Πέτρος Έλμαν, Πρόεδρος και Διευθύνων Σύμβουλος της Certis Oncology Solutions – Σειρά Συνεντεύξεων

Certis Oncology Solutions, υπό την ηγεσία του Πέτρου Έλμαν, Προέδρου και Διευθύνοντος Συμβούλου, είναι μια εταιρεία τεχνολογίας ζωτικών επιστημών που είναι αφιερωμένη στην εκπλήρωση της υπόσχεσης της ακριβούς ογκολογίας. Το προϊόν της εταιρείας είναι το Oncology Intelligence® — υψηλά προβλέψιμα δεδομένα θεραπευτικής απόκρισης που προέρχονται από προηγμένα μοντέλα καρκίνου. Η Certis συνεργάζεται με γιατρούς-επιστήμονες και ερευνητές της βιομηχανίας για να επεκτείνει την πρόσβαση στην ακριβή ογκολογία και να αντιμετωπίσει το κρίσιμο χάσμα μετάφρασης μεταξύ προκλινικών μελετών και κλινικών δοκιμών.

Μπορείτε να περιγράψετε το ευρύτερο πρόβλημα στην ογκολογική έρευνα που αντιμετωπίζει το CertisOI Assistant;

Το ποσοστό αποτυχίας των υποψήφιων φαρμάκων ογκολογίας είναι υψηλό. Πρόσφατα αναφέρθηκε ότι το 2023, το 90% των προγραμμάτων ογκολογίας απέτυχε最終ικά. Αυτός ο αριθμός είναι μια αξιοσημείωτη βελτίωση σε σχέση με την ιστορική τάση, η οποία κυμαινόταν γύρω στο 96% μέχρι το 2022. Λαμβάνοντας υπόψη το κόστος ανάπτυξης φαρμάκων, ένα ποσοστό αποτυχίας 90% δεν είναι βιώσιμο. Φανταστείτε πώς οι ασθενείς θα ωφεληθούν αν το ποσοστό επιτυχίας ήταν ακόμη και 50%.

CertisOI Assistant αντιμετωπίζει άμεσα δύο πολύ σημαντικά ζητήματα που συνεισφέρουν σε αυτό το ποσοστό αποτυχίας:

• Βελτιωμένη επιλογή προκλινικών μοντέλων: Πολυάριθμες ουσίες δείχνουν υποσχόμενες αποτελέσματα σε προκλινικές μελέτες αλλά αποτυγχάνουν να αποδείξουν επαρκή θεραπευτική επίδραση στους ανθρώπους. Τα περισσότερα μέλη της επιστημονικής κοινότητας υπογραμμίζουν τα προκλινικά μοντέλα ως μέρος του προβλήματος. Η επιλογή προκλινικών μοντέλων με τη σωστή υπογραφή γονιδιακής έκφρασης (και η χρήση ορθοτοπικών εμβολών για κρίσιμες μελέτες) μπορεί να βελτιώσει την «μετάφραση» στην κλινική.
• Πρόωρη, καλύτερη ταυτοποίηση βιοδεικτών: Η εξάρτηση από βιοδείκτες που δεν προβλέπουν με ακρίβεια τη θεραπευτική απόκριση μπορεί να οδηγήσει σε αποτυχημένες κλινικές δοκιμές. Το CertisOI Assistant είναι ενσωματωμένο με το CertisAI, τη патент-pending προβλέψιμη πλατφόρμα AI/ML, που επιτρέπει την ταυτοποίηση προβλέψιμων βιοδεικτών νωρίς στη διαδικασία ανάπτυξης φαρμάκων.

Πώς χρησιμοποιεί το CertisOI Assistant την τεχνητή νοημοσύνη για να βελτιώσει την πρόσβαση στα ογκολογικά δεδομένα και τι το διακρίνει από άλλα εργαλεία τεχνητής νοημοσύνης στο πεδίο;

Το CertisOI Assistant παρέχει προηγμένες ικανότητες ανάλυσης δεδομένων και προβλέψιμου μοντελισμού μέσω eines εύχρηστου, φυσικού διαλόγου. Ξεχωρίζει με πολλούς τρόπους:

