Συνόρων COVID-19 Open AI Consortium – Συνέντευξη με τον Δρ. Stephen Weng, Principal Investigator

Το Συνόρων COVID-19 Open AI Consortium (COAI) έχει ως στόχο να φέρει επαναστατικές ιατρικές ανακαλύψεις και δράσιμες ανακαλύψεις στον αγώνα κατά της πανδημίας COVID-19.

Το COAI στοχεύει στην αύξηση της συνεργατικής έρευνας, για να επιταχύνει την κλινική ανάπτυξη αποτελεσματικών θεραπειών για την COVID-19, και να μοιράζεται όλα τα ευρήματά του με την παγκόσμια ιατρική και επιστημονική κοινότητα. Το COAI θα ενωθεί συνεργάτες: ακαδημαϊκά ιδρύματα, ερευνητές, επιστήμονες δεδομένων και βιομηχανικούς συνεργάτες, για να πολεμήσει την πανδημία COVID-19.

Αυτή είναι η δεύτερη από τρεις συνεντεύξεις με τους principales ηγέτες πίσω από το COAI. Η πρώτη συνέντευξη ήταν με τον Owkin’s Sanjay Budhdeo, MD, Business Development.

Stephen Weng είναι Αναπληρωτής Καθηγητής Ενοποιημένης Επιδημιολογίας και Επιστήμης Δεδομένων που ηγείται της έρευνας επιστήμης δεδομένων εντός της Ομάδας Έρευνας Ιατρικής Πρωτοβάθμιας Φροντίδας Stratified Medicine.

Ενσωματώνει παραδοσιακές επιδημιολογικές μεθόδους και σχεδιασμό μελέτης με νέες προσεγγίσεις βασισμένες σε πληροφορίες, αξιοποιώντας και εξετάζοντας “μεγάλα δεδομένα υγείας” από ηλεκτρονικά ιατρικά αρχεία για τον σκοπό της πρόβλεψης κινδύνου, φαινοτυπικής χαρτογράφησης χρονίων νοσημάτων, έρευνας μεθόδων επιστήμης δεδομένων και μετάφρασης της στρατηγικής ιατρικής στην πρωτοβάθμια φροντίδα.

Πρόσφατα εντάχθητε στο COVID-19 Open AI Consortium (COAI) ως Principal Investigator. Μπορείτε να συζητήσετε τι σας ώθησε να ενταχθείτε σε αυτό το πρόγραμμα;

Έχω συνεργαστεί με την Owkin και Ευρωπαίους συνεργάτες σε έργα που στοχεύουν στην βελτίωση της δευτεροβάθμιας πρόληψης για οξείες συνδρόμους στεφανιαίας νόσου κατά το τελευταίο χρόνο. Όταν η Owkin ξεκίνησε το COVID-19 Open AI Consortium για να αξιοποιήσει την τεχνολογία, την εμπειρία και την υποδομή μας για να συμβάλλουμε στον παγκόσμιο αγώνα κατά της COVID-19, αυτό ήταν μια φυσική επιλογή και μια φυσική ευκαιρία να ενταχθώ στο συνδικάτο. Έχουμε εξαιρετικούς συνεργάτες που είναι πρωτοπόροι καρδιολόγοι σε όλη την Ευρώπη μεταξύ της ομάδας ερευνητών μας από τα προηγούμενα συνδικάτα. Χρησιμοποιώντας αυτές τις πηγές και την εμπειρία, μπορούμε να προχωρήσουμε πολύ γρήγορα και με ταχύτητα για να ξεκινήσουμε αυτό το συνδικάτο μέσα σε vài εβδομάδες και τελικά να βελτιώσουμε την κατανόηση της εξέλιξης της νόσου, της υποκείμενης αιτιολογίας και των παραγόντων κινδύνου στις πληθυσμούς μας.

Ένα ποσοστό του πληθυσμού που είναι προσβεβλημένο από την COVID-19 παρουσιάζει σημάδια καρδιακής βλάβης. Ποιοι τύποι καρδιακών προβλημάτων παρατηρούνται;

Υπάρχουν ενδείξεις ότι οι καρδιακοί παράγοντες κινδύνου και η καρδιακή νόσος είναι σημαντικοί συντελεστές στη σοβαρότητα της νόσου. Μια πρόσφατη ανάλυση 17000 περιπτώσεων COVID-19 που απαιτούσαν νοσηλεία στο Ηνωμένο Βασίλειο ανέφερε ότι η καρδιακή νόσος ήταν παρόντος στο 29% όλων των περιπτώσεων που νοσηλεύτηκαν. Οι υποκείμενοι παράγοντες κινδύνου, συμπεριλαμβανομένης της αυξανόμενης ηλικίας, της υψηλής αρτηριακής πίεσης, της παχυσαρκίας, της υπέρτασης και του διαβήτη τύπου 2, συνεισφέρουν σημαντικά στη σοβαρότητα της νόσου.

