ראיונות
נהיד קורג'י, מייסד שותף, נשיא ומנכ"ל Cyclica - סדרת ראיונות
נהיד קורג'י הוא הנשיא והמנכ"ל של מחזור, חברת ביוטכנולוגיה מטורונטו הממנפת בינה מלאכותית וביופיזיקה חישובית כדי לעצב מחדש את תהליך גילוי התרופות. Cyclica מספקת לתעשיית התרופות פלטפורמה משולבת, הוליסטית ומאפשרת מקצה לקצה, המשפרת את האופן שבו מדענים מעצבים, מסננים ומתאימים תרופות למטופלים, ולאחרונה הוכתרה על ידי Deep Knowledge Analytics כאחת מ-20 הבינה המלאכותית המובילה בתחום. חברות פארמה ברחבי העולם
Cyclica ממנפת בינה מלאכותית וביופיזיקה חישובית כדי לעצב מחדש את תהליך גילוי התרופות. האם אתה יכול לדון באיזה אופן נעשה שימוש ב-AI בתהליך זה?
הטכנולוגיה מילאה תפקיד קריטי בגילוי תרופות עוד משנות ה-80. עם זאת, תהליך גילוי ופיתוח התרופות עדיין מאוד לא יעיל, גוזל זמן ויקר, ועולה יותר מ-2 מיליארד דולר במשך 12 שנים. היעילות הירודה גורמת לרוב לשיעורי שחיקה גבוהים ואי עמידה באבני דרך של בטיחות ויעילות של תרופות. החוקרים מודעים לכך והם מחפשים כלים באופן פעיל להבין בצורה הוליסטית את התכונות שמגדירות את התרופות הטובות ביותר על מנת לפתח תרופות בטוחות ויעילות יותר
ההתקדמות האחרונה במחשוב ענן, בינה מלאכותית וביופיזיקה יצרה הזדמנות לקבל תובנות עמוקות מהכמויות העצומות של נתונים ביוכימיים, ביולוגיים, שירותי בריאות וחולים הזמינים כעת על מנת להבין טוב יותר את המחלה. התקדמות אלה אפשרו גם לכימאים רפואיים לשפר את התכנון של טיפולים חדשים ולהשתמש בבינה מלאכותית כדי להניע תובנות חיזוי גדול יותר בשלב מוקדם יותר בתהליך פיתוח התרופה. ב-Cyclica פיתחנו מנועי למידה עמוקה קנייניים, MatchMaker ו-POEM כדי לתמוך בתהליך עיצוב התרופה. MatchMaker חוזה כיצד תרכובות כימיות ותרופות מקיימות אינטראקציה עם חלבונים מרובים, המכונה פוליפרמקולוגיה. מצאנו שהשילוב בין גישה מבוססת ידע וגישה מבוססת מבנה הניב את הדיוק והביצועים החזויים הגדולים ביותר. POEM (Pareto-Optimal Embedded Modeling), היא גישת למידה מפוקחת נטולת פרמטרים לבניית מודלים של חיזוי מאפיינים של תרופות ומתייחסת למספר מגבלות של גישות ML אחרות, וכתוצאה מכך פחות התאמה יתר ויכולת פרשנות מוגברת.
ב-Cyclica, אנו משתמשים בבינה מלאכותית כדי לספק למדענים פלטפורמה איתנה ומאומתת להאצת קבלת החלטות ויצירת השערות על מנת להגביר את היעילות הכוללת של תהליך גילוי התרופות ולהפחית את מספר הכשלים במורד הזרם.
Cyclica עיצבה את פלטפורמת Ligand Design ו- Ligand Express, מה זה בדיוק?
אנחנו החברה הראשונה שניגשה לפוליפרמקולוגיה חישובית (הערכה שתרופות מקיימות אינטראקציה עם מטרות מרובות) עם פלטפורמת גילוי תרופות משולבת החוקרת אינטראקציות מולקולריות בקנה מידה רחב של פרוטאומים. הפלטפורמה שלנו מורכבת משני חלקים מרכזיים, Ligand Express, הדור הראשון שלנו ליצירת פרופילים ופירוק יעדים מחוץ למטרה, ו-Ligand Design, הדור הבא שלנו בטכנולוגיית עיצוב תרופות סיליקו יחיד ורב-מיקוד. Ligand Express ו- Ligand Design מופעלים על ידי שני מנועי למידת מכונה ולמידה עמוקה שנבנו באופן פנימי, מאומתים ומוגנים בפטנט: MatchMaker ו-POEM. מושרש עמוק בביופיזיקה של חלבון, MatchMaker הוא מנוע אינטראקציה בין תרופות למטרות למידה עמוקה שמכליל על פני יעדים עשירים בנתונים ועניים בנתונים (ראה הערות אימות כאן וכאן). POEM, טכנולוגיית למידת מכונה המיושמת לחיזוי מאפייני ספיגה, הפצה, מטבוליזם והפרשה (ADME), היא גישה חדשה ונטולת פרמטרים לבניית מודלים.
