Cyclica menyediakan industri farmasi dengan platform terintegrasi, holistik, dan end-to-end yang memungkinkan ilmuwan merancang, menyaring, dan mempersonalisasi obat untuk pasien, dan baru-baru ini dinamai oleh Deep Knowledge Analytics sebagai salah satu dari 20 perusahaan AI di farmasi teratas secara global

Cyclica menggunakan kecerdasan buatan dan biophysics komputasi untuk mengubah proses penemuan obat. Bisakah Anda membahas bagaimana AI digunakan dalam proses ini?

Teknologi telah memainkan peran kritis dalam penemuan obat sejak tahun 80-an. Namun, proses penemuan dan pengembangan obat masih sangat tidak efisien, memakan waktu, dan mahal, dengan biaya lebih dari 2 miliar dolar selama 12 tahun. Efisiensi yang buruk sering menghasilkan tingkat atribusi yang tinggi dan kegagalan untuk memenuhi tujuan keamanan dan efikasi obat. Peneliti menyadari hal ini dan mereka secara aktif mencari alat untuk memahami secara holistik kualitas yang mendefinisikan obat terbaik untuk mengembangkan obat yang lebih aman dan efektif

Perkembangan terbaru dalam komputasi awan, AI, dan biophysics telah menciptakan kesempatan untuk mendapatkan wawasan yang mendalam dari jumlah data biokimia, biologi, kesehatan, dan pasien yang sangat besar yang sekarang tersedia untuk memahami penyakit. Perkembangan ini juga telah memungkinkan ahli kimia farmasi untuk meningkatkan desain terapi baru dan menggunakan AI untuk mengemudi wawasan prediktif yang lebih besar pada tahap awal proses pengembangan obat. Di Cyclica, kami telah mengembangkan mesin pembelajaran dalam, MatchMaker dan POEM, untuk mendukung proses desain obat. MatchMaker memprediksi bagaimana senyawa kimia dan obat berinteraksi dengan beberapa protein, yang dikenal sebagai polifarmakologi. Kami menemukan bahwa kombinasi dari pendekatan berbasis pengetahuan dan struktur berbasis menghasilkan akurasi dan kinerja prediktif yang terbesar. POEM (Pareto-Optimal Embedded Modeling) adalah pendekatan pembelajaran berawak tanpa parameter untuk membangun model prediksi sifat obat dan mengatasi beberapa keterbatasan pendekatan ML lainnya, menghasilkan kurang overfitting dan meningkatkan interpretasi.

Di Cyclica, kami menggunakan AI untuk menyediakan ilmuwan dengan platform yang kuat dan divalidasi untuk mempercepat pengambilan keputusan dan generasi hipotesis untuk meningkatkan efisiensi keseluruhan proses penemuan obat dan mengurangi jumlah kegagalan di hilir.

Cyclica telah merancang platform Ligand Design dan Ligand Express, apa itu?

Kami adalah perusahaan pertama yang mendekati polifarmakologi komputasi (penghargaan bahwa obat berinteraksi dengan beberapa target) dengan platform penemuan obat terintegrasi yang menginterogasi interaksi molekuler pada skala proteom yang luas. Platform kami terdiri dari dua bagian utama, Ligand Express, platform profil of-target dan dekonvolusi target generasi pertama kami, dan Ligand Design, teknologi desain obat in silico generasi berikutnya kami. Ligand Express dan Ligand Design ditenagai oleh dua mesin pembelajaran dalam dan pembelajaran berawak yang dibangun dan divalidasi secara internal: MatchMaker dan POEM. Berakar dalam dalam biophysics protein, MatchMaker adalah mesin interaksi obat-target yang memprediksi yang menggeneralisasi di seluruh target kaya data dan target miskin data (lihat catatan validasi di sini dan di sini). POEM, teknologi pembelajaran berawak yang diimplementasikan untuk prediksi sifat ADME, adalah pendekatan baru, tanpa parameter, untuk membangun model.

