Ναχέντ Κουρτζι, Συνιδρυτής, Πρόεδρος και Διευθύνων Σύμβουλος της Cyclica – Σειρά Συνεντεύξεων

Ο Ναχέντ Κουρτζι είναι ο Πρόεδρος και Διευθύνων Σύμβουλος της Cyclica, μια εταιρεία βιοτεχνολογίας με έδρα το Τορόντο, που αξιοποιεί την τεχνητή νοημοσύνη και τη υπολογιστική βιοφυσική για να αναμορφώσει τη διαδικασία ανακάλυψης φαρμάκων. Η Cyclica παρέχει στη φαρμακευτική βιομηχανία μια ολοκληρωμένη, ολιστική και ολοκληρωμένη πλατφόρμα που ενισχύει τον τρόπο με τον οποίο οι επιστήμονες σχεδιάζουν, ελέγχουν και προσωπικοποιούν φάρμακα για τους ασθενείς, και έχει πρόσφατα ονομαστεί από την Deep Knowledge Analytics ως μια από τις 20 κορυφαίες εταιρείες AI στη φαρμακευτική βιομηχανία παγκοσμίως.

Η Cyclica αξιοποιεί την τεχνητή νοημοσύνη και τη υπολογιστική βιοφυσική για να αναμορφώσει τη διαδικασία ανακάλυψης φαρμάκων. Μπορείτε να συζητήσετε τον τρόπο με τον οποίο η τεχνητή νοημοσύνη χρησιμοποιείται σε αυτή τη διαδικασία;

Η τεχνολογία έχει παίξει κρίσιμο ρόλο στην ανακάλυψη φαρμάκων από τη δεκαετία του ’80. Ωστόσο, η διαδικασία ανακάλυψης και ανάπτυξης φαρμάκων είναι ακόμη πολύ αναποτελεσματική, χρονοβόρα και ακριβή, κοστίζοντας περισσότερα από 2 δισεκατομμύρια δολάρια σε 12 χρόνια. Η κακή αποτελεσματικότητα συχνά οδηγεί σε υψηλά ποσοστά αποβολής και αποτυχίας να ικανοποιήσει τα ορόσημα ασφαλείας και αποτελεσματικότητας των φαρμάκων. Οι ερευνητές είναι ενήμεροι για αυτό και ενεργά αναζητούν εργαλεία για να κατανοήσουν ολιστικά τις ιδιότητες που ορίζουν τα καλύτερα φάρμακα, ώστε να αναπτύξουν ασφαλέστερα και πιο αποτελεσματικά φάρμακα.

Οι πρόσφατες προόδους στην υπολογιστική, την τεχνητή νοημοσύνη και τη βιοφυσική έχουν δημιουργήσει μια ευκαιρία να αποκτήσουν βαθιά κατανόηση από τα τεράστια δεδομένα που είναι τώρα διαθέσιμα, για να κατανοήσουν καλύτερα τις ασθένειες. Αυτές οι προόδους έχουν επίσης επιτρέψει στους φαρμακοποιούς να βελτιώσουν το σχεδιασμό νέων θεραπειών και να χρησιμοποιήσουν την τεχνητή νοημοσύνη για να οδηγήσουν μεγαλύτερη προβλεπτική κατανόηση νωρίτερα στη διαδικασία ανάπτυξης φαρμάκων. Στη Cyclica, έχουμε αναπτύξει ιδιόκτητους μηχανισμούς βαθιάς μάθησης, MatchMaker και POEM, για να υποστηρίξουμε τη διαδικασία σχεδιασμού φαρμάκων. Ο MatchMaker προβλέπει πώς οι χημικές ενώσεις και τα φάρμακα αλληλεπιδρούν με πολλαπλά προτεΐνη, γνωστή ως πολυφαρμακολογία. Βρήκαμε ότι η συνδυασμένη προσέγγιση γνώσεων και δομής οδήγησε στην μεγαλύτερη προβλεπτική ακρίβεια και απόδοση. Το POEM (Pareto-Optimal Embedded Modeling) είναι μια παραμετρική ελεύθερη επιτηρούμενη προσέγγιση μάθησης για την κατασκευή μοντέλων προβλέψεων ιδιοτήτων φαρμάκων και αντιμετωπίζει πολλές περιορισμοί άλλων προσεγγίσεων ML, οδηγώντας σε λιγότερη υπερπροσαρμογή και αυξημένη ερμηνευσιμότητα.

