Allan Hanbury, contextflow:n perustaja – Haastattelusarja

Allan Hanbury on Data Intelligence -professori TU Wienissä, Itävallassa, ja hän on myös Complexity Science Hubin jäsen, jossa hän johtaa tutkimusta ja innovaatioita, joiden tavoitteena on antaa merkitys rakenteettomalle datalle. Hän on myös Itävallan ICT-valonheitinprojektin, Data Market Austrian, aloittaja, joka luo data-palvelurakennetta Itävaltaan. Hän toimi tieteellisenä koordinaattorina EU:n rahoittamassa Khresmoi -hankkeessa, jossa kehitettiin monikielinen, monimuotoinen hakujärjestelmä biolääketieteellisten tietojen ja asiakirjojen hakemiseen ja analyysiin, ja hän on myös contextflowin perustaja, joka on Khresmoi-hankkeessa kehitetyn röntgenkuva-hakuteknologian kaupallistamiseen erikoistunut spin-off-yritys. Hän on myös koordinoinut EU:n rahoittamaa VISCERAL -hanketta, jossa arvioitiin algoritmien suorituskykyä suurissa datamäärissä, ja EU:n rahoittamaa KConnect -hanketta, jossa kehitettiin teknologiaa lääketieteellisten tekstin analysointiin.

Contextflow on spin-off Medical University of Viennasta ja Euroopan tutkimushankkeesta KHRESMOI. Voitko kertoa meille KHRESMOI-hankkeesta?

Tietysti! Khresmoi-hankkeen tavoitteena oli kehittää monikielinen, monimuotoinen hakujärjestelmä biolääketieteellisten tietojen ja asiakirjojen hakemiseen, johon tarvittiin tehokasta tietojen hakuprosessia, joustavia käyttöliittymiä ja linkkejä sekä rakenteettomaan että puolirakenteelliseen tekstiin. Halusimme tehdä tietojen hakuprosessin lääketieteellisille ammattilaisille luotettavaksi, nopeaksi, tarkaksi ja ymmärrettäväksi.

Mikä on nykyinen tietokanta, joka mahdollistaa contextflow:n syväoppimisalgoritmin?

Tietokantamme sisältää noin 8000 keuhkojen tietokonekerroskuvausta. Koska AI on melko joustava, siirrymme seuraavaksi aivokuvauksiin.

Oletko havainnut parannuksia siinä, miten AI suoriutuu, kun tietokanta on kasvanut?

Tähän kysymykseen vastataan usein, ja vastaus ei välttämättä ole tyydyttävä useille lukijoille. Jonkin verran, kyllä, laadun parantuminen kasvaa enemmän skannauksia, mutta tietyn kynnyksen jälkeen et voi saada paljon enemmän vain skannauksien määrän kasvamisesta. Se, mitä on tarpeeksi, riippuu monista tekijöistä (elin, modaliteetti, sairauden kuva, jne), ja on mahdotonta antaa tarkkaa lukua. Tärkeintä on tietojen laatu.

Onko contextflow suunniteltu kaikkiin tapauksiin, vai ainoastaan määrättyyn differentiaalidiagnoosiin vaikeissa tapauksissa?

Radiologit ovat todella hyviä työssään. Useimmissa tapauksissa löydökset ovat ilmeisiä, ja ulkoiset työkalut ovat tarpeettomia. Contextflow on erottautunut markkinoilla keskittymällä yleiseen hakemiseen automaattisen diagnoosin sijaan. Meillä on muutamia käyttötarkoituksia työkaluillamme, mutta pääasiallinen on auttaminen vaikeissa tapauksissa, joissa löydökset eivät ole välittömästi ilmeisiä. Tässä radiologit tarvitsevat konsultoida eri lähteitä, ja se prosessi kestää aikaa. Contextflow SEARCH, 3D-kuva-pohjainen hakukone, pyrkii vähentämään aikaa, jonka radiologit tarvitsevat tietojen hakemiseen kuvien tulkinnassa, sallimalla heidän hakea tietoja itse kuvan kautta. Koska me myös tarjoamme viiteinformaatiota, joka on hyödyllistä differentiaalidiagnoosille, uusien radiologien koulutus on toinen lupaava käyttötarkoitus.

Voitko opastaa meitä prosessin läpi, miten radiologi käyttää contextflow-alustaa?