Semua ini digabungkan, Ligand Design dan Ligand Express menawarkan platform penemuan obat yang kuat dan teraugmentasi AI untuk desain molekul awal yang canggih, kimia baru, yang secara bersamaan memprioritaskan senyawa berdasarkan profil polifarmakologi mereka, secara efektif meminimalkan efek of-target yang tidak diinginkan. Platform terdiferensiasi kami membuka kesempatan baru untuk penemuan obat, termasuk desain obat multi-target dan multi-objektif, optimasi timbal, prediksi sifat ADME, dekonvolusi target, dan penggunaan kembali obat. Didorong oleh tim yang beragam dan sangat berbakat dengan keahlian yang mendalam di seluruh pembelajaran mesin, biophysics/kimia/biologi komputasi, biokimia, dan kimia farmasi, kami terus berinovasi melalui pipa R&D yang kuat.

Seberapa pentingkah desentralisasi penemuan obat bagi model bisnis Cyclica?

Visi kami adalah untuk mendesentralisasi penemuan obat yang lebih baik dengan menggabungkan akar kami yang dalam di Kecerdasan Buatan (AI) dan biophysics protein dengan model bisnis inovatif. Dan di inti etos Cyclica adalah keinginan yang teguh untuk membantu pasien dengan memajukan penemuan dan pengembangan obat yang lebih baik dengan mengambil pendekatan holistik namun personal.

Untuk ini, kami percaya bahwa masa depan penemuan obat ada di tangan lembaga penelitian inovatif dan perusahaan bioteknologi yang muncul (kami menulis tentang ini di Forbes di sini). Mendukung filosofi kami, pada tahun 2019 IQIVIA melaporkan bahwa perusahaan biopharma yang muncul menyumbang lebih dari 70% dari pipa R&D total (naik dari 50% pada tahun 2003), dan bahwa perusahaan-perusahaan ini mempatenkan lebih dari 2/3 obat baru pada tahun 2018 (naik dari 50% pada tahun 2010). Sementara perusahaan bioteknologi yang muncul akan memimpin inovasi dalam penemuan obat, big pharma akan terus berinvestasi dalam memajukan uji klinis tahap akhir dan penetrasi pasar melalui saluran penjualan mereka.

Dengan pendanaan Seri B kami, kami akan mempercepat rencana komersial untuk memajukan pipa yang tumbuh dari aset praklinis dan klinis melalui model kemitraan desentralisasi inovatif. Tujuan kami adalah untuk menciptakan dan memiliki ratusan program penemuan obat di berbagai area terapi. Program-program ini dibuat melalui spin-out dan kemitraan (JV) dengan lembaga penelitian terkemuka, difasilitasi terutama melalui Program Kemitraan Akademik Cyclica (“CAPP”).

Didorong oleh portofolio yang tumbuh pesat dari lebih dari 30 program penemuan obat yang aktif dan maju, kami akan terus memicu inovasi melalui kombinasi penciptaan ventura dan kemitraan dengan perusahaan bioteknologi awal dan muncul. Kemitraan baru-baru ini termasuk EntheogeniX Biosciences, NineteenGale Therapeutics, Rosetta Therapeutics, Percepatan Obat Penyakit Langka, dan dua JV rahasia yang mencakup lebih dari 50 program di berbagai area terapi. Dengan mengeksekusi model bisnis desentralisasi kami, menciptakan perusahaan baru melalui spin-out dan kemitraan dan membantu mereka berkembang, kami pada dasarnya menciptakan pipa bioteknologi di masa depan.

Banyak teknologi Anda yang berbasis cloud, mengapa ini sangat penting?

