BioNTech, InstaDeep Mengembangkan Sistem Peringatan Dini untuk Variasi COVID

Perusahaan imunoterapi BioNTech (BNTX ) dan perusahaan AI InstaDeep telah mengembangkan metode komputasi baru yang menganalisis data sekuen worldwide untuk memprediksi varians tinggi risiko SARS-CoV-2. Sistem Peringatan Dini (EWS) menggunakan metrik imun escape dan kebugaran yang dihitung oleh AI.

Mendeteksi Variasi Berisiko Tinggi

Dengan menggabungkan model struktural protein Spike virus dan algoritma AI, metode ini dapat mendeteksi potensi varians berisiko tinggi yang dimasukkan ke dalam repositori data sekuen SARS-CoV-2. Ini dapat dilakukan dalam waktu satu hari, dan perusahaan dapat memvalidasi prediksi dengan menggunakan data yang dihasilkan dan tersedia secara publik.

Sistem ini telah mengidentifikasi lebih dari 90% varians yang ditetapkan oleh Organisasi Kesehatan Dunia (WHO) rata-rata dua bulan sebelumnya. Untuk varians Alpha, Beta, Gamma, Theta, Eta, dan Omicron, EWS mendeteksi mereka pada minggu yang sama ketika sekuen pertama kali diunggah.

Studi baru ini menunjukkan bahwa EWS dapat mengevaluasi varians baru dalam waktu beberapa menit, dan sepenuhnya dapat diskalakan ketika data varians baru dirilis.

BioNTech dan InstaDeep

Ugur Sahin, M.D., adalah Chief Executive Officer dan Co-Founder dari BioNTech.

“Dengan metode komputasi yang telah kami kembangkan selama beberapa bulan terakhir, kami dapat menganalisis informasi sekuen protein Spike dan peringkat varians baru berdasarkan skor imun escape dan ACE2 yang diprediksi,” kata Sahin. “Pemberian peringatan awal tentang potensi varians berisiko tinggi dapat menjadi alat yang efektif untuk mengingatkan peneliti, pengembang vaksin, otoritas kesehatan, dan pembuat kebijakan, sehingga memberikan lebih banyak waktu untuk merespons varians baru yang menjadi perhatian.”

Karim Beguir adalah Co-Founder dan CEO dari InstaDeep.

“Lebih dari 10.000 sekuen varians baru ditemukan setiap minggu dan ahli manusia tidak dapat mengatasi data kompleks pada skala ini. Kami telah mengatasi tantangan ini dengan menerapkan kemampuan AI yang kuat dari platform DeepChain InstaDeep yang digabungkan dengan pengetahuan dan teknologi SARS-CoV-2 BioNTech. Untuk pertama kalinya, varians berisiko tinggi dapat dideteksi secara langsung, sehingga berpotensi menyelamatkan waktu berharga beberapa bulan. Kami senang untuk membuat penelitian kami tersedia secara publik dan, yang paling penting, menantikan dampaknya yang terus-menerus di dunia nyata,” kata Beguir.

Selama periode 11 bulan, EWS dapat membedakan varians yang ditetapkan oleh WHO dari varians yang tidak ditetapkan.

Sistem yang baru dikembangkan ini datang ketika BioNTech dan InstaDeep terus bekerja sama untuk menggabungkan AI dan imunologi, yang telah mereka lakukan sejak November 2020. Kedua perusahaan ini mendirikan laboratorium inovasi AI bersama di London, UK, dan Mainz, Jerman. Laboratorium ini bertujuan untuk memajukan penemuan dan desain obat baru, rekayasa protein, manufaktur, dan optimasi rantai pasokan.