Συνόρων COVID-19 Open AI Consortium – Συνέντευξη με τον Δρ. Stephen Weng, Principal Investigator

Το Covid-19 Open AI Consortium (COAI) έχει ως στόχο να φέρει επαναστατικές ιατρικές ανακαλύψεις και δράσιμα ευρήματα στον αγώνα κατά της πανδημίας του Covid-19.

Το COAI στοχεύει στην αύξηση της συνεργατικής έρευνας, για να επιταχύνει την κλινική ανάπτυξη αποτελεσματικών θεραπειών για το Covid-19, και να μοιράζεται όλα τα ευρήματά του με τη διεθνή ιατρική και επιστημονική κοινότητα. Το COAI θα ενωθεί συνεργάτες: ακαδημαϊκά ιδρύματα, ερευνητές, επιστήμονες δεδομένων και βιομηχανικούς συνεργάτες, για να πολεμήσει την πανδημία του Covid-19.

Αυτή είναι η δεύτερη από τις τρεις συνεντεύξεις με τους principales ηγέτες πίσω από το COAI. Η πρώτη συνέντευξη ήταν με τον Owkin’s Sanjay Budhdeo, MD, Business Development.

Ο Stephen Weng είναι Επίκουρος Καθηγητής Επεξεργασίας Επιδημιολογίας και Επιστήμης Δεδομένων που ηγείται της έρευνας επιστήμης δεδομένων εντός της Ομάδας Έρευνας Ιατρικής Πρωτοβάθμιας Φροντίδας.

Ενσωματώνει παραδοσιακές επιδημιολογικές μεθόδους και μελέτη σχεδιασμού με νέες προσεγγίσεις βασισμένες σε πληροφορίες, αξιοποιώντας και διερευνώντας “μεγάλα δεδομένα υγείας” από ηλεκτρονικά ιατρικά αρχεία για τον σκοπό της μοντελοποίησης προβλέψεων κινδύνου, φαινοτυπικής χρονικής νόσου, έρευνας μεθόδων επιστήμης δεδομένων και μετάφρασης της στρωματοποιημένης ιατρικής στην πρωτοβάθμια φροντίδα.

Πρόσφατα εντάχθητε στο COVID-19 Open AI Consortium (COAI) ως Principal Investigator. Μπορείτε να συζητήσετε τι σας κίνησε να ενταχθείτε σε αυτό το πρόγραμμα;

Έχω συνεργαστεί με την Owkin και τους Ευρωπαίους συνεργάτες σε έργα που στοχεύουν στην βελτίωση της δευτεροβάθμιας πρόληψης για το οξύ συνδρομό σύνδρομο για το τελευταίο χρόνο. Όταν η Owkin εξέδωσε το COVID-19 Open AI Consortium για να αξιοποιήσει την τεχνολογία, την εμπειρία και την υποδομή μας για να συμβάλλει στον παγκόσμιο αγώνα κατά του COVID-19, αυτό ήταν μια φυσική επιλογή και μια φυσική ταύτιση για να ενταχθώ στην κοινοπραξία. Έχουμε εξαιρετικούς συνεργάτες που είναι οι ηγέτες καρδιολόγων σε όλη την Ευρώπη μεταξύ της ομάδας ερευνητών μας από τις προηγούμενες κοινοπραξίες. Χρησιμοποιώντας αυτές τις πηγές και την εμπειρία, μπορούμε να προχωρήσουμε πολύ γρήγορα και σε ένα ρυθμό να εξαπολύσουμε αυτήν την κοινοπραξία μέσα σε quelques εβδομάδες και τελικά να βελτιώσουμε την κατανόησή μας για την πρόοδο της νόσου, την υποκείμενη αιτιολογία και τους παράγοντες κινδύνου στις πληθυσμούς μας.

Μια ποσοστό του πληθυσμού που πλήττεται από το COVID-19 δείχνει σημάδια καρδιακής βλάβης. Ποιοι τύποι καρδιακών προβλημάτων παρατηρούνται;

Υπάρχουν ενδείξεις που αναφύονται ότι οι καρδιακοί παράγοντες κινδύνου και η καρδιακή νόσος είναι ένας σημαντικός συντελεστής στη σοβαρότητα της νόσου. Μια πρόσφατη ανάλυση 17000 περιπτώσεων COVID-19 που απαιτούσαν νοσηλεία στο Ηνωμένο Βασίλειο ανίχνευσε ότι η καρδιακή νόσος ήταν παρόντα στο 29% όλων των περιπτώσεων που νοσηλεύτηκαν. Οι υποκείμενοι καρδιακοί παράγοντες κινδύνου, συμπεριλαμβανομένης της αυξανόμενης ηλικίας, της υψηλής αρτηριακής πιέσεως, της παχυσαρκίας, της υπέρτασης και του διαβήτη τύπου 2, συμβάλλουν σημαντικά στη σοβαρότητα της νόσου.

