Phylo’nun Target Atlas’ı AI ajanlarını ilaç hedefi önceliklendirmesine getiriyor

Phylo, 29 Eylül 2026’da Target Atlas’ı başlattı; şirketin Biomni Lab platformu üzerine inşa edilmiş bir ajan tabanlı hedef önceliklendirme uygulaması; ücretsiz bir kamu sürümü ve Michael J. Fox Vakfı ile geliştirilen Parkinson hastalığına yönelik ilk hastalığa özgü sürümü bulunuyor.

Target Atlas Nasıl Çalışır

Phylo, uygulamanın hedef incelemelerinin arkasındaki kanıt toplama süresini bilim insanı ekiplerinin aylarca süren çalışmalarından günlere indirebileceğini söyledi. Sistem, bulguları kaynaklarına bağlayan ortak bir kayıt oluşturur ve yeni araştırmalar ortaya çıktıkça güncellenebilir. AI ajanları, hedefler arasında tutarlı analizler uygular; bilim insanları ise hangi kanıtların önemli olduğunu ve ne kadar ağırlık taşıması gerektiğini belirler. Ekipler, bu ağırlıkları değiştirerek kendi kriterlerinin sıralamaları nasıl etkilediğini görebilir.

Kamu sürümü, bir Biomni hesabı ile ücretsizdir ve binlerce hedef‑hastalık değerlendirmesini kapsar; bunlar kaynak‑bağlantılı hedef profilleri ve etkileşimli 2×2 grafikler aracılığıyla sunulur. Şirkete göre, yüzlerce AI ajanı temel kanıtları derleyip sentezlemektedir. Hastalıklar arasında, sürümlenmiş hesaplamalı beceriler, veritabanları, makaleler ve hastalık veri setlerinden gelen kanıtları panolara ve kaynak‑bağlantılı profillere dönüştürür; bu profiller her öğenin kaynağını, tarihini, kapsama alanını ve eksikliklerini kaydeder. Araştırmacılar, her sonucun arkasındaki kanıtları inceleyebilir ve kanıtları keşfetmek ya da özel görünümleri düzenlemek için bir sohbet arayüzü kullanabilir.

Uygulamanın Arkasındaki Atıfta Bulunan Kanıtlar

Duyuru, ürünü yayımlanmış ilaç geliştirme başarısızlık istatistiklerine dayandırıyor. Hay ve çalışma arkadaşlarının 2014 yılında Nature Biotechnology dergisinde yayınladığı analizde, klinik geliştirmeye giren ilaç programlarının yaklaşık onda birinin onaylandığı ve Minikel ve çalışma arkadaşlarının 2024 yılında Nature dergisinde yayınladığı çalışmada, insan genetik desteği olan ilaç mekanizmalarının Faz 1’den onaya kadar %2.6 daha yüksek başarı olasılığı taşıdığı belirtiliyor. Basın açıklamasına göre, hedef seçimi, bir ilaç programını değiştirmek için en erken ve en düşük maliyetli noktalardan biri ve aynı zamanda en maliyetli hatalardan biridir; ancak iyi bir seçim yapmak için gereken kanıtlar genetik, ekspresyon, klinik aktivite, güvenlik, işlenebilirlik, biyobelirteçler, rekabet ve literatür gibi alanlarda dağınıktır ve sürekli değişmektedir.

The Michael J. Fox Foundation Parkinson’s Sürümü

Target Atlas’ın ilk hastalığa özgü uygulaması, vakfın Targets to Therapies (T2T) Girişimi ile geliştirilen bir Parkinson sürümüdür; bu girişim, topluluk adaylıkları, uzman panelleri, derlenmiş skor kartları ve yayımlanmış bir metodoloji aracılığıyla şeffaf bir Parkinson hedef önceliklendirme çerçevesi oluşturmuştur. Phylo, bu sürümün uzman çerçevesini açıkça keşfedilebilir kıldığını ve yeni kanıtlar ortaya çıktıkça yenilenebilen kaynak‑bağlantılı analizlere bağladığını söyledi. Temel metodoloji, Vaiana ve çalışma arkadaşları tarafından 2025’te npj Parkinson’s Disease dergisinde yayımlandı.

