Colossal ने डोडो के जीन-संपादन के लक्ष्य पहचानने के लिए GenoMorph AI पेश किया

Colossal Biosciences ने 14 अक्टूबर 2026 को GenoMorph का अनावरण किया। यह सीमित जीनोमिक डेटा वाली प्रजातियों के लिए जीन-संपादन के लक्ष्य पहचानने के उद्देश्य से विकसित कृत्रिम बुद्धिमत्ता का एक मंच है। कंपनी ने बताया कि उसकी डोडो को विलुप्ति से वापस लाने की परियोजना में इस प्रणाली ने पक्षियों की चोंच के आकार और आकृति से जुड़े अनुमानित 2,300 संभावित नियामक DNA तत्वों की पहचान की है।

डलास-स्थित कंपनी ने अपने पक्षी-विषयक कार्यक्रम में हुई कई प्रगति के साथ इस मंच की घोषणा की: उसके डायर वुल्फ प्रोजेक्ट की तकनीक से तैयार किया गया डोडो का कहीं बेहतर जीनोम संयोजन, निकोबार कबूतरों की विस्तारित कॉलोनी, निकोबार कबूतरों से पहली बार प्राप्त की गईं जनन कोशिकाएँ, मुर्गियों के भ्रूणीय स्टेम-सेल काइमेरा का पहली बार अंडों से निकलना और पक्षियों के भ्रूणों में जीन-संपादन के उपकरण पहुँचाने के लिए लिपिड नैनोकणों पर आधारित प्रणाली। Colossal ने कहा कि इन क्षमताओं से मिलकर वह जीनोमिक, कोशिकीय और प्रजनन-संबंधी आधार मिलता है जिसकी मदद से डोडो के अनुमानित लक्षणों को प्रयोगों से सत्यापित जीन-संपादनों में बदला जा सकता है। यह घोषणा 2025 में कंपनी की ओर से बताई गई प्रगति पर आधारित है, जिसमें कबूतरों की जनन कोशिकाएँ, जीन-संपादित मुर्गी विकल्प और पक्षियों के तुलनात्मक जीनोम शामिल थे। उद्यमी Ben Lamm और आनुवंशिकीविद् George Church द्वारा स्थापित Colossal का कहना है कि वह प्रजातियों को विलुप्ति से वापस लाने के लिए CRISPR तकनीक लागू करने वाली पहली कंपनी है।

GenoMorph मंच

GenoMorph तुलनात्मक जीनोमिक्स, विकासात्मक जीवविज्ञान और उच्च-रिज़ॉल्यूशन वाले त्रि-आयामी आकारिकी विश्लेषण को मिलाकर अनुमान लगाता है कि विकास के दौरान कौन-से नियामक तत्व सक्रिय हो सकते हैं और कौन-से तत्व शारीरिक बनावट के अंतर से सबसे अधिक जुड़े हैं। प्रोटीन बनाने के निर्देश देने वाले प्रोटीन-कोडिंग जीनों से अलग, नियामक DNA यह नियंत्रित करता है कि उन निर्देशों को कब, कहाँ और कितनी तीव्रता से सक्रिय किया जाए। इसी से पक्षी की खोपड़ी और चोंच के आकार तथा संरचना जैसे लक्षण तय होते हैं।

इस मंच को तैयार करने के लिए Colossal की पक्षी-विषयक टीम ने सैकड़ों नमूनों के आधार पर एक ऐसा नियामक एटलस बनाया, जिसे वह पक्षी नियामक एटलस कहती है। ये नमूने मुर्गियों, बटेरों, बत्तखों और कबूतरों से जुटाए गए थे और इनमें भ्रूण-विकास के छह चरणों तथा विकसित होते चेहरे के तीन क्षेत्रों को शामिल किया गया था। टीम ने इन आँकड़ों को 70 से अधिक पक्षी प्रजातियों के जीनोम और CT स्कैन से प्राप्त खोपड़ी के मापों के साथ जोड़ा। इनमें डोडो का निकटतम जीवित संबंधी निकोबार कबूतर भी शामिल था; मापों का मानचित्रण 541 शारीरिक संरचना-संबंधी बिंदुओं के आधार पर किया गया।