Akses ke cloud memungkinkan kami untuk menskalakan komputasi alur kerja yang kami lakukan, serta memanfaatkan infrastruktur keamanan yang diatur. Juga, sebagai perusahaan awal, kemampuan untuk memulai dan berjalan dengan cloud tanpa biaya overhead dari investasi dalam perangkat keras kami sendiri sangat penting untuk viabilitas keuangan di hari-hari awal kami. Menjelang masa depan, sementara sebagian besar pekerjaan R&D kami dilakukan di cloud, selama beberapa tahun terakhir kami telah menjadi kurang bergantung pada cloud dengan kemampuan untuk menjalankan proyek di mesin tunggal. Kami juga berencana untuk mendukung instalasi cloud pribadi karena itu adalah sesuatu yang kami rasakan mitra kami mungkin inginkan. Kemajuan teknologi telah membuatnya mungkin untuk melakukan pada laptop pribadi apa yang sebelumnya membutuhkan banyak mesin di cloud, tetapi dengan terus menggunakan cloud kami dapat memperluas cakupan masalah yang kami pecahkan.

Cyclica sering mengambil posisi ekuitas di perusahaan yang mereka mitrakan. Bisakah Anda membahas alasan bisnis di balik ini?

Perusahaan bioteknologi yang lebih kecil dan kelompok akademis umumnya diabaikan oleh pasar dalam hal kesempatan kemitraan. Sementara mereka mungkin tidak memiliki sumber daya, infrastruktur, atau fasilitas yang sama dengan perusahaan farmasi besar yang mapan, perusahaan bioteknologi kecil semakin memasuki sorotan dengan kombinasi keahlian subjek yang mendalam dalam indikasi tertentu dan manfaat dari organisasi yang ramping yang kondusif untuk inovasi yang cepat.

Hal ini menyebabkan kami berpikir tentang bagaimana kami dapat berinteraksi dengan perusahaan-perusahaan kecil ini dengan strategi avant-garde. Kami bermitra dengan ilmuwan di organisasi penelitian yang tertarik untuk memutar keluar perusahaan atau perusahaan bioteknologi awal, dan memungkinkan mereka dengan platform penemuan obat yang ditingkatkan AI kami melalui kontribusi dalam bentuk. Sebagai gantinya, kami mengambil ekuitas di perusahaan dan/atau berbagi dalam kepemilikan senyawa dan aset yang dibuat dan dikejar. Dengan memicu lonjakan inovasi melalui kombinasi penciptaan ventura dan kemitraan, kami dapat menangkap nilai yang lebih besar dan mengembangkan hubungan jangka panjang dengan mitra kami untuk mengatasi spektrum kebutuhan medis yang belum terpenuhi untuk meningkatkan kehidupan pasien.

Entheogenix Biosciences adalah kemitraan antara Cyclica dan ATAI Life Science. Apa itu Entheogenix Biosciences?

Ada kesempatan unik untuk inovasi di lanskap neuropsikiatri untuk lebih baik melayani pasien yang menderita penyakit mental yang kompleks. Obat dan terapi saat ini yang bergantung pada intervensi obat tunggal sering kali tidak memadai, memerlukan pasien untuk mengambil beberapa obat yang mungkin memiliki masalah keamanan potensial serta mengurangi kepatuhan obat. Kami telah bermitra dengan ATAI Life Science untuk memanfaatkan pengalaman mereka yang mendalam dalam kesehatan mental dan psikedelik, sementara memungkinkan mereka dengan platform penemuan obat yang ditingkatkan AI kami untuk menciptakan tidak hanya obat baru, tetapi obat yang tepat untuk menangani penyakit mental. Entheogenix Biosciences adalah salah satu dari banyak kemitraan yang kami bentuk dan merupakan bukti dari keyakinan kami untuk mengubah paradigma dalam cara penyakit mental diobati dengan membawa platform komputasi yang kuat dan divalidasi secara ilmiah ke tangan ahli subjek dan ilmuwan kelas dunia.

Apakah ada yang ingin Anda bagikan tentang Cyclica?

Kami sangat bersemangat untuk berbagi pengumuman tentang putaran pendanaan Seri B kami. Kami juga sangat bersemangat untuk berbagi peluncuran Program Kemitraan Akademik Cyclica (CAPP) dan kemitraan baru dalam beberapa bulan mendatang.

Terima kasih atas wawancara. Saya berharap untuk mengikuti kemajuan masa depan Cyclica.