Πιστεύετε ότι έχουμε τώρα κάποια κατανόηση για το γιατί το COVID-19 προκαλεί αυτό το είδος καρδιακής βλάβης;

Υπάρχουν ακόμη πολλά ερωτήματα που πρέπει να απαντηθούν γύρω από την επιδημιολογία γύρω από την πρόοδο και τη σοβαρότητα του COVID-19, ιδιαίτερα όσον αφορά τους ασθενείς με καρδιακή νόσο. Οι ασθενείς με καρδιακή νόσο είναι σε αυξημένο κίνδυνο να υποστούν σοβαρή ασθένεια που μπορεί να απαιτήσει καρδιοαναπνευστική υποστήριξη σε μονάδα εντατικής θεραπείας. Η σοβαρότητα του COVID-19 και η πρόοδος προς σοβαρά αποτελέσματα είναι πιθανό να οδηγούνται από κάποια άμεση βλάβη στο καρδιακό σύστημα, η οποία μπορεί να είναι οξεία. Ο ακριβής τύπος καρδιακής βλάβης στους ασθενείς με COVID-19 απαιτεί περαιτέρω διερεύνηση.

Τι θα είναι ο ρόλος σας με το COAI;

Είμαι επιδημιολόγος και επιστήμονας δεδομένων με ερευνητικό ενδιαφέρον για την πρόγνωση καρδιακών αποτελεσμάτων. Πολύ από το έργο μου είναι μια βαθιά διείσδυση σε πολύ μεγάλες βάσεις δεδομένων για να απαντήσω σε αυτά τα κλινικά ερωτήματα. Στο ρόλο μου, καθώς και να απαντήσω trực tiếp σε κάποια από αυτά τα σημαντικά ερευνητικά ερωτήματα αξιοποιώντας την ικανότητά μου ναเข┐ccess μεγάλες πληθυσμιακές βάσεις δεδομένων, επίσης προσπαθώ να διευκολύνω άλλους ακαδημαϊκούς και συναδέλφους να συμβάλλουν στην κοινοπραξία μας.

Τι είδους άνθρωποι χρειαζόμαστε να ενταχθούν στο πρόγραμμα COAI για να μεγιστοποιήσουμε την αποτελεσματικότητά του;

Όχι μόνο είναι σημαντικό να αποκτήσουμε μεγαλύτερο αριθμό επιστημόνων και κλινικών συναδέλφων που συμβάλλουν δεδομένα, αλλά επίσης χρειαζόμαστε να αυξήσουμε την ποικιλία των πηγών δεδομένων μας. Ξέρουμε ότι το COVID-19 έχει ένα ευρύ φάσμα σοβαρότητας από ασυμπτωματικούς ατόμων έως πολύ σοβαρή ασθένεια που οδηγεί στο θάνατο. Διαφορετικά είδη δεδομένων σε όλο το φάσμα των ιατρικών ρυθμίσεων από την πρωτοβάθμια έως τη δευτεροβάθμια φροντίδα είναι απαραίτητα για να απαντήσουμε σε αυτά τα ερωτήματα σχετικά με την πρόοδο και τη σοβαρότητα της νόσου.

Είστε τώρα Επίκουρος Καθηγητής Επεξεργασίας Επιδημιολογίας και Επιστήμης Δεδομένων που ηγείται της έρευνας επιστήμης δεδομένων εντός της Ομάδας Έρευνας Ιατρικής Πρωτοβάθμιας Φροντίδας του Πανεπιστημίου του Νότιγχαμ. Μπορείτε να συζητήσετε πιθανές τρόπους που τα μεγάλα δεδομένα μπορούν να χρησιμοποιηθούν για να στοχεύσουν το COVID-19 με τις τρέχουσες πληροφορίες που έχουμε;