• Ενσωμάτωση ολοκληρωμένων δεδομένων: Το βοηθό παρέχει μια ολοκληρωμένη βάση δεδομένων που περιλαμβάνει πληροφορίες ασθενών, χαρακτηριστικά όγκων, γενετικά προφίλ και προβλέψεις απόκρισης φαρμάκων. Αυτή η ολιστική προσέγγιση επιτρέπει μια πιο ολοκληρωμένη ανάλυση από εργαλεία που επικεντρώνονται σε απομονωμένα τύποι δεδομένων.
• Προβλέψεις με βάση την τεχνητή νοημοσύνη: Το βοηθό χρησιμοποιεί αλγόριθμους τεχνητής νοημοσύνης για να προβλέψει την απόκριση και την αντοχή στα φάρμακα, προσφέροντας πληροφορίες σχετικά με ποια θεραπείες είναι πιθανό να είναι αποτελεσματικές για συγκεκριμένα μοντέλα καρκίνου. Αυτή η προβλέψιμη ικανότητα είναι κρίσιμη για την προσωπική ιατρική και τη διακρίνει από εργαλεία που βασίζονται αποκλειστικά σε ιστορικά δεδομένα.
• Εύχρηστη διεπαφή: Παρέχοντας μια διεπαφή που είναι εύκολη στη χρήση για την ερώτηση και την ανάλυση σύνθετων συνόλων δεδομένων, το βοηθό κάνει πιο εύκολη την πρόσβαση και την ερμηνεία των ογκολογικών δεδομένων χωρίς να απαιτείται προηγμένη τεχνική εμπειρία.
• Εστίαση στα προκλινικά μοντέλα: Το βοηθό ειδικεύεται στην προκλινική ογκολογική έρευνα, ιδιαίτερα στα μοντέλα PDX και κυτταρικών γραμμών, προσφέροντας μοναδικές πληροφορίες σχετικά με την πρώιμη ανάπτυξη φαρμάκων και τη βιολογία του όγκου.
• Διαδραστικές οπτικοποιήσεις: Το βοηθό υποστηρίζει διαδραστικές οπτικοποιήσεις, όπως φαρμακολογικές και μελέτες αύξησης όγκου, που επιτρέπουν στους ερευνητές να εξερευνήσουν τα δεδομένα με πιο ελκυστικό και ενημερωτικό τρόπο.

Πώς μετατρέπει το εργαλείο τα σύνθετα δεδομένα σε δράσιμες πληροφορίες, ιδιαίτερα για ερευνητές που εργάζονται σε δεδομένα ευαισθησίας φαρμάκων ή γενωμικής;

Το CertisOI Assistant αξιοποιεί μια δομημένη ροή εργασίας για να μετατρέψει τα ακατέργαστα δεδομένα σε σημαντικές πληροφορίες. Περιλαμβάνει την ερώτηση μιας ολοκληρωμένης βάσης δεδομένων ογκολογίας, την ανάλυση των δεδομένων και την παρουσίαση των αποτελεσμάτων σε μια σαφή και ερμηνεύσιμη μορφή. Εδώ είναι πώς λειτουργεί:

• Ερώτηση δεδομένων: Το CertisOI Assistant μπορεί να προσεγγίσει μια σχεσιακή βάση δεδομένων που περιέχει λεπτομερείς πληροφορίες σχετικά με τα ογκολογικά μοντέλα, συμπεριλαμβανομένων δεδομένων ασθενών, χαρακτηριστικών όγκων, γενωμικών δεδομένων και προβλέψεων απόκρισης φαρμάκων. Χρησιμοποιεί ερωτήσεις SQL-τύπου για να εξαγάγει σχετικά δεδομένα με βάση τις συγκεκριμένες ανάγκες του ερευνητή.
• Ανάλυση δεδομένων: Μόλις τα δεδομένα ανακτηθούν, το CertisOI Assistant μπορεί να thựcέσει διάφορες αναλύσεις, όπως την ταυτοποίηση κοινών μεταλλάξεων, τη συσχέτιση της γονιδιακής έκφρασης με την ευαισθησία στα φάρμακα ή την αξιολόγηση των αποτελεσμάτων των φαρμακολογικών μελετών. Μπορεί επίσης να κατατάξει και να φιλτράρει τα δεδομένα για να υπογραμμίσει τις πιο σημαντικές ανακαλύψεις.
• Οπτικοποίηση: Το βοηθό μπορεί να παρουσιάσει τα δεδομένα σε μορφή πίνακα, να δημιουργήσει διαδραστικά γραφήματα για φαρμακολογικές και μελέτες αύξησης όγκου και να εμφανίσει εικόνες ιστολογίας. Αυτή η οπτικοποίηση βοηθά τους ερευνητές να κατανοήσουν γρήγορα σύνθετα μοτίβα δεδομένων και σχέσεις.
• Ερμηνεία και πληροφορίες: Παρέχοντας μια σαφή ερμηνεία των δεδομένων, συμπεριλαμβανομένων προβλέψεων για την ευαισθησία ή την αντοχή στα φάρμακα, το CertisOI Assistant βοηθά τους ερευνητές να λάβουν ενημερωμένες αποφάσεις σχετικά με πιθανές θεραπευτικές στρατηγικές ή περαιτέρω πειραματικές κατευθύνσεις.
• Προσαρμογή και ευελιξία: Οι ερευνητές μπορούν να προσαρμόσουν τις ερωτήσεις τους για να επικεντρωθούν σε συγκεκριμένα είδη καρκίνου, γενετικούς δείκτες ή απαντήσεις φαρμάκων, επιτρέποντας μια高度 προσαρμοσμένη ανάλυση που συμφωνεί με τους ερευνητικούς στόχους.

Πώς ενισχύει το CertisOI Assistant την ικανότητα των ερευνητών να επιλέξουν ογκολογικά μοντέλα, να σχεδιάσουν στρατηγικές βιοδεικτών ή να thựcέσουν επαλήθευσεις in silico;

Κάλυψα τις πρώτες δύο περιοχές – το τμήμα μοντέλων καρκίνου και το σχέδιο στρατηγικής βιοδεικτών – στην αρχή αυτής της συνέντευξης, οπότε θα επικεντρωθώ στην πραγματοποίηση επαλήθευσεων in silico. Το CertisOI Assistant παρέχει ένα εικονικό περιβάλλον για να δοκιμάσει και να επικυρώσει υποθέσεις σχετικά με την αποτελεσματικότητα φαρμάκων, την εμπλοκή στόχων και την ανακάλυψη βιοδεικτών χωρίς την ανάγκη άμεσων εργαστηριακών πειραμάτων. Αυτό επιτρέπει στους ερευνητές να βελτιώσουν γρήγορα τις υποθέσεις τους και να επικεντρώσουν τις πειραματικές προσπάθειες στις πιο υποσχόμενες οδούς.

Εδώ είναι quelques παραδείγματα:

• Προβλέψεις απόκρισης φαρμάκων: Χρησιμοποιήστε προβλέψεις με βάση την τεχνητή νοημοσύνη για την απόκριση και την αντοχή στα φάρμακα για να αξιολογήσετε πώς είναι πιθανό να ανταποκριθούν διαφορετικά μοντέλα σε συγκεκριμένα φάρμακα. Αυτό μπορεί να βοηθήσει στην επικύρωση της πιθανής αποτελεσματικότητας ενός φαρμάκου in silico πριν από τη μετάβαση σε in vitro ή in vivo μελέτες.
• Γενωμική και μοριακή προφίλ: Αναλύστε τα γενωμικά δεδομένα, συμπεριλαμβανομένων μεταλλάξεων, γονιδιακής έκφρασης και αντιγράφων γονιδίων, για να ταυτοποιήσετε πιθανούς στόχους και να επικυρώσετε τη συσχέτισή τους με το μηχανισμό δράσης του φαρμάκου. Αυτό μπορεί να βοηθήσει στην κατανόηση της μοριακής βάσης της ευαισθησίας ή της αντοχής στα φάρμακα.
• Ανακάλυψη βιοδεικτών: Συσχετίστε τις μοριακές ιδιότητες με προβλέψεις απόκρισης φαρμάκων για να ταυτοποιήσετε πιθανούς προβλέψιμους βιοδείκτες. Αυτό μπορεί να οδηγήσει στην επιλογή πληθυσμών ασθενών που είναι πιθανό να ωφεληθούν από μια συγκεκριμένη θεραπεία.
• Εξερεύνηση συνδυασμών θεραπειών: Εξερευνήστε προβλέψεις συναδέλφωσης φαρμάκων για να ταυτοποιήσετε υποσχόμενους συνδυασμούς φαρμάκων που μπορεί να βελτιώσουν τις θεραπευτικές αποτελέσματα. Αυτό μπορεί να παρέχει πληροφορίες σχετικά με πιθανές στρατηγικές συνδυασμού που μπορούν να επικυρωθούν πειραματικά.
• Ιστολογική ανάλυση: Χρησιμοποιήστε εικόνες ιστολογίας για να επικυρώσετε τις μορφολογικές επιπτώσεις των φαρμάκων στα ιστία όγκων, παρέχοντας επιπλέον στοιχεία για το μηχανισμό δράσης και την πιθανή αποτελεσματικότητα του φαρμάκου.
• Συγκρίσεις μοντέλων: Συγκρίνετε διαφορετικά μοντέλα για να κατανοήσετε πώς οι διάφορες γενετικές υποβάθρες επηρεάζουν την απόκριση στα φάρμακα, βοηθώντας στην επικύρωση υποθέσεων σχετικά με το ρόλο συγκεκριμένων γονιδίων ή μονοπατιών in silico.
• Εικονική οθόνη: Thựcέστε εικονική οθόνη φαρμάκων σε ένα ευρύ φάσμα μοντέλων για να προτεραιότητα τους υποψήφιους για περαιτέρω πειραματική επικύρωση.