Στη Cyclica, χρησιμοποιούμε την τεχνητή νοημοσύνη για να παρέχουμε στους επιστήμονες μια robust και επικυρωμένη πλατφόρμα για να επιταχύνουν την λήψη αποφάσεων και τη γεννήτρια υποθέσεων, ώστε να αυξήσουν την συνολική αποτελεσματικότητα της διαδικασίας ανακάλυψης φαρμάκων και να μειώσουν τον αριθμό των αποτυχιών κατά τη διάρκεια της ανάπτυξης.

Η Cyclica έχει σχεδιάσει την πλατφόρμα Ligand Design και Ligand Express, τι είναι ακριβώς αυτό;

Είμαστε η πρώτη εταιρεία που προσεγγίζει την υπολογιστική πολυφαρμακολογία (μια εκτίμηση ότι τα φάρμακα αλληλεπιδρούν με πολλαπλά στόχους) με μια ολοκληρωμένη πλατφόρμα ανακάλυψης φαρμάκων που διερευνά τις μοριακές αλληλεπιδράσεις σε μια κλίμακα προτεϊνών. Η πλατφόρμα μας αποτελείται από δύο βασικά μέρη, το Ligand Express, την πρώτη γενιά μας πλατφόρμα προφίλ και αποσύνδεσης στόχων, και το Ligand Design, την επόμενη γενιά μας τεχνολογία σχεδιασμού φαρμάκων in silico. Το Ligand Express και το Ligand Design τροφοδοτούνται από δύο εσωτερικά κατασκευασμένα, επικυρωμένα και με δίπλωμα ευρεσιτεχνίας μηχανισμούς μάθησης και βαθιάς μάθησης: MatchMaker και POEM. Με βάση τη βιοφυσική των προτεϊνών, ο MatchMaker είναι ένας μηχανισμός αλληλεπίδρασης φαρμάκων-στόχων που γενικεύει και σε στόχους πλούσιους σε δεδομένα και σε στόχους φτωχούς σε δεδομένα. Το POEM, μια τεχνολογία μάθησης που εφαρμόζεται για την πρόβλεψη ιδιοτήτων ADME, είναι μια καινοτόμος, παραμετρική ελεύθερη προσέγγιση για την κατασκευή μοντέλων.

Όλα αυτά μαζί, το Ligand Design και το Ligand Express προσφέρουν μια ισχυρή πλατφόρμα ανακάλυψης φαρμάκων που ενισχύεται από την τεχνητή νοημοσύνη για το σχεδιασμό προηγμένων, χημικά καινοτόμων μορίων που προτεραιοποιούνται με βάση το προφίλ πολυφαρμακολογίας, μειώνοντας αποτελεσματικά τις ανεπιθύμητες εκτός στόχου επιδράσεις. Η διαφοροποιημένη πλατφόρμα μας ανοίγει νέες ευκαιρίες για την ανακάλυψη φαρμάκων, συμπεριλαμβανομένης της多-στόχου και της πολυ-στόχου σχεδίασης φαρμάκων, της βελτίωσης οδηγών, της πρόβλεψης ιδιοτήτων ADME, της αποσύνδεσης στόχων και της ανακατεύθυνσης φαρμάκων. Με μια διαφορετική και υψηλά ταλαντούχα ομάδα με βαθιά εμπειρία σε μηχανική μάθησης, υπολογιστική βιοφυσική/χημεία/βιολογία, βιοχημεία και φαρμακευτική χημεία, συνεχίζουμε να καινοτομούμε μέσω του robust pipeline μας.

Πόσο σημαντική είναι η αποκεντρωποίηση της ανακάλυψης φαρμάκων για το μοντέλο kinh doanh της Cyclica;

Η όρασή μας είναι να αποκεντρωτήσουμε την ανακάλυψη καλύτερων φαρμάκων συνδυάζοντας τις βαθιά ρίζες μας στην τεχνητή νοημοσύνη και τη βιοφυσική με ένα καινοτόμο μοντέλο kinh doanh. Και στο κέντρο της εθικής της Cyclica είναι η σταθερή επιθυμία να βοηθήσουμε τους ασθενείς προωθώντας την ανακάλυψη και την ανάπτυξη καλύτερων φαρμάκων με μια ολιστική και προσωπικοποιημένη προσέγγιση.