Πιστεύετε ότι έχουμε τώρα μια κατανόηση του γιατί η COVID-19 προκαλεί αυτό το είδος καρδιακής βλάβης;

Υπάρχουν ακόμη πολλές ερωτήσεις που πρέπει να απαντηθούν σχετικά με την επιδημιολογία της εξέλιξης και της σοβαρότητας της COVID-19, ιδιαίτερα σε σχέση με ασθενείς με καρδιακή νόσο. Οι ασθενείς με καρδιακή νόσο είναι σε αυξημένο κίνδυνο να υποφέρουν από σοβαρή νόσο που μπορεί να απαιτήσει καρδιοαναπνευστική υποστήριξη σε μονάδα εντατικής θεραπείας. Η σοβαρότητα της COVID-19 και η εξέλιξη προς σοβαρές επιπτώσεις είναι πιθανό να οδηγούνται από κάποια άμεση βλάβη στο καρδιακό σύστημα, η οποία μπορεί να είναι οξεία. Ο ακριβής τύπος καρδιακής βλάβης στους ασθενείς με COVID-19 απαιτεί περαιτέρω έρευνα.

Τι θα είναι ο ρόλος σας στο COAI;

Είμαι επιδημιολόγος και επιστήμονας δεδομένων με ερευνητικό ενδιαφέρον στην πρόγνωση των καρδιακών αποτελεσμάτων. Πολύ από την εργασία μου είναι μια βαθιά ενασχόληση με πολύ μεγάλες βάσεις δεδομένων για να απαντήσω σε αυτά τα κλινικά ερωτήματα. Στο ρόλο μου, καθώς και στην προσπάθεια να απαντήσω σε κάποια από αυτά τα σημαντικά ερευνητικά ερωτήματα αξιοποιώντας την ικανότητά μου να προσεγγίσω μεγάλες πληθυσμιακές βάσεις δεδομένων, επίσης προσπαθώ να διευκολύνω άλλους ακαδημαϊκούς και συναδέλφους να συνεισφέρουν στο συνδικάτο μας.

Τι είδους άνθρωποι χρειαζόμαστε να ενταχθούν στο πρόγραμμα COAI για να μεγιστοποιήσουμε την αποτελεσματικότητά του;

Δεν είναι μόνο σημαντικό να αποκτήσουμε μεγαλύτερο αριθμό επιστημόνων και κλινικών συναδέλφων που συμβάλλουν δεδομένα, αλλά επίσης χρειαζόμαστε να αυξήσουμε την ποικιλία των πηγών δεδομένων μας. Ξέρουμε ότι η COVID-19 έχει ένα ευρύ φάσμα σοβαρότητας από ασυμπτωματικούς ατόμων έως πολύ σοβαρή νόσο που οδηγεί στο θάνατο. Διαφορετικά είδη δεδομένων σε όλο το φάσμα των ιατρικών ρυθμίσεων από την πρωτοβάθμια έως τη δευτεροβάθμια φροντίδα είναι απαραίτητα για να απαντήσουμε σε αυτά τα ερωτήματα σχετικά με την εξέλιξη και τη σοβαρότητα της νόσου.

Είστε τώρα Αναπληρωτής Καθηγητής Ενοποιημένης Επιδημιολογίας και Επιστήμης Δεδομένων που ηγείται της έρευνας επιστήμης δεδομένων εντός της Ομάδας Έρευνας Ιατρικής Πρωτοβάθμιας Φροντίδας Stratified Medicine. Μπορείτε να συζητήσετε πιθανές τρόπους με τους οποίους τα μεγάλα δεδομένα μπορούν να χρησιμοποιηθούν για να στοχεύσουν την COVID-19 με τις τρέχουσες πληροφορίες που έχουμε;

