أنثروبيك تُعلن عن تحسين كلود لأكثر من 30 نموذجًا بيوجزيئيًا مفتوح المصدر

نشرت أنثروبيك منشور بحثي في 17 سبتمبر 2026، مُبلِّغَةً أن كلود قام بتحسين أكثر من 30 نموذجًا بيوجزيئيًا مفتوح المصدر في أقل من أربعة أسابيع، وقالت الشركة إن ذلك أسرع النماذج بنحو 4 أضعاف في المتوسط. وفرت أنثروبيك الشيفرة المُحسَّنة كمصدر مفتوح وأعلنت عن مسابقة لتصميم البروتين برعاية مشتركة مع Adaptyv Bio.

36 حزمة محسّنة ونوى FlashPairformer

وفقًا لمنشور البحث وتقرير مرفق تقرير تقني، أنتج نموذج بحث داخلي عام الاستخدام حزمًا محسّنة لـ 36 تنفيذًا للنماذج تغطي أكثر من 30 نموذجًا مفتوح المصدر عبر ست عائلات: الطي المشترك وتنبؤ الهيكل (14 حزمة)، والهلوسة (3)، وتوليد الهيكل (6)، والطي العكسي (3)، وعلم الجينوم (7)، ونماذج لغة البروتين (3). صرّح Anthropic أن Claude كان تحت إشراف عضوين أساسًا من طاقمها الفني يمتلكان خبرة في نمذجة الجزيئات الحيوية ولكن لا أحد في تحسين الاستدلال أو هندسة النواة.

تعمل كل حزمة باستخدام أوزان النموذج الأصلية وتوفر حتى ثلاثة أوضاع: الوضع Exact، المصمم لإعادة إنتاج مخرجات النموذج غير المعدَّل بتفصيلها؛ الوضع Fast، الذي يبادل قليلًا من الدقة العددية مقابل السرعة؛ والوضع Big، الذي يقلل من استهلاك الذاكرة بحيث تتسع المدخلات الأكبر لذاكرة وحدة معالجة الرسوميات. يذكر التقرير أن الوضع Exact نفّذ المرور الأمامي لـ 14 نموذجًا لتنبؤ البنية أسرع بمتوسط 1.6 مرة مقارنة بالنماذج غير المعدَّلة على وحدات NVIDIA H100، وأن الوضع Fast نفّذ الـ 13 نموذجًا التي تدعمه أسرع بمتوسط 4.1 مرة، وأن الوضع Big كان أسرع بمتوسط 3.4 مرة.

تقضي نماذج تنبؤ البنية الحديثة مثل AlphaFold3 وOpenFold3 وBoltz-2 جزءًا كبيرًا من وقت تشغيلها وذاكرتها على عمليات الانتباه الثلاثي والضرب الثلاثي، وهما عمليتان تكلفتهما تكعيبية بالنسبة لعدد الرموز. طورت NVIDIA نوى مخصصة لهذه العمليات، أولاً في cuEquivariance ومؤخرًا في BioNeMo Inference Runtime. ولحل عنق الزجاجة نفسه، طوّر كلود FlashPairformer v1، مجموعة من نوى GPU المخصصة. يذكر التقرير أن FlashPairformer v1 نفّذ الانتباه الثلاثي أسرع بـ 2.7 مرة مقارنةً بالنوى القياسية في المجال عند عرض الزوج 128، المستخدمة من قبل AlphaFold3 وBoltz-2، وأسرع بـ 2.9 مرة عند عرض الزوج 256، المستخدمة من قبل Protenix v2، مع الضرب الثلاثي أسرع بـ 1.7 و3.2 مرة على التوالي، مقاسًا على وحدة NVIDIA H100 واحدة.

إلى جانب النوى المشتركة، أنتج كلود تحسينات خاصة بكل نموذج، تشمل تخزين الوسائط الوسيطة التي يعيد الكود الأصلي حسابها، وتثبيت الفروع ذات المخرجات الثابتة، والتقاط رسومات CUDA، ودمج النوى. يذكر التقرير أن تسريعات الوضع Fast لنماذج تنبؤ البنية تراوحت من 2.3 مرة لنموذج OpenDDE إلى 6.4 مرة لنموذج Chai-1، وأن نماذج علم الجينوم ونماذج لغة البروتين حققت زيادة من 1.2 إلى 5.0 مرة في الوضع Exact.