Contextflow SEARCH Lung CT on täysin integroitu radiologin työprosessiin (muuten he eivät sitä käyttäisi). Radiologi tekee työnsä normaalisti, ja kun he tarvitsevat lisätietoja tietylle potilaalle, he valitsevat kiinnostuksen kohteen kyseisestä skannauksesta ja napsauttavat contextflow-ikonia työasemallaan avatakseen järjestelmämme uudessa selainikkunassa. Sieltä he saavat viitekuvia tietokannastamme, joissa on samanlaisia sairauden kuvia kuin potilaalla, jonka he tällä hetkellä arvioivat, sekä tilastotietoja ja lääketieteellistä kirjallisuutta (esim. radiopedia). He voivat selata potilaan tietojamme järjestelmässämme normaalisti, valitsemalla lisää alueita hakemaan lisätietoja ja vertailemalla niitä viitekuviin. On myös lämpökartat, jotka antavat visualisaation sairauden jakautumisesta, mikä auttaa tulosten raportoinnissa. Yritimme laittaa kaiken, mitä radiologit tarvitsevat raportin kirjoittamiseen, yhteen paikkaan ja saataville sekunneissa.

Tämä oli alun perin suunniteltu keuhkojen tietokonekerroskuville, laajentuuko contextflow muihin skannauksien tyyppeihin?

Kyllä! Meillä on lista elintarvikkeista ja modaliteeteista, joita radiologit ovat pyytäneet meiltä, ja joita olemme innostuneita lisäämään. Lopullinen tavoitteemme on tarjota järjestelmä, joka kattaa koko ihmiskehon, riippumatta elimestä tai skannauksen tyypistä.

Contextflow on saanut kahden upean inkubointiohjelman, INiTS:n ja i2c TU Wienin, tuen. Kuinka hyödyllisiä nämä ohjelmat ovat olleet, ja mitä olet oppinut prosessista?

Me olemme kiitollisia näille inkubointiohjelmille. Molemmat yhdistivät meidät mentoreiden, konsulttien ja sijoittajien kanssa, jotka haastoivat liiketoimintamallimme ja lopulta selkiyttivät, kuka, miksi ja miten. He myös toimivat hyvin käytännöllisesti, tarjoamalla rahoitusta ja toimistotilaa, jotta voimme keskittyä työhön ja olla vähemmän huolissamme hallinnollisista aiheista. Emme olisi voineet tulla niin pitkälle ilman heidän tukeaan. Itävallan startup-ekosysteemi on vielä pieni, mutta siellä on ohjelmia, jotka auttavat innovatiivisia ideoita toteutumaan.

Olet myös Itävallan ICT-valonheitinprojektin, Data Market Austrian, aloittaja, jonka tavoitteena on luoda kestävä data-palvelurakennelma Itävaltaan. Voitko kertoa meille enemmän tästä hankkeesta ja roolistasi siinä?

Päivittäin tuotettavan datamäärän kasvu on eksponentiaalista, ja sen merkitys useille aloille on myös räjähdysmäistä… se on yksi maailman tärkeimmistä resursseista! Data Market Austrian Lighthouse -projektin tavoitteena on kehittää tai uudistaa menestyksekkäiden data-ajoitteisten liiketoimien vaatimukset, varmistaen matalat kustannukset, korkean laadun ja yhteensopivuuden. Koordinoitin hanketta ensimmäisen vuoden ajan 2016-2017. Tämä johti Data Intelligence Offensiven luomiseen, jossa olen hallituksen jäsen. DIO:n tehtävänä on vaihtaa tietoja ja osaamista jäsenten välillä datahallinnosta ja -turvallisuudesta.

Onko jotain muuta, mitä haluaisit jakaa lukijoillemme contextflow:sta?

Radiologien työprosessit eivät ole keskivertopotilaan mielessä, ja se on hyvä niin. Järjestelmän pitäisi toimia. Valitettavasti, kun sinusta tulee potilas, huomaat, ettei se aina ole tapahtumassa. Contextflow työskentelee prosessin muuttamiseksi sekä radiologeille että potilaille. Voit odottaa paljon jännittäviä kehityksiä meiltä tulevina vuosina, joten pysy kuulolla!

Käy contextflow -sivustolla, jotta voit lisätietoja.