Naheed Kurji, Co-Fondator, Președinte și CEO al Cyclica – Seria de Interviuri

Naheed Kurji este Președintele și CEO-ul Cyclica, o companie biofarmaceutică cu sediul în Toronto, care utilizează inteligența artificială și biofizica computațională pentru a redefini procesul de descoperire a medicamentelor. Cyclica oferă industriei farmaceutice o platformă integrată, holistică și completă care îmbunătățește modul în care oamenii de știință proiectează, selectează și personalizează medicamente pentru pacienți și a fost recent desemnată de către Deep Knowledge Analytics una dintre cele mai bune 20 de companii de inteligență artificială în domeniul farmaceutic la nivel global.

Cyclica utilizează inteligența artificială și biofizica computațională pentru a redefini procesul de descoperire a medicamentelor. Puteți discuta despre modul în care inteligența artificială este utilizată în acest proces?

Tehnologia a jucat un rol critic în descoperirea medicamentelor încă din anii ’80. Cu toate acestea, procesul de descoperire și dezvoltare a medicamentelor este încă foarte ineficient, consumator de timp și scump, costând peste 2 miliarde de dolari pe o perioadă de 12 ani. Ineficiența slabă duce adesea la rate ridicate de abandon și la eșecul de a atinge obiectivele de siguranță și eficacitate ale medicamentelor. Cercetătorii sunt conștienți de acest lucru și caută activ instrumente pentru a înțelege în mod holistic calitățile care definesc cele mai bune medicamente, pentru a dezvolta medicamente mai sigure și mai eficiente.

Progresele recente în domeniul calculului în cloud, inteligența artificială și biofizică au creat o oportunitate de a obține o înțelegere profundă a datelor biochimice, biologice, de sănătate și de pacienți disponibile, pentru a înțelege mai bine bolile. Aceste progrese au permis, de asemenea, chimistilor medicinali să îmbunătățească proiectarea noilor terapii și să utilizeze inteligența artificială pentru a obține o mai mare precizie predictivă în procesul de dezvoltare a medicamentelor. La Cyclica, am dezvoltat motoare de învățare profundă proprii, MatchMaker și POEM, pentru a sprijini procesul de proiectare a medicamentelor. MatchMaker prezice cum interacționează compușii chimici și medicamentele cu multiple proteine, cunoscute sub numele de polifarmacologie. Am constatat că combinația unei abordări bazate pe cunoașterea și structura-bazată a datelor a oferit cea mai mare precizie și performanță predictivă. POEM (Pareto-Optimal Embedded Modeling) este o abordare de învățare supervizată fără parametri pentru construirea modelelor de predicție a proprietăților medicamentelor și abordează mai multe limitări ale altor abordări de învățare automată, rezultând într-o suprapunere mai mică și o interpretare mai mare.

La Cyclica, utilizăm inteligența artificială pentru a oferi oamenilor de știință o platformă robustă și validată pentru a accelera procesul de luare a deciziilor și generare a ipotezelor, pentru a crește eficiența generală a procesului de descoperire a medicamentelor și pentru a reduce numărul de eșecuri în aval.

Cyclica a proiectat platforma Ligand Design și Ligand Express, ce este aceasta exact?

Suntem prima companie care abordează polifarmacologia computațională (o apreciere a faptului că medicamentele interacționează cu multiple ținte) cu o platformă integrată de descoperire a medicamentelor care interoghează interacțiunile moleculare la nivelul proteomului. Platforma noastră este alcătuită din două piese cheie, Ligand Express, platforma noastră de profilare și deconvoluție a țintei, și Ligand Design, tehnologia noastră de proiectare a medicamentelor în silico single și multi-țintă. Ligand Express și Ligand Design sunt alimentate de două motoare de învățare și învățare profundă interne, validate și brevetate: MatchMaker și POEM. Înrădăcinată profund în biofizica proteinelor, MatchMaker este un motor de interacțiune a medicamentelor și țintelor care generalizează atât țintele bogate în date, cât și cele sărace în date. POEM, o tehnologie de învățare implementată pentru predicția proprietăților ADME, este o abordare nouă, fără parametri, pentru construirea modelelor.

