COVID-19 Açık AI Konsorsiyumu – Dr. Stephen Weng ile Röportaj, Baş Araştırıcı

COVID-19 Açık AI Konsorsiyumu (COAI), COVID-19 salgınına karşı mücadelede çığır açan tıbbi keşifler ve eyleme geçirilebilir bulgular getirmeyi amaçlıyor.

COAI, işbirlikçi araştırmaları artırmayı, COVID-19 için etkili tedavilerin klinik gelişimini hızlandırmayı ve tüm bulgularını küresel tıbbi ve bilimsel topluluğa paylaşmayı hedefliyor. COAI, akademik kurumlar, araştırmacılar, veri bilimcileri ve endüstri ortaklarını bir araya getirerek COVID-19 salgınını mücadele edecek.

Bu, COAI’nin arkasındaki ana liderlerle yapılan üç röportajın ikincisidir. İlk röportaj, Owkin’in Sanjay Budhdeo, MD, İş Geliştirme ile yapılmıştı.

Stephen Weng, Veri Biliminde Araştırma Odaklı bir Epidemiyoloji Profesörüdür ve Primary Care Stratified Medicine Araştırma Grubu bünyesindeki veri bilimi araştırmalarını yönetiyor.

Geleneksel epidemiyolojik yöntemleri ve çalışma tasarımlarını yeni bilgi işlem tabanlı yaklaşımlarla birleştirerek, elektronik sağlık kayıtlarından “büyük sağlık verileri”ni kullanarak risk öngörüsü modellemesi, kronik hastalıkların fenotiplenmesi, veri bilimi yöntemleri araştırmaları ve stratifye edilmiş tıbbın birincil bakımına çevirisi için çalışıyor.

Son olarak COVID-19 Açık AI Konsorsiyumu’na (COAI) baş araştırmacı olarak katıldınız. Bu projeye katılma kararınızı neler etkiledi?

Geçtiğimiz yıl Owkin ve Avrupa ortaklarıyla birlikte akut koroner sendrom için ikincil önleme yönelik projelerde işbirliği içindeydim. Owkin, COVID-19 Açık AI Konsorsiyumu’nu teknolojileri, uzmanlıkları ve altyapımızı kullanarak küresel COVID-19 mücadelesine katkıda bulunmak için başlattığında, bu projeye katılma kararı doğal bir seçim oldu. Geçmişteki konsorsiyumlarımızda Avrupa’nın önde gelen kardiyologlarından oluşan bir araştırmacı grubumuz vardı. Bu kaynakları ve uzmanlıkları kullanarak hızlı bir şekilde hareket edebildik ve birkaç hafta içinde konsorsiyumu başlatabildik. Böylece hastalığın ilerlemesi, altta yatan nedenleri ve risk faktörlerini daha iyi anlayabileceğiz.

COVID-19’a yakalanan nüfusun bir yüzdesi kalp hasarı belirtileri gösteriyor. Görülen kalp ile ilgili sorunlar neler?

Kalp hastalığı ve kalp damar risk faktörlerinin COVID-19’un ciddiyetine önemli katkıda bulunduğu evidence ortaya çıkıyor. İngiltere’de hastaneye yatış gerektiren 17.000 COVID-19 vakasının analizi, hastaneye yatış gereken tüm vakaların %29’unda kalp hastalığının mevcut olduğunu gösterdi. Artan yaş, yüksek tansiyon, obezite, hipertansiyon ve tip 2 diyabet gibi temel kalp damar risk faktörleri hastalığın ciddiyetine önemli katkıda bulunuyor.

COVID-19’un bu tür kalp hasarına neden olduğu konusunda herhangi bir anlayışa sahip olduğunuzu düşünüyor musunuz?

COVID-19’un epidemiyolojisi, özellikle kalp hastalığı olan hastalar açısından, hala birçok cevapsız soru içeriyor. Kalp hastalığı olan hastalar, yoğun bakım ünitesinde kalp solunum desteği gerektirebilecek ciddi hastalık riski altında bulunuyor. COVID-19’un ciddiyeti ve şiddetli sonuçlara doğru ilerlemesi, muhtemelen kalp damar sistemine doğrudan bir hasar sonucu oluşuyor. COVID-19 hastalarında görülen kalp hasarının tam türü daha fazla araştırma gerektiriyor.

COAI’deki rolünüz ne olacak?