vakfın girişim sayfası‘a göre, T2T 2024’ün başlarında, yeni Parkinson tedavileri için en büyük potansiyele sahip hedeflerin hangileri olduğuna dair bilim topluluğunun bir anketiyle başlatıldı. 290’dan fazla hedef değerlendirildi ve önümüzdeki iki‑üç yıl içinde darboğazları aşma uygulanabilirliğine dayanarak 21’i aday gösterildi. Girişimi üç bilimsel çekirdek destekliyor: önceliklendirme ve seçim, doğrulama ve araç takımı geliştirme, ve bir kamu bilgi tabanı. Vakıf, seçilen hedefleri gelecekteki ilaç geliştirme için mekanistik olarak doğrulamak amacıyla araştırma ekiplerine fon sağlar ve tüm öğrenimler ve araçlar ortak bilgi tabanı aracılığıyla ücretsiz olarak sunulur. Sayfa, Parkinson için klinik test aşamasında zaten tedavileri bulunan hedefler olarak alfa‑sinüklein, GBA1 ve LRRK2’yi listeler ve ilk seçim turunun hastalığın ilerlemesini yavaşlatma veya değiştirme potansiyeline sahip hedeflere odaklandığını belirtir.

“İyi tanımlanmış, ilaçlanabilir hedeflerin sayısını artırmak, bulmacanın kritik bir parçasıdır,” dedi Gaia Skibinski, The Michael J. Fox Foundation for Parkinson’s Research’te VP ve translasyonel terapötikler başkanı, başlatma duyurusu‘nda. Vakıf, Target Atlas gibi ortaya çıkan AI araçlarının araştırmacıların umut vaat eden hedefleri potansiyel yeni Parkinson tedavilerine yönlendirmesine nasıl yardımcı olabileceğini keşfetmeyi dört gözle beklediğini belirtti.

Kurumsal Sürüm, Genişleme Planları ve Kullanılabilirlik

Target Atlas’ın kurumsal sürümü, yönetilen bir Biomni dağıtımı için yıllık lisansla sunulmakta ve seçilen her hastalık başına 20.000’den fazla hedef, özel veri entegrasyonu, hedef‑çift panoları ve AI/ML tabanlı puanlamayı desteklemektedir.

Phylo, zaman içinde kamu sürümünü tüm büyük hastalıklara genişletmeyi planladığını ve ek hastalık sürümlerini topluluklarına ücretsiz olarak yayımlamak üzere bu sürümleri sponsor edecek vakıflar, konsorsiyumlar ve hasta örgütleri aradığını, her kuruluşun çerçevesinin puanlamada temsil edileceğini söyledi. Şirketin kurucu ortağı ve CEO’su Kexin Huang, T2T iş birliğinin, ajanların bir topluluğun aylarca elle işlediği kanıtları gün içinde derleyip puanlayabildiğini, güncel tutabildiğini ve bu süreci, hangi kanıtların önemli olduğuna karar veren uzman yargıyı yerine koymadan gerçekleştirebildiğini gösterdiğini belirtti. Huang, şirketin amacının modeli her büyük hastalığa getirmek olduğunu söyledi.

Phylo, Biomni Lab’ı ilk Entegre Biyoloji Ortamı olarak tanımlıyor; bilim insanlarının literatür araştırması, deney tasarımı, biyolojik veri analizi ve bilimsel karar verme süreçlerinde AI ajanlarıyla iş birliği yaptığı birleşik bir çalışma alanı ve platformun Chugai Pharmaceutical ve Ono Pharmaceutical dahil olmak üzere biyofarmasötik şirketler tarafından kullanıldığını belirtti. Şirket, South San Francisco’da konumlanıyor ve Andreessen Horowitz ve Menlo Ventures’ Anthology Fund tarafından ortaklıkla yönetilen 13,5 milyon dolarlık bir tohum turu topladı Anthropic.

Target Atlas, MJFF Parkinson’s sürümü dahil, biomni.phylo.bio adresinde mevcuttur. R&D liderleri bir kurumsal demo talep edebilir ve vakıflar ile konsorsiyumlar bir hastalık sürümünü sponsor etmeyi contact@phylo.bio üzerinden tartışabilir.