În ansamblu, Ligand Design și Ligand Express oferă o platformă puternică de descoperire a medicamentelor, augmentată de inteligență artificială, pentru proiectarea moleculelor avansate, chimic noi, care prioritizează simultan compușii pe baza profilului lor polifarmacologic, minimizând în mod eficient efectele nedorite off-target. Platforma noastră diferențiată deschide noi oportunități pentru descoperirea medicamentelor, inclusiv proiectarea multi-țintă și multi-obiectivă a medicamentelor, optimizarea conducătorului, predicția proprietăților ADME, deconvoluția țintei și reutilizarea medicamentelor. Condusă de o echipă diversă și extrem de talentată, cu o expertiză profundă în învățarea automată, biofizică computațională/biochimie/biologie, biochimie și chimie medicinală, continuăm să inovăm prin pipeline-ul nostru robust de cercetare și dezvoltare.

Cât de importantă este descentralizarea descoperirii medicamentelor pentru modelul de afaceri al Cyclica?

Viziunea noastră este de a descentraliza descoperirea medicamentelor mai bune prin combinarea rădăcinilor noastre adânci în inteligența artificială și biofizica proteinelor cu un model de afaceri inovator. Și la nucleul eticii Cyclica se află dorința fermă de a ajuta pacienții prin promovarea descoperirii și dezvoltării medicamentelor mai bune, prin abordarea holistică și personalizată.

În acest sens, credem că viitorul descoperirii medicamentelor se află în mâinile instituțiilor de cercetare inovatoare și ale companiilor biotehnologice emergente (am scris despre acest lucru în Forbes aici). În sprijinul filozofiei noastre, în 2019, IQIVIA a raportat că companiile biotehnologice emergente reprezintă peste 70% din pipeline-ul total de cercetare și dezvoltare (față de 50% în 2003) și că aceste companii au brevetat peste două treimi din noile medicamente în 2018 (față de 50% în 2010). În timp ce companiile biotehnologice emergente vor conduce inovația în descoperirea medicamentelor, marile companii farmaceutice vor continua să investească în avansarea testelor clinice și a penetrării pieței prin canalele lor de vânzări.

Cu finanțarea noastră Seria B, vom accelera planurile comerciale pentru a avansa un pipeline în creștere de active preclinice și clinice prin un model de parteneriat descentralizat inovator. Obiectivul nostru este de a crea și deține sute de programe de descoperire a medicamentelor în multiple domenii terapeutice. Aceste programe sunt create prin spin-off-uri și parteneriate (JV) cu instituții de cercetare de top, facilitat în mare parte prin Programul de Parteneriat Academic Cyclica (CAPP).

Impulsionați de un portofoliu în creștere rapidă de peste 30 de programe active și avansate de descoperire a medicamentelor, vom continua să stimulăm inovația prin combinarea creației de întreprinderi și a parteneriatelor cu companiile biotehnologice emergente și în stadiu incipient. Parteneriatele recente includ EntheogeniX Biosciences, NineteenGale Therapeutics, Rosetta Therapeutics, Acceleratorul de Medicamente pentru Boli Rare și două parteneriate secrete care cuprind peste 50 de programe în multiple domenii terapeutice. Prin executarea modelului nostru de afaceri descentralizat, creând noi companii prin spin-off-uri și parteneriate și ajutându-le să se dezvolte, suntem, în efect, creatorii pipeline-ului biotehnologic al viitorului.

De ce este atât de important faptul că multe dintre tehnologiile dvs. sunt bazate pe cloud?