Έχουμε κάποιες μεγάλες βάσεις δεδομένων που μπορούμε να αξιοποιήσουμε. Οι σημαντικές νίκες έχουν γίνει με τις πρόσφατες επενδύσεις σε συνδέσεις δεδομένων που έχουν πραγματοποιηθεί και αρχίζουμε να βλέπουμε αυτά τα πρωτοβουλία να φέρνουν μεγάλα αποτελέσματα. Πράγματι, αρχίζουμε να αποκτάμε πρόσβαση σε μεγάλες πληθυσμιακές κοόρτες που έχουν τώρα συνδεθεί με πρωτοβάθμια φροντίδα, νοσοκομειακά αρχεία, μητρώα θανάτου και δεδομένα δοκιμών COVID-19. Επιπλέον, αυτά τα δεδομένα έχουν ευκαιρίες να διερευνήσουν τις γενετικές επιρροές στα αποτελέσματα του COVID-19. Αυτές οι συνδέσεις είναι δυνατές μόνο με την άνοδο των συνδέσεων μεγάλων δεδομένων και των μεγάλων πληθυσμιακών βιοϊατρικών τραπεζών. Λόγω του μεγέθους των δεδομένων και των μεταβλητών που συλλέγονται, τα μοντέλα AI που έχει αναπτύξει η Owkin είναι πραγματικά πολύ χρήσιμα για να αναλύσουν τα δεδομένα με ταχύτητα και να εξαγάγουν σημαντικές πληροφορίες.

Τι είδους πληροφορίες χρειαζόμαστε να συλλέξουμε για να κάνουμε την ακριβή ιατρική ένα αποτελεσματικό εργαλείο για την θεραπεία των ασθενών με COVID-19;

Περισσότερη ποικιλία τύπων δεδομένων, συμπεριλαμβανομένων εικόνων, γενετικών, βιοδείκτών μαζί με κλινικές λειτουργίες και δημογραφικά χαρακτηριστικά ασθενών.

Σε ένα ιδανικό κόσμο, ποιοι τύποι δεδομένων πρέπει να συλλεχθούν από τους ασθενείς με COVID-19;

Σε μια τόσο νέα νόσο όπως το COVID-19, δεν νομίζω ότι υπάρχει και πρέπει να υπάρχει ένα μέγιστο όριο δεδομένων που χρειαζόμαστε. Υπάρχει ένας όρος “δεν ξέρουμε τι δεν ξέρουμε ακόμη”,所以 το περισσότερο είδη δεδομένων και πληροφορίες που μπορούμε να συλλέξουμε τώρα μπορεί να είναι χρήσιμες στο μέλλον. Για παράδειγμα, πόσες γενομικές προόδους γνώσης έχουμε βιώσει επειδή μπορούμε να διαβάζουμε δεδομένα και να τα διατηρούμε προσβάσιμα για ερευνητές σε βιοϊατρικές τράπεζες; Βλέπω αυτό να συμβαίνει με το COVID-19. Αν δημιουργήσουμε μια ποικιλόμορφη και μεγάλη πηγή δεδομένων τώρα, δεν έχω αμφιβολία ότι θα υπάρξουν νέες ανακαλύψεις που θα μας βοηθήσουν στην κατανόηση στο μέλλον.

Πρέπει επίσης να συλλέγουμε δεδομένα από το τμήμα του πληθυσμού που είναι ανοσοποιημένος στο COVID-19, για να κατανοήσουμε καλύτερα τι τους κάνει ανοσοποιημένους;

Στην επιδημιολογία, η επιλογή της ομάδας σύγκρισης είναι εξαιρετικά σημαντική. Ο κίνδυνος σε πολλούς συνδέσμους είναι σχετικός. Αν η βάση μας αρχίζει με εισαγωγή στο νοσοκομείο, τότε κατανοούμε μόνο την αιτιολογία της νόσου σε εκείνους που παρουσιάζουν πιο σοβαρά συμπτώματα. Νομίζω ότι μια καλύτερη κατανόηση των ασυμπτωματικών ατόμων και τι τους κάνει ασυμπτωματικούς προς το COVID-19 είναι απολύτως απαραίτητη. Πόσες θεραπείες αναπτύσσονται λόγω της διερεύνησης της λειτουργίας γονιδίων ή της απώλειας λειτουργίας γονιδίων που φυσικά συμβαίνουν σε πληθυσμούς.

Ευχαριστώ για την φανταστική συνέντευξη. Οι αναγνώστες που επιθυμούν να μάθουν περισσότερα, μπορούν να διαβάσουν το άρθρο μας που περιγράφει το πρόγραμμα COAI.

Η πρώτη συνέντευξη σε αυτήν την σειρά ήταν με Owkin’s Sanjay Budhdeo, MD, Business Development.

Η τρίτη συνέντευξη σε αυτήν την σειρά ήταν με Folkert W. Asselbergs, Principal Investigator

Μπορείτε επίσης να επισκεφθείτε την ιστοσελίδα του Covid-19 Open AI Consortium.