डोडो परियोजना पर लागू किए गए विश्लेषण में चोंच के आकार से जुड़े 653 संभावित नियामक तत्व और चोंच की मोटाई तथा चौड़ाई से जुड़े 1,698 तत्व पहचाने गए। Colossal ने कहा कि इन निष्कर्षों से यह साबित नहीं होता कि ये तत्व उन लक्षणों का कारण हैं; इसके बजाय, वे प्रयोगों में जाँच के लिए प्राथमिकता वाले लक्ष्य उपलब्ध कराते हैं। चेहरे और खोपड़ी के विकास को प्रभावित करने की पुष्टि जिन तत्वों के लिए होगी, उन्हें बाद में निकोबार कबूतर के जीनोम में सटीक जीन-संपादन के लिए चुना जा सकता है।

Colossal के CEO और सह-संस्थापक Ben Lamm ने कहा, “विलुप्त प्रजातियों को वापस लाने का काम जीवविज्ञान जितनी ही हद तक डेटा की समस्या भी है।” उन्होंने कहा कि डोडो के बहुत कम जीनोम उपलब्ध होने के कारण कंपनी उन जनसंख्या-स्तरीय तुलनाओं पर निर्भर नहीं कर सकती जो कई जीवित प्रजातियों के लिए उपलब्ध हैं। इसके बजाय GenoMorph पहले यह सीखता है कि नियामक DNA जीवित पक्षियों के आकार-रूप को कैसे प्रभावित करता है, और फिर उन आनुवंशिक स्विचों की पहचान करता है जिन्होंने डोडो की विशिष्ट शारीरिक बनावट में योगदान दिया हो सकता है। Lamm ने इस मंच को ऐसी विलुप्त प्रजातियों के लिए एक बार-बार अपनाया जा सकने वाला तरीका बताया जिनके जीनोमिक अभिलेख भी इसी तरह सीमित हैं।

अनुमान से प्रयोगों द्वारा सत्यापन तक

कंपनी ने कहा कि संभावित तत्वों का कार्यात्मक सत्यापन करने के अध्ययन शुरू हो रहे हैं। चेहरे और खोपड़ी के विकास को प्रभावित करने की पुष्टि जिन तत्वों के लिए होगी, उन्हें निकोबार कबूतर के जीनोम में सटीक संपादन के लिए प्राथमिकता दी जा सकती है। मुख्य विज्ञान अधिकारी Beth Shapiro ने कहा कि डोडो की विशिष्ट शारीरिक बनावट नियामक निर्देशों के ऐसे जाल से विकसित हुई थी, जिसे केवल प्राचीन DNA के आधार पर समझना कठिन है। उन्होंने कहा कि जीवित पक्षियों की व्यापक विविधता को कृत्रिम बुद्धिमत्ता के साथ जोड़ने से GenoMorph उन नियामक बदलावों को प्राथमिकता दे सकता है जिन्होंने डोडो की बनावट को आकार देने में सबसे अधिक भूमिका निभाई होगी, और फिर उनकी कार्यात्मक पुष्टि की जा सकती है।

Colossal की पक्षी-प्रजाति निदेशक Anna Keyte ने कहा, “सिर्फ सामान्य डेटा का इस्तेमाल करके AI को विकास से जुड़े किसी सटीक सवाल का जवाब देने के लिए प्रशिक्षित नहीं किया जा सकता।” उन्होंने कहा कि टीम को यह समझने के लिए डेटा जुटाना पड़ा कि प्रजातियों, विकास के चरणों और चेहरे के अलग-अलग क्षेत्रों में नियामक गतिविधि कैसे बदलती है। इस डेटासेट को तैयार करने के लिए एक वर्ष से अधिक समय तक केंद्रित प्रयोगात्मक काम करना पड़ा।

