interviuri
Naheed Kurji, co-fondator, președinte și CEO al Cyclica – Seria de interviuri
Naheed Kurji este președintele și CEO-ul Cyclica, o companie de biotehnologie cu sediul în Toronto, care folosește inteligența artificială și biofizica computațională pentru a remodela procesul de descoperire a medicamentelor. Cyclica oferă industriei farmaceutice o platformă de activare integrată, holistică și end-to-end, care îmbunătățește modul în care oamenii de știință proiectează, evaluează și personalizează medicamentele pentru pacienți și a fost numit recent de Deep Knowledge Analytics drept unul dintre primele 20 de inteligență artificială din Companii farmaceutice la nivel global
Cyclica folosește inteligența artificială și biofizica computațională pentru a remodela procesul de descoperire a medicamentelor. Puteți discuta în ce mod este utilizat AI în acest proces?
Tehnologia a jucat un rol esențial în descoperirea medicamentelor începând cu anii '80. Cu toate acestea, procesul de descoperire și dezvoltare a medicamentelor este încă foarte ineficient, consumator de timp și costisitor, costând peste 2 miliarde de dolari în 12 ani. Eficiența slabă are ca rezultat adesea rate ridicate de uzură și eșecul de a îndeplini obiectivele de referință ale siguranței și eficacității medicamentelor. Cercetătorii sunt conștienți de acest lucru și caută în mod activ instrumente pentru a înțelege holistic calitățile care definesc cele mai bune medicamente pentru a dezvolta medicamente mai sigure și mai eficiente.
Progresele recente în cloud computing, AI și biofizică au creat o oportunitate de a obține o perspectivă profundă din cantitățile mari de date biochimice, biologice, de asistență medicală și de pacienți care sunt acum disponibile pentru a înțelege mai bine boala. Aceste progrese au permis, de asemenea, chimiștilor medicinali să îmbunătățească proiectarea de terapii noi și să folosească AI pentru a genera perspective predictive mai devreme în procesul de dezvoltare a medicamentelor. La Cyclica am dezvoltat motoare proprietare de învățare profundă, MatchMaker și POEM pentru a sprijini procesul de proiectare a medicamentelor. MatchMaker prezice modul în care compușii chimici și medicamentele interacționează cu mai multe proteine, cunoscute sub numele de polifarmacologie. Am descoperit că combinația atât a unei abordări bazate pe cunoștințe, cât și a unei abordări bazate pe structură a dat cea mai mare acuratețe predictivă și performanță. POEM (Modelare Pareto-Optimal Embedded), este o abordare de învățare supravegheată fără parametri pentru construirea de modele de predicție a proprietăților medicamentului și abordează câteva limitări ale altor abordări ML, rezultând o supraadaptare mai mică și o interpretabilitate crescută.
La Cyclica, folosim AI pentru a oferi oamenilor de știință o platformă robustă și validată pentru a accelera luarea deciziilor și generarea de ipoteze pentru a crește eficiența generală a procesului de descoperire a medicamentelor și pentru a reduce numărul de eșecuri în aval.
Cyclica a proiectat platforma Ligand Design și Ligand Express, ce este aceasta mai exact?
Suntem prima companie care abordează polifarmacologia computațională (o apreciere a faptului că medicamentele interacționează cu mai multe ținte) cu o platformă integrată de descoperire a medicamentelor care interoghează interacțiunile moleculare la scară la nivel de proteom. Platforma noastră este compusă din două piese cheie, Ligand Express, platforma noastră de profilare și deconvoluție țintă de prima generație și Ligand Design, tehnologia noastră de proiectare a medicamentelor in silico unică și multi-țintită de următoarea generație. Ligand Express și Ligand Design sunt alimentate de două motoare de învățare automată și de deep learning construite intern, validate și brevetate: MatchMaker și POEM. Înrădăcinat profund în biofizica proteinelor, MatchMaker este un motor de interacțiune medicament-țintă care se generalizează atât pentru ținte bogate în date, cât și pentru ținte sărace (consultați notele de validare aici și aici). POEM, o tehnologie de învățare automată implementată pentru predicția proprietăților de absorbție, distribuție, metabolism și excreție (ADME), este o abordare nouă, fără parametri, a construirii modelelor.
