Biostate AI kerää 12 miljoonan dollarin rahoituksen A-sarjasta molekyylilääketieteen ChatGPT:n kouluttamiseen

Biostate AI, molekyylidiagnostiikkaan erikoistunut startup, joka yhdistää seuraavan sukupolven RNA-sequencingin (RNAseq) generatiiviseen tekoälyyn, ilmoitti tänään keränneensä 12 miljoonan dollarin A-sarjan rahoituksen, jonka johtajana toimi Accel. Rahoituksessa osallistuivat myös Gaingels, Mana Ventures, InfoEdge Ventures ja palanneet sijoittajat Matter Venture Partners, Vision Plus Capital ja Catapult Ventures. Tunnettuja enkeleisijoittajia, kuten Anthropicin toimitusjohtaja Dario Amodei, 10x Genomicsin CTO Mike Schnall-Levin ja Twist Biosciencen toimitusjohtaja Emily Leproust, tukivat myös yritystä. (TXG ) (TWST )

Uusi rahoitus tukee Biostaten kunnianhimoista tavoitetta: tehdä biologia ennustettavaksi ja avaaminen tarkkuuslääketiede laajassa mittakaavassa. Samoin kuin OpenAI koulutti ChatGPT:ä triljoonilla sanalla ymmärtämään ihmisen kieltä, Biostate kouluttaa perusmalleja miljardeilla RNA-ekspressioprofiileilla oppiakseen “molekyylisen kielen” ihmisen taudin.

Netflix-malli molekyylilääketieteelle

Startup, jonka perustivat MIT:n ja Riven professorit, joista tuli yrittäjiä, Ashwin Gopinath ja David Zhang, näkee uuden paradigman diagnostiikalle. Sen sijaan, että tarjotaan erillisiä sekvensointipalveluita, Biostate käyttää Netflix (NFLX ) -inspiroimaa itse ylläpitävää liiketoimintamallia: yritys prosessoi tuhansia RNA-näytteitä erittäin alhaisella kustannuksella, syöttää tiedot omaan generatiiviseen tekoälyjärjestelmään ja parantaa mallejaan jokaisen kokeen kanssa. Tuloksena on hyvä kehä – edullinen sekvensointi mahdollistaa paremmat mallit, ja paremmat mallit tarjoavat syvemmän kliinisen näkemyksen.

“Jokainen diagnostiikka, jonka olen rakentanut, on ollut siitä, että vastaus siirretään lähemmäs potilasta,” sanoi Zhang, Biostate AI:n toimitusjohtaja. “Biostate tekee suurimman loikan koskaan ja tekee koko transkriptomin affordabeliksi.”

Transkriptomi – täydellinen joukko RNA-molekyylejä solussa – tarjoaa ajantasaisia kuvia ihmisen terveydestä ja sairauksista. Historiallisesti kuitenkin täydellinen transkriptomi-sekvensointi on ollut esteettä ja vaikeasti tulkittavissa. Biostate ratkaisee molemmat ongelmat kaksinkertaisella lähestymistavalla: radikaalilla kustannusvähennyksellä ja älykkäällä tekoälyllä.

Teknologiset innovaatiot: BIRT, PERD ja generatiivinen tekoäly

Biostaten tarjoaman ytimessä ovat kaksi patentoidua teknologiaa: BIRT (Biostate Integrated RNAseq Technology) ja PERD (Probabilistic Expression Reduction Deconvolution). BIRT on moniplexausprotokolla, joka mahdollistaa samanaikaisen RNA-eristämisen ja sekvensoinnin useista näytteistä, mikä vähentää kustannuksia lähes kymmenkertaisesti. PERD soveltaa uusia algoritmeja suodattamaan “erävaikutukset” – vaihtelua, joka johtuu laboratorio-olosuhteiden tai näytteen käsittelyn eroista – jotka usein peittävät biologisen signaalin monisite-tutkimuksissa.

Tämä erittäin standardoitu RNAseq-pipeline syötetään Biostaten omaan perusmalliin, Biobase, joka toimii samalla tavalla kuin GPT-mallit luonnollisen kielen prosessoinnissa. Koulutettu satojen tuhansien transkriptomisten profiilien yli kudostyypeissä, tautitiloissa ja lajeissa, Biobase ottaa kiinni “biologian kieliopista” – perustavista kuvausmallista, jotka määrittävät terveyden ja sairauden.