Μπορείτε να μοιραστείτε παραδείγματα του πώς οι ερευνητές αναμένεται να χρησιμοποιήσουν αυτό το εργαλείο για να βελτιώσουν τις ροές εργασίας τους ή να επιτύχουν突破;

Το απλούστερο παράδειγμα είναι η επιλογή προκλινικών μοντέλων. Κάθε προκλινική μελέτη αρχίζει με την επιλογή μοντέλων όγκων. Το CertisOI Assistant αφαιρεί την χειροκίνητη προσπάθεια από αυτή τη διαδικασία και φέρνει μεγάλη ακρίβεια στην επιλογή των βέλτιστων μοντέλων για οποιαδήποτε μελέτη.

Ένα άλλο παράδειγμα είναι η ανάπτυξη μιας στρατηγικής βιοδεικτών. Η παραδοσιακή προσέγγιση είναι να υποθέσετε ποιοι βιοδείκτες μπορεί να συνδεθούν με το μηχανισμό δράσης του φαρμάκου και στη συνέχεια να δοκιμάσετε αυτές τις υποθέσεις σε προκλινικές μελέτες, που είναι συνήθως μια επαναλαμβανόμενη διαδικασία. Αν τα προκλινικά δεδομένα είναι υποσχόμενα, οι ερευνητές πρέπει να επικυρώσουν προβλέψιμους βιοδείκτες σε κλινικές δοκιμές — και όπως συζητήθηκε, το ποσοστό αποτυχίας είναι υψηλό.

Το CertisOI Assistant βοηθά τους ερευνητές να ταυτοποιήσουν και να επικυρώσουν πιο ακριβείς, προβλέψιμους βιοδείκτες γονιδιακής έκφρασης νωρίτερα στη διαδικασία ανάπτυξης και με λιγότερη επανάληψη από την παραδοσιακή ροή εργασίας — εξοικονομώντας χρόνο, χρήματα και βελτιώνοντας τις πιθανότητες για εμπορική επιτυχία.

Τι είδη ογκολογικών μοντέλων ή συνόλων δεδομένων υποστηρίζει το εργαλείο, και πώς ωφελεί αυτή η εύρος την ερευνητική κοινότητα;

Η τρέχουσα έκδοση του CertisOI παρέχει στους ερευνητές πρόσβαση στη γρήγορα επεκτεινόμενη βιβλιοθήκη της Certis PDX και PDX-παραγώγων μοντέλων όγκων και ολόκληρου του Cancer Cell Line Encyclopedia (CCLE) μοντέλων. Οι αλγόριθμοι της πλατφόρμας επίσης αξιοποιούν δεδομένα από Genomics of Drug Sensitivity in Cancer (GDSC), International Cancer Genome Consortium (ICGC), CI ALMANAC, O’Neil και άλλα συνόλα δεδομένων. Αυτή η ολιστική προσέγγιση στην ενσωμάτωση δεδομένων επιτρέπει μια πιο ολοκληρωμένη ανάλυση από εργαλεία που επικεντρώνονται σε απομονωμένα τύποι δεδομένων.

