OpenAI præsenterer atlas over ræsonnementer om musehjernen fra GPT-Rosalind-agenter

Den 21. oktober 2026 meddelte OpenAI, at virksomheden, PerturbAI og Scripps Research havde brugt tusindvis af AI-agenter drevet af GPT-Rosalind til på 32 minutter at analysere eksisterende forsøgsdata fra millioner af musehjerneceller og samle agenternes rapporter i et offentligt tilgængeligt ræsonneringsatlas.

Distribueret biologisk ræsonnering

Tilgangen, som OpenAI kalder distribueret biologisk ræsonnering, fordelte analysen mellem tusindvis af agenter, der undersøgte et CRISPR-atlas over hele hjernen – et datasæt, der viser, hvordan genforstyrrelser påvirker forskellige celletyper i musehjernen. Hver agent undersøgte en genforstyrrelse, analyserede cellernes reaktioner, søgte i den videnskabelige litteratur og foreslog forklaringer på resultaterne. Agenternes rapporter blev samlet i et ræsonneringsatlas, der forbinder gener, cellulære virkninger, relevante publikationer og mulige biologiske mekanismer.

OpenAI oplyste, at forskerholdet vurderede, at en tilsvarende menneskelig analyse og gennemgang af litteraturen, udført med én perturbation ad gangen, ville tage fra flere måneder til et år. Agenterne genskabte resultater fra menneskelige analyser og afdækkede samtidig yderligere spor, og deres vurderinger af nyhedsværdi og videnskabelig betydning stemte overens med vurderingerne fra blindede menneskelige eksperter.

Sarah Teichmann, indehaver af et professorat i stamcellemedicin ved University of Cambridge og medstiftende medformand for Human Cell Atlas, sagde i OpenAIs meddelelse: »Vi opbygger celleatlas, så andre forskere kan gøre opdagelser, vi endnu ikke har forestillet os. AI kan hjælpe flere forskere med at udforske disse ressourcer og omsætte uventede observationer til nye spørgsmål, der kan undersøges.«

Et tilhørende fortryk, Distribuerede AI-agenter muliggør omfattende opdagelse af biologisk indsigt i stor skala, blev lagt ud på bioRxiv den 16. oktober 2026 og er ikke blevet fagfællebedømt. Forfatterne er tilknyttet Howard Hughes Medical Institute og Scripps Research, OpenAI, PerturbAI og University of California San Diego, og Xin Jin fra Scripps Research er anført som korresponderende forfatter. Erklæringen om interessekonflikter oplyser, at seks af forfatterne er ansat hos OpenAI, to er ansat hos PerturbAI, og at Grace Zheng og Xin Jin er medstiftere af PerturbAI.

Forskelle mellem Tsc2 og Tsc1 og et spor om kolesterol

Agenterne identificerede en uventet forskel mellem Tsc1 og Tsc2, to gener, der samarbejder om at regulere mTOR, en vigtig regulator af cellevækst, stofskifte og aldring, oplyste meddelelsen. Forstyrrelse af hvert af generne havde lignende virkninger i flere grupper af neuroner. I lillehjernen, der hjælper med at koordinere bevægelser, ændrede forstyrrelse af Tsc2 aktiviteten i snesevis af gener, der er involveret i kommunikationen mellem neuroner, mens forstyrrelse af Tsc1 kun medførte små ændringer.

Meddelelsen bemærker, at forandringer i lillehjernen hos personer med tuberøs sklerose er stærkt forbundet med TSC2-mutationer, og at selv om lægemidler, der reducerer mTOR-aktiviteten, kan behandle visse hjernetumorer og epileptiske anfald, er det fortsat vanskeligt at afhjælpe de indlærings- og adfærdsvanskeligheder, der er forbundet med sygdommen. Agenterne udpegede en bestemt gruppe neuroner og cellulære forandringer til nærmere undersøgelse.