Toate împreună, Ligand Design și Ligand Express oferă o platformă puternică de descoperire a medicamentelor, îmbunătățită cu IA, de la capăt la capăt, pentru proiectarea de molecule avansate, noi din punct de vedere chimic, asemănătoare plumbului, care prioritizează simultan compușii pe baza profilului lor polifarmacologic, minimizând în mod eficient efectele nedorite nedorite. . Platforma noastră diferențiată deschide noi oportunități pentru descoperirea medicamentelor, inclusiv proiectarea medicamentelor multi-țintite și multi-obiective, optimizarea clienților potențiali, predicția proprietății ADMET, deconvoluția țintei și reutilizarea medicamentelor. Conduși de o echipă diversă și foarte talentată, cu o experiență profundă în învățarea automată, biofizică/chimie/biologie computațională, biochimie și chimie medicinală, continuăm să inovăm prin conducta noastră robustă de cercetare și dezvoltare.
Cât de importantă este descentralizarea descoperirii medicinei către modelul de afaceri Cyclica?
Viziunea noastră este să descentralizăm descoperirea unor medicamente mai bune, combinând rădăcinile noastre adânci în inteligența artificială (IA) și biofizica proteinelor cu un model de afaceri inovator. Și în centrul etosului lui Cyclica se află dorința constantă de a ajuta pacienții prin promovarea descoperirii și dezvoltării unor medicamente mai bune, adoptând o abordare holistică, dar personalizată.
În acest scop, credem că viitorul descoperirii de medicamente este în mâinile instituțiilor inovatoare de cercetare și al companiilor emergente de biotehnologie (am scris despre acest lucru în Forbes aici). Sprijinind filosofia noastră, în 2019 IQIVIA a raportat că companiile biofarmace emergente reprezintă peste 70% din totalul conductei de cercetare și dezvoltare (de la 50% în 2003) și că aceste companii au brevetat peste 2/3 din medicamentele noi în 2018 (de la 50% în 2010). În timp ce companiile biotehnologice emergente vor conduce inovarea în descoperirea medicamentelor, marile farmaceutice vor continua să investească în avansarea studiilor clinice în stadiu avansat și în penetrarea pieței prin canalele lor de vânzare.
Cu finanțarea noastră din seria B, vom accelera planurile comerciale pentru a avansa o conductă în creștere de active preclinice și clinice printr-un model inovator de parteneriat descentralizat. Scopul nostru este de a crea și de a deține sute de programe de descoperire a medicamentelor în mai multe domenii terapeutice. Aceste programe sunt create prin spin-out și joint ventures (JV) cu instituții de cercetare de top, facilitate în mare parte prin Programul de parteneriat academic Cyclica („CAPP”).
Impulsați de un portofoliu în creștere rapidă de peste 30 de programe active și avansate de descoperire a medicamentelor, vom continua să stârnim inovația printr-o combinație de creare de riscuri și parteneriate cu companii biotehnologice aflate în stadiu incipient și emergente. Parteneriatele recente includ EntheogeniX Biosciences, NineteenGale Therapeutics, Rosetta Therapeutics, Rare Diseases Medicine Accelerator și două JV-uri furtive care cuprind peste 50 de programe în mai multe domenii terapeutice. Implementând modelul nostru de afaceri descentralizat, creând noi companii prin spin-out și joint ventures și ajutându-le să se extindă, creăm de fapt conducta biotehnologică a viitorului.
Multe dintre tehnologiile tale sunt bazate pe cloud, de ce este asta atât de important?