Έχουμε κάποιες μεγάλες βάσεις δεδομένων που μπορούμε να αξιοποιήσουμε. Οι σημαντικές επιτυχίες έχουν ήταν πρόσφατες επενδύσεις σε σύνδεση δεδομένων που έχουν πραγματοποιηθεί και αρχίζουμε να βλέπουμε αυτές τις πρωτοβουλίες να φέρνουν σημαντικά αποτελέσματα. Πράγματι, αρχίζουμε να αποκτάμε πρόσβαση σε μεγάλες πληθυσμιακές κοόρτες που έχουν συνδεθεί με πρωτοβάθμια φροντίδα, νοσοκομειακά αρχεία, μητρώα θανάτου και δεδομένα ελέγχου COVID-19. Επιπλέον, αυτά τα δεδομένα έχουν ευκαιρίες να ερευνήσουν τις γενετικές επιρροές στα αποτελέσματα COVID-19. Αυτές οι συνδέσεις είναι δυνατές μόνο με την άνοδο των μεγάλων συνδέσεων δεδομένων και των μεγάλων πληθυσμιακών βιοτράπεζων. Λόγω του μεγέθους των δεδομένων και των μεταβλητών που συλλέγονται, τα μοντέλα AI που έχει αναπτύξει η Owkin είναι πραγματικά χρήσιμα για την αποτελεσματική ανάλυση δεδομένων με ταχύτητα για να εξαγάγουν σημαντικές πληροφορίες.

Τι είδους πληροφορίες χρειαζόμαστε να συλλέξουμε για να κάνουμε την ιατρική ακρίβειας ένα αποτελεσματικό εργαλείο για την αντιμετώπιση ασθενών με COVID-19;

Περισσότερο διαφορετικό είδος τύπων δεδομένων, συμπεριλαμβανομένων εικόνων, γενετικών δεδομένων, βιοδεικτών μαζί με κλινικές λειτουργίες και δημογραφικά στοιχεία ασθενών.

Σε ένα ιδανικό κόσμο, ποιο είδος δεδομένων θα πρέπει να συλλεχθεί από ασθενείς με COVID-19;

Σε μια τόσο νέα νόσο όπως η COVID-19, δεν νομίζω ότι υπάρχει και θα πρέπει να υπάρχει ένα μέγιστο όριο δεδομένων που χρειαζόμαστε. Υπάρχει ένας όρος “δεν ξέρουμε τι δεν ξέρουμε ακόμη”, οπότε περισσότερα είδη δεδομένων και πληροφορίες που μπορούμε να συλλέξουμε τώρα θα είναι μπορεί να είναι χρήσιμα στο μέλλον. Για παράδειγμα, πόσες γονιδιακές προόδους γνώσης έχουμε βιώσει επειδή μπορούμε να ακολουθούμε δεδομένα και να τα κρατάμε προσβάσιμα για ερευνητές σε βιοτράπεζες; Βλέπω αυτό να συμβαίνει με την COVID-19. Αν δημιουργήσουμε μια ποικιλόμορφη και μεγάλη πηγή δεδομένων τώρα, δεν έχω αμφιβολία ότι θα υπάρξουν νέες ανακαλύψεις που θα μας βοηθήσουν να κατανοήσουμε καλύτερα στο μέλλον.

Θα πρέπει επίσης να συλλέξουμε δεδομένα από το τμήμα του πληθυσμού που είναι ανοσικός στην COVID-19, για να κατανοήσουμε καλύτερα τι τους κάνει ανοσικούς;

Στην επιδημιολογία, η επιλογή της ομάδας σύγκρισης είναι εξαιρετικά σημαντική. Ο κίνδυνος σε πολλές περιπτώσεις είναι σχετικός. Αν η βάση μας αρχίζει με εισαγωγή στο νοσοκομείο, τότε κατανοούμε μόνο την αιτιολογία της νόσου σε εκείνους που παρουσιάζουν πιο σοβαρά συμπτώματα. Νομίζω ότι μια καλύτερη κατανόηση των ασυμπτωματικών ατόμων και τι τους κάνει ασυμπτωματικούς για την COVID-19 είναι απολύτως απαραίτητη. Πόσα θεραπευτικά έχουν αναπτυχθεί λόγω της έρευνας των γανο chức ή απώλειας λειτουργίας που φυσικά συμβαίνουν σε πληθυσμούς.

Ευχαριστούμε για την εξαιρετική συνέντευξη. Οι αναγνώστες που επιθυμούν να μάθουν περισσότερα, μπορούν να διαβάσουν το άρθρο μας που περιγράφει το πρόγραμμα COAI.

Η πρώτη συνέντευξη σε αυτή τη σειρά ήταν με Owkin’s Sanjay Budhdeo, MD, Business Development.

Η τρίτη συνέντευξη σε αυτή τη σειρά ήταν με Folkert W. Asselbergs, Principal Investigator

Μπορείτε επίσης να επισκεφτείτε την ιστοσελίδα του Συνόρων COVID-19 Open AI Consortium.