BioNTech ve InstaDeep, COVID Çeşitleri için Erken Uyarı Tespit Sistemini Geliştirdi

İmmünoterapi şirketi BioNTech (BNTX ) ve AI şirketi InstaDeep, SARS-CoV-2’nin yüksek riskli varyantlarını tahmin etmek için dünya çapındaki dizileme verilerini analiz eden yeni bir hesaplamalı yöntem geliştirdi. Erken Uyarı Sistemi (EWS), AI hesaplanan immün kaçış ve fitness ölçümlerini kullanıyor.

Yüksek Riskli Varyantların Tespiti

Viral Spike proteinin yapısal modellemesini ve AI algoritmasını birleştirerek, yöntem SARS-CoV-2 dizileme veri depolarına girilen potansiyel yüksek riskli varyantları nhanh bir şekilde tespit edebiliyor. Bunu bir gün içinde yapabiliyor ve şirketler, oluşturulan ve halka açık veriler kullanarak tahminleri doğrulayabiliyor.

Sistem, ortalama iki ay önce Dünya Sağlık Örgütü (WHO) tarafından belirlenen varyantların %90’ından fazlasını tespit etti. Alfa, Beta, Gamma, Theta, Eta ve Omicron varyantları için, EWS aynı hafta içinde dizileme verilerini ilk kez yükledi.

Yeni çalışma, EWS’nin yeni varyantları birkaç dakika içinde değerlendirebileceğini ve yeni varyant verilerinin yayınlanmasıyla tamamen ölçeklenebilir olduğunu gösteriyor.

BioNTech ve InstaDeep

Ugur Sahin, M.D., BioNTech’in CEO’su ve kurucu ortağı.

“Son aylarda geliştirdiğimiz gelişmiş hesaplamalı yöntemlerle, Spike proteinin dizileme bilgilerini analiz edebiliyor ve yeni varyantları predicted immün kaçış ve ACE2 bağlama puanına göre sıralayabiliyoruz” dedi Sahin. “Potansiyel yüksek riskli varyantların erken uyarısı, araştırmacılara, aşı geliştiricilerine, sağlık yetkililerine ve politika yapıcılara etkili bir araç olabilir ve yeni varyantlara tepki verme için daha fazla zaman sağlayabilir.”

Karim Beguir, InstaDeep’in kurucu ortağı ve CEO’su.

“Her hafta 10.000’den fazla yeni varyant dizileme verisi keşfediliyor ve insan uzmanlar bu kadar karmaşık veriyi işleyemez. Bu zorluğu, InstaDeep’in DeepChain platformunun güçlü AI yeteneklerini BioNTech’in SARS-CoV-2 bilgisi ve teknolojisıyla birleştirerek çözdük. İlk kez, yüksek riskli varyantlar yerinde tespit edilebilir ve bu, aylarca değerli zaman kazanılabilir. Araştırma çalışmamızı halka açık olarak sunuyoruz ve continued gerçek dünya etkisine katkıda bulunmaktan memnunuz” dedi Beguir.

11 aylık bir dönemde, EWS, WHO tarafından belirlenen varyantları belirlenmeyenlerden ayırt edebildi.

Yeni geliştirilen sistem, BioNTech ve InstaDeep’in AI ve immünolojiyi birleştirmeye devam ettiği bir dönemde geliyor. İki şirket, Kasım 2020’den beri birlikte çalışıyor. Londra, UK ve Mainz, Almanya’da ortak bir AI inovasyon laboratuvarı kurdular. Laboratuvar, yeni ilaç keşfi ve tasarımı, protein mühendisliği, üretim ve tedarik zinciri optimizasyonunu ilerletmeyi amaçlıyor.