فيما يتعلق بالدقة، يذكر التقرير أنه عبر FoldBench-Lite، وهو معيار موحد يضم 1,925 زوجًا من النموذج والهدف عبر 13 تكوينًا للنماذج، كانت نسبة الواجهات المتوقعة بشكل مقبول 54.8٪ في الوضع الافتراضي مقابل 55.0٪ في الوضع Exact، و54.5٪ في الوضع Fast، و54.2٪ في الوضع Big، دون أي تغيير ملحوظ يختلف عن الصفر. تشمل القيود المذكورة القياسات التي أُجريت فقط على وحدات H100 GPU، وتسريعات ColabFold التي قُست مقارنةً بالإصدار 1.6.1 قبل أن يصدر المشروع نواه المدمجة الخاصة به، واستخدام الوضعين Exact وFast لذاكرة تصل إلى 3.2 مرة أكثر من الوضع الافتراضي.

الوضع Big للأنظمة البيوجزيئية الضخمة

قالت أنثروبيك إن وضع Big منخفض الذاكرة يتيح نمذجة دقيقة للأنظمة البيوجزيئية التي تتجاوز 10,000 رمز (أحماض أمينية، نوكليوتيدات، وذرات من جزيئات صغيرة وأيونات) وإجراء استدلال على الأنظمة التي تتجاوز 70,000 رمز، جميعها على عقدة GPU NVIDIA واحدة، وهو ما وصفه المنشور بأنه مهمة كانت غير قابلة للوصول سابقًا. تشمل الآلات الجزيئية التي تم توقعها بدقة في وضع Big مجمع الميتوكوندريا البشري I، ومجمع المساعد TRiC، والبروتيازوم، والريبوسوم البكتيري 70S، كل منها يطابق هيكله التجريبي عن كثب مع درجات TM تتراوح بين 0.92 و0.997، وفقًا للتقرير. وأشارت أنثروبيك إلى أن هذه، حسب علمها، من بين أكبر الهياكل التي تم طيّها بدقة باستخدام نماذج تنبؤ البنية؛ ويلاحظ التقرير أن ورقة AlphaFold3 سلطت الضوء على توقع ريبوسوم 40S بدقة يضم 7,663 رمزًا وأن AlphaFold3 تم تدريبه على قصاصات لا تتجاوز 768 رمزًا.

لاختبار حدود التحسينات، نفّذ كلود تنبؤ البنية على أغلفة فيروسية كاملة وحواجز بروتينية تتراوح تقريبًا بين 31,000 و أكثر من 70,000 بقايا باستخدام عقدة واحدة من ثمانية وحدات B300 GPU. أُكملت جميع الجولات السبعة، لكن كل توقع انهار إلى كرة مدمجة، مع درجات TM تتراوح بين 0.08 و0.14 حيث تم قياسها. يفرض التقرير أن هذا الانهيار يعكس فشلًا في التعميم، لأن التجميعات أكبر بـ 40 إلى 90 مرة من أكبر قصاصة تدريبية لـ AlphaFold3، ويصوّر النتيجة على أنها توسيع لما يمكن حسابه بدلاً مما تعلمته النماذج.

تصميم الروابط على وحدة GPU واحدة

في عمل أنثروبيك السابق لتصميم الحامل، كان كلود يعمل من موجه يضم تقريبًا 16,000 كلمة، يستخدم وكلاء فرعيين، وكان يمكنه إنفاق ما يصل إلى 10,000 دولار لكل هدف على منصة البنية التحتية للذكاء الاصطناعي Modal، أي ما يعادل حوالي 2,500 ساعة من وحدات معالجة الرسوميات H100، خلال 24 ساعة. في الإعداد الجديد، تلقى نموذج كلود واحد بطاقة NVIDIA H200 ووحدة زمنية قدرها 24 ساعة، وعمل من موجه يضم حوالي 1,100 كلمة، دون وكلاء فرعيين ولا توجيه بشري. تم تشغيل ثلاثة نماذج، Mythos 5.1 و Mythos 5 و Opus 5، كلٌ منها ضد 16 هدفًا من الدراسة السابقة.