प्रारंभिक निष्कर्ष Craniofacial Gordon Research Conference और Society for Molecular Biology and Evolution की 2026 की वार्षिक बैठक में प्रस्तुत किए गए। Colossal के शोधकर्ताओं और शैक्षणिक सहयोगियों द्वारा तैयार एक सम्मेलन पोस्टर में इस पद्धति का विवरण दिया गया है: कबूतर, मुर्गी, बटेर और बत्तख के भ्रूणों के छह विकासात्मक चरणों में कपाल-चेहरे के विच्छेदन से प्राप्त क्रोमैटिन-सुलभता के आँकड़ों पर एक कन्वोल्यूशनल न्यूरल नेटवर्क को प्रशिक्षित किया गया, फिर उसका उपयोग 363 पक्षी प्रजातियों के संरेखण में सुलभता का पूर्वानुमान लगाने के लिए किया गया। पोस्टर के अनुसार, रिसीवर-ऑपरेटिंग विशेषता वक्र के नीचे के क्षेत्रफल से मापी गई पूर्वानुमान की औसत सटीकता, एक ही प्रजाति के भीतर 0.863 और विभिन्न प्रजातियों के बीच 0.848 थी। सभी 363 प्रजातियों के लिए VertNet से प्राप्त चोंच की लंबाई के माप और अनुमानित सुलभता के बीच किए गए वंशवृक्षीय प्रतिगमन में, जाँचे गए 293,686 खुले क्रोमैटिन क्षेत्रों में से 210 का चोंच की लंबाई के साथ महत्वपूर्ण संबंध पाया गया; झूठी खोज दर 0.2 से कम थी। इनमें CACHD1 जीन को प्रमुख संभावित उम्मीदवार के रूप में रेखांकित किया गया। पोस्टर में यह भी बताया गया है कि अग्र-नाकीय प्रवर्ध के विकास के दौरान लंबी चोंच वाली प्रजातियों में CACHD1 की अभिव्यक्ति बढ़ी हुई थी, और एक अलग प्रतिलेख-विज्ञान विश्लेषण में लंबी और छोटी चोंच वाली प्रजातियों के बीच प्रजाति-विशिष्ट अभिव्यक्ति-गतिशीलता वाले 356 जीनों की पहचान की गई।

डोडो का अधिक संपूर्ण जीनोम

Colossal ने डोडो के जीनोम पर हुई प्रगति की भी जानकारी दी। प्राचीन डीएनए छोटे और क्षतिग्रस्त टुकड़ों के रूप में बचा रहता है। पारंपरिक संयोजन विधियाँ इन टुकड़ों का मिलान किसी जीवित प्रजाति के संदर्भ जीनोम से करती हैं—इस मामले में निकोबार कबूतर से—और जो टुकड़े इतने भिन्न हों कि उनका संरेखण न हो सके, उन्हें छोड़ सकती हैं। इससे जीनोम संयोजन में रिक्तियाँ रह सकती हैं और पुनर्निर्मित जीनोम जीवित प्रजाति की ओर झुक सकता है।

कंपनी की प्रकाशित पुनरावृत्त संयोजन पद्धति, जिसे उसके डायर वुल्फ कार्यक्रम के दौरान विकसित किया गया था, नए संरेखित डोडो डीएनए का उपयोग करके संदर्भ जीनोम को क्रमशः अद्यतन करती है। इससे हर अगले दौर में पहले बेमेल रहे टुकड़े रिक्तियों को भर सकते हैं, जब तक कि नए पुनःप्राप्त अनुक्रमों की संख्या स्थिर न हो जाए। Colossal ने बताया कि अब उसके डोडो जीनोम के 95% आधार कम-से-कम 5-गुना कवरेज में हैं और औसत कवरेज 65-गुना है। Shapiro ने कहा कि टीम डोडो जीनोम के विश्लेषण के अंतिम चरणों में है और जीनोम पर शोध-पत्र की सहकर्मी समीक्षा पूरी होने के बाद और जानकारी दी जाएगी।