Accesul la cloud ne permite să scalam computațional fluxurile de lucru pe care le desfășurăm, precum și să beneficiem de infrastructura de securitate reglementată. De asemenea, în calitate de companie în stadiu incipient, capacitatea de a începe și funcționa cu cloud-ul fără cheltuielile generale de investiții în propriul nostru hardware a fost critică pentru viabilitatea financiară în primele noastre zile. Privind înainte, deși o mare parte din activitatea noastră de cercetare și dezvoltare se desfășoară pe cloud, în ultimii doi ani am devenit mai puțin dependenți de cloud, având capacitatea de a rula proiecte pe mașini individuale. De asemenea, ne propunem să sprijinim instalațiile cloud private, deoarece este ceva ce credem că partenerii noștri și-ar putea dori. Progresele tehnologice au făcut posibilă realizarea pe un laptop personal a ceea ce obișnuia să găsească multe mașini în cloud, dar continuând să utilizăm cloud-ul, putem extinde foarte mult domeniul de aplicare al problemelor pe care le rezolvăm.
Cyclica ocupă adesea poziții de capitaluri proprii în companiile cu care sunt parteneri. Puteți discuta raționamentul de afaceri din spatele acestui lucru?
Companiile de biotehnologie mai mici și grupurile academice sunt în general trecute cu vederea de piață în ceea ce privește oportunitățile de parteneriat. Deși s-ar putea să nu aibă resursele, infrastructura sau facilitățile în comparație cu omologii maturi din industria farmaceutică, micile biotehnologii intră din ce în ce mai mult în centrul atenției cu o combinație de expertiză profundă în materie în indicații specifice și beneficiile unei organizații slabe care să conducă la inovație rapidă.
Acest lucru ne-a determinat să ne gândim cum ne putem angaja cu aceste companii mai mici cu o strategie de avangardă. Colaborăm cu oameni de știință din organizații de cercetare care sunt interesați să dezvolte o companie sau companii de biotehnologie în stadiu incipient și le dăm posibilitatea să utilizăm platforma noastră de descoperire a medicamentelor îmbunătățită cu IA prin contribuții în natură. În schimb, luați acțiuni în companii și/sau participați la proprietatea compușilor și activelor care sunt create și urmărite. Prin declanșarea unui val de inovație printr-o combinație de creare de întreprinderi și parteneriate, putem capta o valoare mai mare și putem dezvolta relații pe termen lung cu partenerii noștri pentru a aborda un spectru de nevoi medicale nesatisfăcute pentru a îmbunătăți viața pacienților.
Entheogenix Biosciences este un joint venture între Cyclica și ATAI Life Science. Ce este exact Entheogenix Biosciences?
Există o oportunitate unică de inovare în peisajul neuropsihiatric pentru a servi mai bine pacienții care suferă de afecțiuni mentale complexe. Medicamentele și terapiile actuale care se bazează pe intervenții medicamentoase cu un singur țintit sunt adesea insuficiente, necesitând pacienților să ia mai multe medicamente care pot prezenta probleme potențiale de siguranță și pot reduce aderența la medicamente. Am colaborat cu ATAI Life Science pentru a-și valorifica experiența profundă în sănătatea mintală și psihedelice, dându-le în același timp putere cu platforma noastră de descoperire a medicamentelor îmbunătățită cu inteligența artificială pentru a crea nu numai medicamente noi, ci și cele potrivite pentru a aborda afecțiunile mentale. Entheogenix Biosciences este una dintre numeroasele asociații pe care le-am format și este o dovadă a credinței noastre în schimbarea paradigmei în care tulburările de sănătate mintală sunt tratate prin aducerea platformei noastre de calcul agoniste, robuste și validate științific în mâinile experților în domeniu. și oameni de știință de talie mondială.
Mai există ceva pe care ați dori să împărtășiți despre Cyclica?
Deși suntem foarte încântați să împărtășim anunțul rundei noastre de finanțare din seria B. Suntem la fel de nerăbdători să împărtășim lansarea Programului de parteneriat academic Cyclica (CAPP) și noi parteneriate în următoarele câteva luni.
Multumesc pentru interviu. Aștept cu nerăbdare să urmăresc progresul viitor al Cyclica.