ביחד, Ligand Design ו-Ligand Express מציעות פלטפורמת גילוי תרופות מוגברת בינה מלאכותית מקצה לקצה לעיצוב מולקולות מתקדמות, חדשות מבחינה כימית דמויי עופרת, המעניקות בו-זמנית עדיפות לתרכובות על סמך הפרופיל הפולי-פרמקולוגי שלהן, וממזערת למעשה השפעות לא רצויות מחוץ למטרה. . הפלטפורמה המובחנת שלנו פותחת הזדמנויות חדשות לגילוי תרופות, כולל עיצוב תרופות רב-מטרות ורב-אובייקטיביות, אופטימיזציה של לידים, חיזוי נכסי ADMET, דה-קונבולוציה של יעדים ושימוש מחדש בתרופות. מונעים על ידי צוות מגוון ומוכשר ביותר עם מומחיות עמוקה בלמידת מכונה, ביו-פיזיקה/כימיה/ביולוגיה חישובית, ביוכימיה וכימיה רפואית, אנו ממשיכים לחדש באמצעות צינור המו"פ החזק שלנו.
עד כמה חשובה ביזור גילוי הרפואה למודל העסקי של Cyclica?
החזון שלנו הוא לבזר את הגילוי של תרופות טובות יותר על ידי שילוב השורשים העמוקים שלנו בבינה מלאכותית (AI) וביופיזיקה של חלבון עם מודל עסקי חדשני. ובבסיס האתוס של Cyclica הוא הרצון האיתן לעזור למטופלים על ידי קידום הגילוי והפיתוח של תרופות טובות יותר על ידי נקיטת גישה הוליסטית אך מותאמת אישית.
לשם כך, אנו מאמינים שעתיד גילוי התרופות נמצא בידי מוסדות מחקר חדשניים וחברות ביוטכנולוגיה מתפתחות (כתבנו על כך בפורבס כאן). תמיכה בפילוסופיה שלנו, בשנת 2019 IQIVIA דיווחה שחברות ביו-פארמה מתפתחות מהוות יותר מ-70% מכלל צינור המחקר והפיתוח (עלייה מ-50% ב-2003), וכי חברות אלו רשמו פטנט על למעלה מ-2/3 מהתרופות החדשות ב-2018 (עלייה מ-50% ב -2010). בעוד שחברות ביוטכנולוגיה מתפתחות יובילו חדשנות בגילוי תרופות, הפארמה הגדולה תמשיך להשקיע בקידום ניסויים קליניים בשלב מאוחר ובחדירה לשוק דרך ערוצי המכירה שלהן.
עם המימון מסדרה B שלנו, נאיץ תוכניות מסחריות לקידום צינור הולך וגדל של נכסים פרה-קליניים וקליניים באמצעות מודל שותפות מבוזר חדשני. המטרה שלנו היא ליצור ולהחזיק מאות תוכניות לגילוי תרופות על פני מספר תחומים טיפוליים. תוכניות אלה נוצרות באמצעות ספין-אאוט ומיזמים משותפים (JVs) עם מוסדות מחקר מהשורה הראשונה, המוצעים בעיקר באמצעות תוכנית השותפות האקדמית של Cyclica ("CAPP").
מונעים על ידי פורטפוליו גדל במהירות של יותר מ-30 תוכניות גילוי תרופות פעילות ומתקדמות, נמשיך לעורר חדשנות באמצעות שילוב של יצירת מיזמים ושותפויות עם חברות ביוטכנולוגיה בשלבים מוקדמים ומתפתחים. שותפויות אחרונות כוללות את EntheogeniX Biosciences, NineteenGale Therapeutics, Rosetta Therapeutics, ה-Rare Diseases Medicine Accelerator ושני JVs חמקניים המקיפים למעלה מ-50 תוכניות על פני מספר תחומים טיפוליים. על ידי ביצוע על המודל העסקי המבוזר שלנו, יצירת חברות חדשות באמצעות ספין-אאוט ומיזמים משותפים ועזרה להן בקנה מידה, אנו למעשה יוצרים את צינור הביוטק של העתיד.
רבות מהטכנולוגיות שלך מבוססות ענן, למה זה כל כך חשוב?