कॉलोनी का विस्तार, स्टेम कोशिकाएँ और भ्रूण संपादन

स्थापित जोड़ों के बीच सफल प्रजनन के बाद Colossal ने टेक्सास स्थित अपनी निकोबार कबूतर कॉलोनी का विस्तार कर उसमें 36 पक्षी कर दिए। हाल के प्रजनन मौसम में एकत्र किए गए अंडों से निकोबार कबूतर की आद्य जनन कोशिकाएँ प्राप्त की गईं—ये वे कोशिकाएँ हैं जो आगे चलकर शुक्राणु और अंडाणु बनती हैं। Colossal ने कहा कि वंशानुगत जीनोम-संपादन करने और चुने हुए डोडो लक्षणों वाले पक्षियों की भावी पीढ़ियाँ पैदा करने के लिए इन कोशिकाओं को स्थापित करना आवश्यक है। कंपनी मौजूदा गुणसूत्र-स्तरीय संयोजन को बेहतर बनाने के लिए निकोबार कबूतर का टेलोमियर-से-टेलोमियर जीनोम भी तैयार कर रही है। साथ ही, उसकी योजना है कि विलुप्त डोडो के संबंधी रोड्रिग्स सॉलिटेयर के नए उपलब्ध अनुक्रम आँकड़ों को बेहतर संदर्भ जीनोम के आधार पर फिर से संरेखित किया जाए, ताकि उसका कवरेज और पूर्णता बढ़े।

कंपनी के वैज्ञानिकों ने एक नए मंच से तैयार किए गए पहले काइमेरिक मुर्गियों के चूज़े भी निकाले। यह मंच पक्षी भ्रूणीय स्टेम कोशिकाओं पर आधारित है। Colossal ने कहा कि इससे पुष्टि होती है कि संवर्धित कोशिकाएँ मेज़बान भ्रूण में समाहित होने और उसके ऊतकों में योगदान देने की विकासात्मक क्षमता बनाए रखती हैं। इस संवर्धन प्रणाली का विस्तार कबूतरों तक किया जा रहा है, ताकि आद्य जनन कोशिकाओं में कोई संपादन करने से पहले संपादित स्टेम कोशिकाओं का काइमेरिक कबूतरों में परीक्षण करके उनके अनुमानित लक्षणगत प्रभावों का आकलन किया जा सके। इससे लक्षण-जाँच का एक मंच स्थापित होगा।

अंत में, Colossal ने बताया कि उसने लिपिड नैनोकणों पर आधारित एक वितरण मंच विकसित किया है, जो विकसित होते पक्षी भ्रूणों में डीएनए, आरएनए और CRISPR जीन-संपादन उपकरण पहुँचाता है और पारंपरिक वितरण विधियों की तुलना में भ्रूणों के जीवित रहने की दर भी बेहतर करता है। कंपनी के प्रयोगों में, अस्थि-विकास नियामक Runx2 का संपादन करने से कपाल-चेहरे के लक्षणों में स्पष्ट बदलाव आया। इस प्रणाली का उपयोग रॉक डव और बत्तख के भ्रूणों में भी किया गया है। Colossal ने कहा कि उसके वैज्ञानिक GenoMorph द्वारा पहचाने गए नियामक तत्वों की लगभग वास्तविक समय में पुष्टि करने के लिए इस मंच का उपयोग कर रहे हैं; सबसे मजबूत उम्मीदवारों को आगे के सटीक-संपादन अध्ययनों के लिए निकोबार कबूतर की आद्य जनन कोशिकाओं में तैयार किया जा रहा है; और इस मंच का वर्णन करने वाला एक शोध-पांडुलिपि bioRxiv प्रीप्रिंट सर्वर पर जमा किया गया है।