Το CertisOI Assistant σχεδιάστηκε για να είναι φιλικό προς τους χρήστες. Πώς διασφαλίζετε ότι είναι προσβάσιμο σε ερευνητές που μπορεί να μην έχουν εκτεταμένη τεχνική εμπειρία;

Πολλά χαρακτηριστικά καθιστούν το CertisOI Assistant προσβάσιμο σε ερευνητές σε όλα τα επίπεδα:

• Εύχρηστη διεπαφή: Η διεπαφή σχεδιάστηκε για να είναι εύκολη στη χρήση και να επιτρέπει στους χρήστες να thựcέσουν σύνθετες ερωτήσεις και αναλύσεις χωρίς να χρειάζεται να κατανοήσουν τις υποκείμενες τεχνικές λεπτομέρειες.
• Οδηγούμενες ροές εργασίας: Το βοηθό παρέχει οδηγούμενες ροές εργασίας για κοινές ερευνητικές εργασίες, όπως η ερώτηση προβλέψεων απόκρισης φαρμάκων, η ανάλυση γενωμικών δεδομένων και η εξέταση φαρμακολογικών μελετών. Αυτό βοηθά τους χρήστες να επικεντρωθούν στις ερευνητικές ερωτήσεις τους χωρίς να μπερδευτούν στις τεχνικές сложότητες.
• Επεξεργασία φυσικής γλώσσας: Οι χρήστες μπορούν να αλληλεπιδράσουν με το βοηθό χρησιμοποιώντας ερωτήσεις φυσικής γλώσσας, καθιστώντας πιο εύκολη την πρόσβαση στις πληροφορίες που χρειάζονται για εκείνους που δεν έχουν τεχνική εμπειρία. Το βοηθό ερμηνεύει τις ερωτήσεις και τις μετατρέπει στις κατάλληλες ερωτήσεις βάσης δεδομένων.
• Περιεκτική τεκμηρίωση: Λεπτομερής τεκμηρίωση και οδηγοί βοηθούν τους χρήστες να κατανοήσουν πώς να χρησιμοποιήσουν το βοηθό αποτελεσματικά. Αυτό περιλαμβάνει βήμα προς βήμα οδηγούς, παραδείγματα και εξηγήσεις κρίσιμων εννοιών.
• Διαδραστικές οπτικοποιήσεις: Το βοηθό παρέχει διαδραστικές οπτικοποιήσεις για την ανάλυση δεδομένων, όπως διαγράμματα και εικόνες ιστολογίας, επιτρέποντας στους χρήστες να εξερευνήσουν και να ερμηνεύσουν τα δεδομένα οπτικά χωρίς να χρειάζεται να γράψουν κώδικα.
• Απάντηση υποστήριξης: Οι χρήστες μπορούν να έχουν πρόσβαση σε απάντηση υποστήριξης για να βοηθήσει με οποιαδήποτε ερωτήσεις ή προβλήματα. Αυτό διασφαλίζει ότι μπορούν να λάβουν βοήθεια γρήγορα και να συνεχίσουν την έρευνά τους χωρίς άσκοπες καθυστερήσεις.
• Προσαρμογή ερωτήσεων: Ενώ το βοηθό παρέχει προεπιλεγμένες ροές εργασίας, επίσης επιτρέπει την προσαρμογή, επιτρέποντας στους χρήστες να προσαρμόσουν τις ερωτήσεις τους για να επικεντρωθούν σε συγκεκριμένα είδη καρκίνου, γενετικούς δείκτες ή απαντήσεις φαρμάκων χωρίς να χρειάζεται βαθιά τεχνική γνώση.