Agenterne fandt også et muligt spor i DCTN1, et gen, hvis mutationer forårsager Perry-syndrom, en neurodegenerativ sygdom med Parkinson-lignende symptomer. DCTN1 medvirker til transport af materiale inde i neuroner, og i atlasset øgede forstyrrelse af Dctn1 ekspressionen af gener, der er involveret i produktionen af kolesterol. Agenterne forbandt denne observation med forskning, der tyder på, at problemer med kolesteroltransport kan få celler til at producere mere kolesterol. Det rejste opfølgende spørgsmål om, hvorvidt forstyrrelse af DCTN1 ændrer fordelingen af kolesterol i neuroner, og om disse ændringer kan bidrage til neurodegeneration. Ifølge meddelelsen vurderede menneskelige eksperter, at hypotesen var ny, betydningsfuld og værd at følge op på.

Tomasz Nowakowski, lektor i neurokirurgi ved UCSF, sagde, at den mulige forbindelse mellem neuronfunktion og kolesterolstofskifte viser, hvordan spor, der er spredt på tværs af forskellige fagområder, kan give en ny måde at tænke på sygdomsbiologi, når de først forbindes.

Distribuerede agenter sammenlignet med én enkelt agent

Forskerholdet undersøgte, om én enkelt agent, der fik adgang til hele datasættet, kunne hamle op med tusindvis af agenter, der arbejdede parallelt, mens modellen og ressourcerne blev holdt uændrede. Efterhånden som arbejdsbyrden voksede, søgte den enkelte agent i en mindre del af litteraturen og henviste kun til 11 kilder ved den største arbejdsbyrde, mens de distribuerede agenter henviste til mere end 700. I blindede sammenligninger foretrak menneskelige eksperter rapporterne fra de distribuerede agenter frem for rapporterne fra den enkelte agent i 75 % af tilfældene.

Fortrykket rapporterer, at agenterne uden adgang til kildemanuskriptet genskabte dets konklusioner, forudsagde virkningerne af perturbationer, der var holdt uden for analysen, og identificerede forbindelser mellem perturbationer med fælles eller modsatrettede udfald på tværs af effektstyrker. Forfatterne anfører, at de distribuerede agenter udvidede litteraturdækningen i takt med arbejdsbyrden og fandt hundredvis af gange flere kilder end i tilstanden med én enkelt agent, og at blindede menneskelige eksperter bakkede op om agenternes rangordning af opdagelser.

Adgang til atlasset, koden og datasættet

Reasoning-atlasset og det underliggende Distributed Agents-framework er offentligt tilgængelige i et GitHub-repositorium, der er udgivet under en MIT-licens. Repositoriet indeholder agentens kørselsmiljø, værktøjer til korpusset samt de notesbøger, der blev brugt til manuskriptets analyser, figurer og supplerende tabeller. Det dokumenterer en hostet, skrivebeskyttet korpustjeneste med MCP-endepunkter, der giver adgang til fund, påstande, underbyggende evidens og analyseværktøjer. Da den hostede server ikke indeholder rådatafilerne, indeholder repositoriet også vejledning i, hvordan frameworket køres lokalt via Codex CLI. Repositoriets seneste commit, som opdaterede bioRxiv-henvisningen, licensen og dokumentationen til den hostede tjeneste, er dateret 21. oktober 2026.

Det analyserede datasæt er PerturbAIs in vivo-atlas over CRISPR Perturb-seq i hele hjernen på Hugging Face. Datasættets kort beskriver 7,7 millioner celler og 7.739.370 rækker på i alt 205 GB med profilering af enkeltkerner på tværs af 19.070 mRNA’er og 8.588 sgRNA’er, hvor virkningerne af næsten 2.000 sygdomsrelaterede gener måles, og celleannoteringerne stammer fra Allen Institute Whole Mouse Brain Taxonomy. Kortet angiver et bioRxiv-manuskript fra marts 2026, “Funktionel kortlægning på genomskala af hele pattedyrets hjerne med in vivo Perturb-seq”, som atlasets bagvedliggende publikation.

OpenAI oplyste, at forskere kan bruge atlaset til at sammenligne beslægtede gener, undersøge uventede reaktioner og finde lovende spor, der kan følges op på, og at resultaterne hjælper med at prioritere de yderligere forsøg, der er nødvendige for at afprøve de foreslåede biologiske mekanismer.