Ben bir epidemiyolog ve veri bilimcıyım ve kalp damar sonuçlarının prognozuna odaklanan bir araştırma uzmanı olarak çalışıyorum. Büyük veri kümelerine derinlemesine dalış yaparak bu klinik soruları cevaplamaya çalışıyorum. Rolüm, sadece bu önemli araştırma sorularını cevaplamak için büyük nüfus veri kümelerine erişimimi kullanmak değil, aynı zamanda diğer akademisyen ve meslektaşların konsorsiyuma katkıda bulunmalarını kolaylaştırmak.

COAI projesinin etkinliğini maksimize etmek için hangi tür insanlara ihtiyacımız var?

Veri kaynaklarımızın çeşitliliğini artırmak ve daha fazla bilim insanı ve klinik çalışandan veri toplamak önemlidir. COVID-19’un geniş bir hastalık şiddeti spektrumuna sahip olduğunu biliyoruz, yani asemptomatik bireylerden çok ciddi hastalığa kadar değişen bir spektrum. Sağlık bakım ayarlarındaki farklı türlerde veri toplamak, hastalığın ilerlemesi ve ciddiyeti hakkında soruları cevaplamak için gereklidir.

Şu anda Nottingham Üniversitesi’nin Birincil Bakım Stratifye Edilmiş Tıp Araştırma Grubu’nda Veri Bilimi Araştırma Lideri olarak görev yapıyorsunuz. Büyük veri nasıl COVID-19’u hedef alabilir?

Büyük veri kümelerini kullanma imkanına sahibiz. Büyük kazanım, son yatırımların veri bağlantısını gerçekten harekete geçirmesi ve bu girişimlerin büyük meyveler vermeye başladığını görmemiz. Aslında, büyük nüfus kohortlarına erişim sağlamak için çalışıyoruz ve bu kohortlar birincil bakım, hastane kayıtları, ölüm kayıtları ve COVID-19 test verilerine bağlı. Ayrıca, bu veriler COVID-19 sonuçlarındaki genetik etkileri araştırmak için fırsatlar sunuyor. Bu bağlantılar, büyük veri bağlantılarının ve büyük nüfus biyobankalarının yükselişi sayesinde mümkün oluyor. Veri miktarı ve değişkenlerin birleşmesi nedeniyle, Owkin’in geliştirdiği ve mükemmelleştirdiği AI modelleri, anlamlı içgörüler elde etmek için verileri hızlı bir şekilde analiz etmek için gerçekten faydalı.

COVID-19 hastalarını tedavi etmek için kesin tıp araçlarını etkili bir şekilde kullanmak için hangi bilgileri toplamak gerekiyor?

Daha çeşitli veri türleri, yani görüntüleme, genetik, biyobelirteçler ve klinik özellikler ile hasta demografisi.

İdeal bir dünyada, COVID-19 hastalarından hangi tür verilerin toplanması gerekiyor?

Yeni bir hastalık gibi COVID-19’da, henüz bilmediğimiz şeyler var. Daha fazla veri toplandıkça, gelecekte faydalı olabilecek bilgiler elde edebiliriz. Örneğin, genomik ilerlemeler nasıl oldu da veri dizilerini sıralayarak ve bunları araştırma için erişilebilir halde tutarak bu ilerlemeleri elde edebildik? COVID-19 için de benzer bir şey olabileceğini düşünüyorum. Eğer şimdi büyük ve çeşitli bir veri kaynağı oluşturursak, gelecekte yeni bulgular ortaya çıkacağından eminim.

COVID-19’a karşı bağışık olan nüfus segmentinden de veri toplamak gerekiyor mu?

Epidemiyolojide, karşılaştırma grubunun seçimi çok önemlidir. Risk birçok anlamda görecelidir. Eğer temel çerçevemiz hastaneye yatış ise, o zaman sadece daha ciddi semptomlar gösteren hastaları anlıyoruz. COVID-19’a karşı asemptomatik bireyleri ve bunları asemptomatik yapan şeyleri anlamak kesinlikle gerekli.

Harika bir röportaj için teşekkür ederiz. Daha fazla bilgi edinmek isteyen okuyucular, COAI projesini anlatan makalemizi okuyabilir.

Bu serideki ilk röportaj, Owkin’in Sanjay Budhdeo, MD, İş Geliştirme ile yapıldı.

Serideki üçüncü röportaj, Folkert W. Asselbergs, Baş Araştırmacı ile yapıldı.

COVID-19 Açık AI Konsorsiyumu web sitesini de ziyaret edebilirsiniz.