Samoin kuin GPT voidaan hienosäätää kirjoittamaan esseitä tai tiivistämään oikeudellisia asiakirjoja, Biobase voidaan sovittaa havaitsemaan varhaisen syövän toistumista, ennustamaan lääkevastetta autoimmuunisairauksissa tai stratifioimaan potilaita sydän- ja verisuonitutkimuksissa. Biostaten Prognosis AI, joka on rakennettu Biobasen päälle, näyttää jo lupaavaa tuloksia leukemia-toipumisen ennustamisessa ja pilotoi useita skleroosia Accelerated Cure Projectin kanssa.

“Samoin kuin ChatGPT muutti kielen ymmärtämisen oppimalla triljoonilla sanalla, me opimme molekyylisen kielen ihmisen taudista miljardeilla RNA-ekspressioista,” sanoi Gopinath, yrityksen CTO. “Me teemme molekyylilääketieteelle saman, mitä suuret kielimallit tekivät tekstille – skaalataan raakadata, jotta algoritmit voivat lopulta loistaa.”

Rakentamassa maailman suurinta RNAseq-tietokantaa

Toistaiseksi Biostate on jo sekvensoinut yli 10 000 näytettä yli 150 yhteistyökumppanin kanssa, mukaan lukien Cornell ja muut suuret instituutit. Sen tavoitteena on kasvattaa tämä määrä satoihin tuhansiin näytteisiin vuosittain. Tämä eksponentiaalinen kasvu on mahdollista sen alhaisen kustannuksen RNA-sekvensointiprosessin ja virtausdatan syöttökanavan, OmicsWebin, ansiosta, joka standardisoi, merkitsee ja tallentaa transkriptomiset tiedot turvallisesti eri jurisdiktioiden yli.

Yrityksen pilvi-infraan kuuluu useita uusia GenAI-työkaluja, kuten:

• OmicsWeb Copilot – Luonnollinen kieli-rajapinta RNAseq-tietojen analysointiin ilman koodia.

• QuantaQuill – Tekoälyavustaja, joka luo julkaisuvalmiit tieteelliset artikkelit, mukaan lukien kuvat ja viitteet.

• Embedding Surfer – Visualisointityökalu, joka paljastaa piilevät biologiset suhteet geeniekspressiotiedoissa.

Toimistoillaan Houstonissa, Palo Altossa, Bangaloresissa ja Shanghaissa Biostate laajentaa maailmanlaajuisesti tukemaan kasvavaa verkostoa kliinisiä ja akateemisia kumppaneita. Startup on jo prosessoimassa sekä tuoreita että vuosikymmeninä vanhoja kudoksenäytteitä – auttaen laboratorioita saamaan irti aiemmin käyttökelvottomista näytteistä.

Kohti yleispätevää tekoälyä kaikille sairauksille

Biostaten lopullinen tavoite on rohkea: luoda yleispätevä tekoäly, joka voi ymmärtää ja ohjata hoitoa kaikkien ihmisten sairauksien yli. Tämä yhdistävä lähestymistapa on vastakohtainen nykyiselle fragmentoituun biotekniikkamaailmalle, jossa jokainen tila usein vaatii oman erillisen diagnostiikkatyökalun ja hoitopolun.

“Sen sijaan, että ratkaistaisiin diagnostiikkaa ja hoitoa erillisinä, eristyneinä ongelmina kullekin sairaudelle, uskomme, että moderni ja tuleva tekoäly voi olla yleispätevä ymmärtääkseen ja auttaakseen parantamaan jokaisen sairauden,” sanoi Zhang.

Käsittämällä biologian generatiivisena järjestelmänä – jossa nykyinen molekyylitila määrää huomisen tulokset – Biostate uskoo, että se voi ennustaa ei vain nykyistä terveydentilaa, vaan myös tulevia sairauden polkuja ja optimaalisia interventioita.

Mitä seuraavaksi?

Yli 20 miljoonan dollarin rahoituksella ja nopeasti kasvavalla asiakasliittymällä Biostate kiihdyttää kliinisiä yhteistyöjä onkologiassa, sydän- ja verisuonitautien hoidossa ja immunologiassa. Yrityksen seuraavat merkkipaaluksi sisältävät sääntelyviranomaisten validoinnin ennustavista malleista ja tekoälypohjaisten diagnostiikkatyökalujen kaupallisen skaalautumisen.

Kuten Gopinath toteaa: “Emme ainoastaan tulkitse biologiaa. Rakennamme biologisen vastineen suurelle kielimallille – tällä kertaa se on koulutettu ihmisen keholle.”

Jos Biostate AI onnistuu, seuraava aalto tarkkuuslääketieteessä ei ole vain reaktiivinen – se on ennustettava, henkilökohtainen ja tekoälyllä ajettu.