גישה לענן מאפשרת לנו להרחיב את זרימות העבודה שאנו מבצעים באופן חישובי, כמו גם להפיק תועלת מתשתית אבטחה מוסדרת. כמו כן, כחברה בשלב מוקדם, היכולת להתחיל לעבוד עם הענן ללא תקורה של השקעה בחומרה שלנו הייתה קריטית לכדאיות הפיננסית בימינו הראשונים. במבט קדימה, בעוד שרוב עבודת המחקר והפיתוח שלנו נעשית בענן, במהלך השנים האחרונות הפכנו להיות פחות תלויים בענן עם היכולת להפעיל פרויקטים על מכונות בודדות. אנו גם שואפים לתמוך בהתקנות ענן פרטיות מכיוון שזה משהו שאנו מרגישים שהשותפים שלנו עשויים לחפוץ בו. ההתקדמות הטכנולוגית אפשרה לעשות במחשב נייד אישי את מה שהיה לוקח הרבה מכונות על הענן, אך על ידי המשך ניצול הענן אנו מסוגלים להרחיב מאוד את היקף הבעיות שאנו פותרים.
Cyclica לוקחת לעתים קרובות עמדות מניות בחברות שהם שותפות איתן. האם אתה יכול לדון בהיגיון העסקי מאחורי זה?
חברות ביוטכנולוגיה קטנות יותר וקבוצות אקדמיות מתעלמות בדרך כלל מהשוק מבחינת הזדמנויות שותפות. למרות שאולי אין להם את המשאבים, התשתית או המתקנים בהשוואה לעמיתים בוגרים בתחום הפארמה, חברות ביוטק קטנות נכנסות יותר ויותר לאור הזרקורים עם שילוב של מומחיות עמוקה בנושאים באינדיקציות ספציפיות והיתרונות של ארגון רזה התורם לחדשנות מהירה.
זה הוביל אותנו לחשוב כיצד נוכל לתקשר עם החברות הקטנות הללו באסטרטגיה אוונגרדית. אנו שותפים למדענים בארגוני מחקר המעוניינים להקים חברה או חברות ביוטכנולוגיה בשלבים מוקדמים, ומאפשרים להם עם פלטפורמת גילוי התרופות המוגדלת שלנו ב-AI באמצעות תרומות בעין. בתמורה, קח הון עצמי לחברות ו/או חלק בבעלות על המתחמים והנכסים שנוצרים ונרדפים. על ידי עורר גל של חדשנות באמצעות שילוב של יצירת מיזם ושותפויות, אנו יכולים לתפוס ערך רב יותר ולפתח קשרים ארוכי טווח עם השותפים שלנו כדי לתת מענה לקשת של צרכים רפואיים שלא נענו כדי לשפר את חייהם של החולים.
Entheogenix Biosciences הוא מיזם משותף בין Cyclica ו-ATAI Life Science. מה זה בעצם Entheogenix Biosciences?
ישנה הזדמנות ייחודית לחדשנות בנוף הנוירו-פסיכיאטרי לשרת טוב יותר מטופלים הסובלים ממחלות נפשיות מורכבות. תרופות וטיפולים נוכחיים המסתמכים על התערבויות תרופתיות ממוקדות יחיד נופלות לעתים קרובות, מה שמחייב את המטופלים לקחת מספר תרופות שעלולות להוות בעיות בטיחות פוטנציאליות, כמו גם להפחית את ההיצמדות לתרופות. שיתפנו פעולה עם ATAI Life Science כדי למנף את הניסיון העמוק שלהם בבריאות הנפש ובפסיכדליה, תוך העצמתם עם פלטפורמת גילוי התרופות המוגדלת שלנו ב-AI כדי ליצור לא רק תרופות חדשות, אלא גם את הנכונות להתמודדות עם מחלות נפשיות. Entheogenix Biosciences הוא אחד מהמיזמים המשותפים הרבים שיצרנו והוא עדות לאמונתנו בשינוי הפרדיגמה שבה מטופלות הפרעות בריאות הנפש על ידי הבאת הפלטפורמה החישובית האגוניסטית, החזקה והמאומתת מדעית למחלה שלנו לידי מומחים בנושא. ומדענים ברמה עולמית.
האם יש משהו נוסף שתרצה לחלוק על Cyclica?
אמנם אנו נרגשים מאוד לחלוק את ההכרזה על סבב הגיוס שלנו מסדרה B. אנחנו להוטים לא פחות לשתף את ההשקה של תוכנית השותפות האקדמית של Cyclica (CAPP) ושותפויות חדשות במהלך החודשים הקרובים.
תודה על הראיון. אני מצפה לעקוב אחר ההתקדמות העתידית של מחזור.