Για αυτό, πιστεύουμε ότι το μέλλον της ανακάλυψης φαρμάκων βρίσκεται στα χέρια των καινοτόμων ερευνητικών ιδρυμάτων και των αναδυόμενων εταιρειών βιοτεχνολογίας (για αυτό γράψαμε στο Forbes εδώ). Υποστηρίζοντας τη φιλοσοφία μας, το 2019 η IQIVIA ανέφερε ότι οι αναδυόμενες εταιρείες βιοφαρμακευτικής αντιπροσωπεύουν πάνω από το 70% του συνολικού pipeline έρευνας και ανάπτυξης (αύξηση από το 50% το 2003), και ότι αυτές οι εταιρείες κατέχουν πάνω από τα 2/3 των νέων φαρμάκων το 2018 (αύξηση από το 50% το 2010). Ενώ οι αναδυόμενες εταιρείες βιοτεχνολογίας θα οδηγήσουν την καινοτομία στην ανακάλυψη φαρμάκων, οι μεγάλες φαρμακευτικές εταιρείες θα συνεχίσουν να επενδύουν στην προώθηση των κλινικών δοκιμών και την διείσδυση στην αγορά μέσω των καναλιών πωλήσεων τους.

Με τη χρηματοδότηση της Σειράς B, θα επιταχύνουμε τα εμπορικά μας σχέδια για να προωθήσουμε μια αυξανόμενη πορεία προκλινικών και κλινικών περιουσιακών στοιχείων μέσω ενός καινοτόμου αποκεντρωμένου μοντέλου συνεργασίας. Ο στόχος μας είναι να δημιουργήσουμε και να κατέχουμε εκατοντάδες προγράμματα ανακάλυψης φαρμάκων σε πολλαπλά θεραπευτικά πεδία. Αυτά τα προγράμματα δημιουργούνται μέσω spin outs και συνεργασιών (JV) με κορυφαία ερευνητικά ιδρύματα, που διευκολύνονται σε μεγάλο βαθμό από το Πρόγραμμα Ακαδημαϊκής Συνεργασίας της Cyclica (CAPP).

Προωθούμενη από μια ταχέως αυξανόμενη πορεία περισσότερων από 30 ενεργών και προηγμένων προγραμμάτων ανακάλυψης φαρμάκων, θα συνεχίσουμε να καινοτομούμε μέσω μιας συνδυασμής δημιουργίας επιχειρήσεων και συνεργασιών με εταιρείες βιοτεχνολογίας σε πρώιμο στάδιο και αναδυόμενες. Πρόσφατες συνεργασίες περιλαμβάνουν τις EntheogeniX Biosciences, NineteenGale Therapeutics, Rosetta Therapeutics, τον Επιταχυντή Φαρμάκων Σπάνιων Ασθενειών και δύο κρυφές JV που περιλαμβάνουν πάνω από 50 προγράμματα σε πολλαπλά θεραπευτικά πεδία. Εκτελώντας το αποκεντρωμένο μοντέλο kinh doanh μας, δημιουργώντας νέες εταιρείες μέσω spin outs και συνεργασιών και βοηθώντας τους να μεγαλώσουν, δημιουργούμε στην πραγματικότητα την πορεία βιοτεχνολογίας του μέλλοντος.

Πόσο σημαντικό είναι το γεγονός ότι πολλές από τις τεχνολογίες σας είναι βασισμένες στο cloud;

Η πρόσβαση στο cloud μας επιτρέπει να κλιμακωθούμε υπολογιστικά τις ροές εργασιών που πραγματοποιούμε, καθώς και να επωφεληθούμε από την ασφαλή υποδομή. Επίσης, ως νεοσύστατη εταιρεία, η δυνατότητα να ξεκινήσουμε χωρίς την επιβάρυνση της επένδυσης σε δικά μας υλικό ήταν κρίσιμη για τη χρηματοοικονομική βιωσιμότητα στις πρώτες μας μέρες. Προβλέποντας, ενώ μεγάλο μέρος του έργου μας στην έρευνα γίνεται στο cloud, τα τελευταία δύο χρόνια έχουμε γίνει λιγότερο εξαρτημένοι από το cloud, με την δυνατότητα να τρέχουμε έργα σε μονές μηχανές. Επίσης, στοχεύουμε να υποστηρίξουμε εγκαταστάσεις cloud ιδιωτικών εγκαταστάσεων,既然 που αυτό είναι κάτι που πιστεύουμε ότι οι συνεργάτες μας θα επιθυμούσαν. Οι τεχνολογικές προόδους έχουν κάνει δυνατό να κάνουμε σε μια προσωπική λάπτοπ αυτό που χρειαζόταν πολλές μηχανές στο cloud, αλλά συνεχίζοντας να αξιοποιούμε το cloud, μπορούμε να επεκτείνουμε σημαντικά το εύρος των προβλημάτων που λύνουμε.