Η συνεργασία είναι ένα κρίσιμο στοιχείο της έρευνας. Πώς το CertisOI Assistant διευκολύνει τη συνεργασία μεταξύ ερευνητών ή ιδρυμάτων;

Με το CertisOI Assistant, ερευνητές από διαφορετικές ομάδες ή ιδρύματα μπορούν να έχουν πρόσβαση στα ίδια δεδομένα και εργαλεία, επιτρέποντας τους να εργαστούν συνεργατικά σε κοινά έργα ή ερευνητικά ερωτήματα. Η πλατφόρμα επίσης κάνει εύκολη την λήψη και την κοινή χρήση ερωτήσεων δεδομένων, αποτελεσμάτων και πληροφοριών μεταξύ μελών της ομάδας, ώστε όλοι όσοι εμπλέκονται σε ένα έργο να μπορούν να συνεισφέρουν αποτελεσματικά.

Ποια είναι τα μεγαλύτερα προκλήματα στην κλίμακα της υιοθέτησης της τεχνητής νοημοσύνης στην ογκολογική έρευνα, και πώς μπορούν να αντιμετωπιστούν;

Σημαντικά προκλήματα περιλαμβάνουν την ασφάλεια δεδομένων, την ενσωμάτωση δεδομένων και την εμπιστοσύνη στις προβλέψεις της τεχνητής νοημοσύνης. Δεν είμαι ειδικός στην ασφάλεια δεδομένων ή την ενσωμάτωση δεδομένων, αλλά μεγάλοι νουες δουλεύουν για να λύσουν αυτά τα προβλήματα. Όσον αφορά την εμπιστοσύνη στις προβλέψεις της τεχνητής νοημοσύνης, χρειαζόμαστε αποτελεσματικά και πιστά μέσα για να επικυρώσουμε αυτές τις προβλέψεις.

Η Certis έχει υιοθετήσει μια διπλή προσέγγιση σε αυτό: επαλήθευση in silico μέσω εσωτερικών, διασταυρούμενων μελετών και επαλήθευση in vivo — πραγματοποιώντας μελέτες σε κλινικά σχετικά μοντέλα ποντικών για να αξιολογήσουν την ακρίβεια των προβλέψεων της πλατφόρμας. Με τον καιρό, αυτά τα εργαλεία θα επικυρωθούν επίσης κλινικά σε ανθρώπινους ασθενείς — αλλά φυσικά, αυτό θα πάρει πολύ χρόνο, χρήματα και την ικανότητα να αλλάξουμε το τρέχον παράδειγμα θεραπείας καρκίνου. Η ιατρική και ρυθμιστική κοινότητα θα πρέπει να σταματήσει να βασίζεται στο πώς έχουν γίνει τα πράγματα μέχρι τώρα και να ενστερνιστεί τη δύναμη των υπολογιστικών αναλύσεων για να ενημερώσει τις αποφάσεις.

Πώς οραματίζεστε εργαλεία όπως το CertisOI Assistant να διαμορφώνουν το μέλλον της θεραπείας καρκίνου και της ακριβούς ιατρικής;

Η σύγχρονη ιατρική δεν έχει ακόμη ένα καλό τρόπο να ταιριάξει τους ασθενείς με τις ιδανικές θεραπείες. Συνολικά, μόνο το 10% των ασθενών με καρκίνο βιώνουν κλινικό όφελος από θεραπείες που ταιριάζουν με τις μεταλλάξεις του DNA του όγκου. Αυτό όχι μόνο βλάπτει την υγεία των ασθενών, αλλά cũng τους βλάπτει οικονομικά. एक εκτίμηση $2.5 δισεκατομμύρια —με ένα B—δαπανώνται σε ανεфективές θεραπείες. Είναι ένα πολύ λυπηρό γεγονός ότι 42% των ασθενών με καρκίνο εξαντλούν πλήρως τα περιουσιακά τους στοιχεία μέχρι το δεύτερο έτος της διάγνωσής τους.

Εργαλεία όπως το CertisOI Assistant και CertisAI θα μας βοηθήσουν να πραγματοποιήσουμε την υπόσχεση της ακριβούς ιατρικής — να λάβουν οι άνθρωποι την ιδανική θεραπεία για την μοναδική μορφή καρκίνου τους την πρώτη φορά, κάθε φορά…. Και να δημοκρατίσουμε την πρόσβαση σε πιο αποτελεσματική, προσωπική φροντίδα.

Ευχαριστώ για τη μεγάλη συνέντευξη, οι αναγνώστες που επιθυμούν να μάθουν περισσότερα πρέπει να επισκεφθούν Certis Oncology Solutions.