يذكر التقرير أن المتوسط الوسيط للدرجات على ipSAE، وهو مقياس محاكاة حاسوبي يصفه بأنه تنبؤي للارتباط التجريبي، وصل إلى 0.785 لنموذج Opus 5، و0.781 لنموذج Mythos 5.1، و0.739 لنموذج Mythos 5، مقارنةً بـ 0.749 للحملات السابقة، مع درجات تصميمية قصوى بلغت 0.833 و0.825 و0.813 مقابل 0.817. استخدمت عمليات التشغيل على وحدة معالجة رسومية واحدة ميزانية GPU أصغر بحوالي 100 مرة، وتذكر المقالة أن إنفاقًا إجماليًا يقارب 150 دولارًا على وحدات GPU والرموز حقق أداءً محاكًا يطابق الحملات السابقة. يوضح التقرير أن التصاميم الناتجة عن هذه العمليات لم تُختبر تجريبيًا وأن الدرجات هي قياسات محاكاة حاسوبية، وليست نتائج تجريبية.

شروط الإصدار المفتوح المصدر

أصدرت أنثروبيك الشيفرة في GitHub repository عام يحتوي على 36 مجموعة تحسين جاهزة، واحدة لكل أداة أصلية، مع الشيفرة الأصلية تحت رخصة Apache 2.0؛ تم الالتزام بالإصدار العام الأول في 17 سبتمبر 2026. تشترك المجموعات في مفردات وضعية “off” و”exact” و”fast” و”big” موحدة، ومُهيأة لتعمل على وحدات NVIDIA H100 بسعة 80 جيجابايت على نظام Linux x86‑64، مع بعض المجموعات التي تُوزع أيضًا تكوينات A100 أو H200 أو B200 أو B300. يذكر المستودع أن الإصدار هو إصدار مرجعي غير مُصان ولا يقبل مساهمات، وأن صور Docker وApptainer المسبقة البناء مخطط لها خلال أسبوع من الإصدار الأول.

مسابقة تصميم البروتين مع Adaptyv Bio

قالت أنثروبيك إنها وAdaptyv Bio اختارتا خمس مشكلات تقع على حدود قدرات تصميم البروتين الحالية، بما في ذلك التفاعل المتقاطع بين الأنواع، والحساسية للرقم الهيدروجيني، وتحديدية الببتيد‑MHC، بالإضافة إلى أهداف صعبة مثل مستقبلات GPCR. وفقًا لـ competition page، ترعى المنظمتان معًا تمويلًا بقيمة 1 مليون دولار للتحقق التجريبي لاختبار أكثر من 5,000 تصميم بروتيني في مختبر Adaptyv الآلي دون تكلفة على المشاركين، وتوفر أنثروبيك ائتمانات إضافية بقيمة 1 مليون دولار لاستخدام كلود. تشير منشورة أنثروبيك إلى أن Modal ستوفر ائتمانات حوسبة تصل إلى 250,000 دولار، وأن Twist Bioscience ستوفر DNA للمسابقة.

تُقدَّم ثلاث مسارات مشاركة: مختبرات البحث والشركات، مع ائتمانات كلود تصل إلى 50,000 دولار للفرق الأكاديمية و25,000 دولار للفرق الصناعية، تقريبًا 20 فريقًا يُختار، وحجز اختبار مختبري لما يصل إلى حوالي 18 تصميمًا لكل تحدٍ؛ باحثون أفراد أو فرق من ثلاثة أشخاص، يحصلون على وصول مجاني إلى Claude Max 20x خلال المسابقة؛ ومسار مفتوح ذاتي الدعم يكون فيه استخدام كلود اختياريًا.

تجري طلبات المشاركة من 16 سبتمبر إلى 24 سبتمبر 2026، وسيتم إبلاغ الفرق المختارة قبل 28 سبتمبر 2026. تُجرى خمس تحديات أسبوعية من 28 سبتمبر إلى 31 أكتوبر 2026، ومن المقرر إكمال التحقق التجريبي بحلول 30 نوفمبر 2026، وستُنشر النتائج على Proteinbase في 15 ديسمبر 2026. يحتفظ المشاركون بملكية تصاميمهم، وستُنشر جميع النتائج التجريبية بما فيها النتائج السلبية علنًا، ولا توجد جائزة مالية؛ وتصف الصفحة الجدول الزمني بأنه مخطط وقابل للتغيير.