Accesul la cloud ne permite să scalăm computațional fluxurile de lucru pe care le efectuăm, precum și să beneficiem de infrastructura de securitate reglementată. De asemenea, ca o companie în stadiu incipient, capacitatea de a începe să funcționăm cu cloud-ul fără a investi în propriul nostru hardware a fost critică pentru viabilitatea noastră financiară în zilele noastre de început. În viitor, deși mult din munca noastră de cercetare și dezvoltare se desfășoară în cloud, în ultimii doi ani am devenit mai puțin dependenți de cloud, cu capacitatea de a rula proiecte pe mașini individuale. De asemenea, ne propunem să susținem instalări de cloud private, deoarece este ceva pe care credem că partenerii noștri ar putea dori. Progresele tehnologice au făcut posibil să facem pe o laptop personal ceea ce necesita odinioară multe mașini în cloud, dar prin continuarea utilizării cloud-ului, putem extinde în mod semnificativ domeniul problemelor pe care le rezolvăm.

Cyclica ia adesea poziții de acționariat în companiile cu care parteneriază. Puteți discuta despre raționamentul comercial din spatele acestei decizii?

Companiile biotehnologice mai mici și grupurile academice sunt, în general, ignorate de piață în ceea ce privește oportunitățile de parteneriat. Deși acestea nu au resursele, infrastructura sau facilitățile comparabile cu cele ale companiilor farmaceutice mature, companiile biotehnologice mici sunt din ce în ce mai mult în lumina reflectoarelor, cu o combinație de expertiză profundă în indicații specifice și beneficiile unei organizații agile, favorabile inovației rapide.

Acest lucru ne-a determinat să ne gândim la modul în care putem interacționa cu aceste companii mai mici cu o strategie inovatoare. Partenerim cu oameni de știință din organizații de cercetare care sunt interesați să înființeze o companie sau companii biotehnologice în stadiu incipient și le facilităm platforma noastră de descoperire a medicamentelor, augmentată de inteligență artificială, prin contribuții în natură. În schimb, luăm acțiuni în aceste companii și/sau deținem o cotă-parte din proprietatea compușilor și activelor create și urmărite. Prin stimularea unei valuri de inovație prin combinarea creației de întreprinderi și a parteneriatelor, putem capta o valoare mai mare și dezvolta relații pe termen lung cu partenerii noștri pentru a aborda o gamă de nevoi medicale neîndeplinite și a îmbunătăți viețile pacienților.

EntheogeniX Biosciences este un parteneriat comun între Cyclica și ATAI Life Science. Ce este exact EntheogeniX Biosciences?

Există o oportunitate unică de inovare în peisajul neuropsihiatric pentru a servi mai bine pacienții care suferă de afecțiuni mentale complexe. Medicamentele și terapiile actuale care se bazează pe intervenții medicamentoase cu o singură țintă adesea nu reușesc, necesitând ca pacienții să ia multiple medicamente care pot prezenta potențiale probleme de siguranță, precum și o reducere a aderenței la tratament. Am parteneriat cu ATAI Life Science pentru a utiliza experiența lor profundă în sănătatea mintală și psihedelice, în timp ce le facilităm platforma noastră de descoperire a medicamentelor, augmentată de inteligență artificială, pentru a crea nu numai noi medicamente, ci și cele potrivite pentru a aborda afecțiunile mintale. EntheogeniX Biosciences este unul dintre parteneriatele noastre și este o mărturie a credinței noastre în schimbarea paradigmei în care sunt tratate tulburările mintale, prin aducerea platformei noastre computaționale robuste și validate științific în mâinile experților și oamenilor de știință de clasă mondială.

Există altceva pe care ați dori să îl împărtășiți despre Cyclica?

În timp ce suntem foarte încântați să anunțăm finanțarea noastră Seria B, suntem la fel de entuziaști să anunțăm lansarea Programului de Parteneriat Academic Cyclica (CAPP) și noi parteneriate în următoarele luni.

Mulțumim pentru interviu. Aștept cu interes să urmăresc progresul viitor al Cyclica.