Η Cyclica συχνά λαμβάνει μετοχές σε εταιρείες με τις οποίες συνεργάζεται. Μπορείτε να συζητήσετε τη λογική kinh doanh πίσω από αυτό;

Οι μικρότερες εταιρείες βιοτεχνολογίας και οι ακαδημαϊκές ομάδες γενικά παραβλέπονται από την αγορά σε σχέση με τις ευκαιρίες συνεργασίας. Ενώ μπορεί να μην έχουν τους πόρους, την υποδομή ή τις εγκαταστάσεις σε σύγκριση με τις ώριμες εταιρείες φαρμάκων, οι μικρές εταιρείες βιοτεχνολογίας εισέρχονται ολοένα και περισσότερο στο προσκήνιο με μια συνδυασμένη βαθιά εξειδίκευση σε συγκεκριμένες ενδείξεις και τα οφέλη μιας λεπτής οργάνωσης που ευνοεί τη γρήγορη καινοτομία.

Αυτό μας οδήγησε να σκεφτούμε πώς μπορούμε να αλληλεπιδράσουμε με αυτές τις μικρότερες εταιρείες με μια πρωτοποριακή στρατηγική. Συνεργαζόμαστε με επιστήμονες σε ερευνητικές οργανώσεις που ενδιαφέρονται να ιδρύσουν μια εταιρεία ή πρώιμες εταιρείες βιοτεχνολογίας, και τις ενδυναμώνουμε με την πλατφόρμα ανακάλυψης φαρμάκων που ενισχύεται από την τεχνητή νοημοσύνη μας μέσω ανταλλαγών. Σε αντάλλαγμα, λαμβάνουμε μετοχές στις εταιρείες και/ή μοιραζόμαστε την ιδιοκτησία των ενώσεων και των περιουσιακών στοιχείων που δημιουργούνται και αναπτύσσονται. Βοηθώντας μια έκρηξη καινοτομίας μέσω μιας συνδυασμής δημιουργίας επιχειρήσεων και συνεργασιών, μπορούμε να κατανοήσουμε μεγαλύτερη αξία και να αναπτύξουμε μακροπρόθεσμες σχέσεις με τους συνεργάτες μας για να αντιμετωπίσουμε một φάσμα ανικανοποίητων ιατρικών αναγκών και να βελτιώσουμε τη ζωή των ασθενών.

Η EntheogeniX Biosciences είναι μια κοινή επιχείρηση μεταξύ της Cyclica και της ATAI Life Science. Τι είναι ακριβώς η EntheogeniX Biosciences;

Υπάρχει μια μοναδική ευκαιρία για καινοτομία στο τοπίο των νευροψυχιατρικών ασθενειών για να εξυπηρετήσουμε καλύτερα τους ασθενείς που πάσχουν από σύνθετες ψυχικές ασθένειες. Τα τρέχοντα φάρμακα και θεραπείες που βασίζονται σε μονό-στόχο παρεμβάσεις συχνά δεν είναι επαρκή, απαιτώντας από τους ασθενείς να λαμβάνουν πολλαπλά φάρμακα που μπορεί να παρουσιάσουν πιθανές ασφαλειακές προβλήματα, καθώς και να μειώσουν τη συμμόρφωση με τη θεραπεία. Έχουμε συνεργαστεί με την ATAI Life Science για να αξιοποιήσουμε την βαθιά εμπειρία τους στην ψυχική υγεία και τις ψυχεδελικές ουσίες, ενώ τις ενδυναμώνουμε με την πλατφόρμα ανακάλυψης φαρμάκων που ενισχύεται από την τεχνητή νοημοσύνη μας για να δημιουργήσουμε nicht μόνο νέα φάρμακα, αλλά και τα σωστά φάρμακα για να αντιμετωπίσουμε τις ψυχικές ασθένειες. Η EntheogeniX Biosciences είναι μια από τις πολλές κοινές επιχειρήσεις που έχουμε ιδρύσει και είναι ένα τεκμήριο της πίστης μας στην αλλαγή του παραδείγματος με το οποίο αντιμετωπίζονται οι ψυχικές ασθένειες, φέρνοντας την disease-αγωνιστική, robust και επιστημονικά επικυρωμένη υπολογιστική μας πλατφόρμα στα χέρια των ειδικών και των κορυφαίων επιστημόνων.

Υπάρχει κάτι άλλο που θα ήθελε να μοιραστεί σχετικά με την Cyclica;

Ενώ είμαστε πολύ ενθουσιασμένοι να μοιραστούμε την ανακοίνωση της Σειράς B χρηματοδότησής μας, είμαστε εξίσου ανυπόμονοι να μοιραστούμε την έναρξη του Προγράμματος Ακαδημαϊκής Συνεργασίας της Cyclica (CAPP) και νέες συνεργασίες τους επόμενους μήνες.

Ευχαριστώ για τη συνέντευξη. Προσβλέπω να ακολουθήσω την μελλοντική πρόοδο της Cyclica.